Ključna razlika – Metabolomika vs Metabonomika
Metaboliti su mali molekuli uključeni u metaboličke reakcije u ćelijama. Metaboliti uključuju metaboličke intermedijere, hormone, sekundarne metabolite, signalne molekule, itd. Oni su funkcionalni molekuli biohemijskih reakcija ćelija. Kompletan skup metabolita biološkog uzorka ili jednog organizma poznat je kao metabolom. Metabolome je dinamička kolekcija koja se mijenja svake sekunde u tijelu. Metabolomika i metabonomika su dva pojma povezana sa proučavanjem metaboloma organizma. Ključna razlika između metabolomike i metabonomike je u tome što je metabolomika više zabrinuta za normalan endogeni metabolizam i metaboličko profiliranje na ćelijskom ili organskom nivou, dok se metabonomija više bavi proširenjem metaboličkog profiliranja informacijama o poremećajima metabolizma uzrokovanim faktorima okoline, bolestima, crijevima. mikroorganizama i poređenje metaboličkog profilisanja, itd. Metabolomika je uglavnom vođena masenom spektrometrijom, a metabonomija koristi NMR spektroskopiju za analizu metabolita.
Šta je metabolomika?
Metabolomika je proučavanje metaboličkih procesa koji se dešavaju u ćelijama, biofluidima, tkivima ili organizmima. Uključuje identifikaciju i kvantifikaciju ćelijskih metabolita koristeći dobre analitičke i statističke alate. Metabolomika se smatra važnom studijom jer otkriva informacije o metabolizmu organizma.
Za proučavanje supstrata i proizvoda metaboličkih reakcija, metabolomika koristi masenu spektrometriju kao analitičku platformu. Masena spektrometrija otkriva vrste metabolita i njihove koncentracije, odražavajući stvarno biohemijsko stanje ćelija ili tkiva. Stoga se metabolomika može smatrati najboljim predstavnikom molekularnog fenotipa organizma. Metabolomika je omska tehnologija malih molekula organizama iu poređenju sa drugim omskim studijama; metabolomika je veoma važna jer direktno odražava trenutno stanje biohemijske reakcije ćelija.
Metabolomika se takođe može smatrati produžetkom proteomike jer nastaje zbog aktivnosti enzima koji su proteini kao što je prikazano na sljedećoj slici.
Slika 01: Šema metabolizma
Šta je metabonomija?
Metabonomija je definirana kao kvantitativno mjerenje multiparametarskih metaboličkih odgovora u određeno vrijeme u odnosu na patofiziološke stresove ili genetsku modifikaciju. Ovo se obično primjenjuje na studije o ljudskoj ishrani i odgovorima na lijekove ili bolesti. Ovaj pristup je bio pionir Jeremyja Nicholsona na Imperial Collegeu u Londonu i korišten je u brojnim poljima uključujući toksikologiju, dijagnozu bolesti, ishranu, itd. Istorijski gledano, metabonomija je bila jedna od prvih metoda za primjenu opsega sistemske biologije na studije metabolizma.
Metabonomics je više zabrinut za poređenje biohemijskih profila, a ne za identifikaciju pojedinačnih metaboličkih spojeva u metabolomici. Stoga se metabonomija može definirati kao podskup metabolomike. Uglavnom se naglašava poređenje metaboličkih profila različitih populacija s obzirom na bolesti, stresove okoline, genetsku modifikaciju, ishranu, lijekove itd. jer su metaboliti dobri markeri koji signaliziraju stanja bolesti, efekte lijekova, stresove iz okoline, izloženost toksinima, itd.
Metabonomske studije otkrivaju i intracelularne i ekstracelularne metabolite. Koristi tehnike visoke propusnosti za analizu ogromnog broja metabolita istovremeno i uzastopno, omogućavajući vremensko ispitivanje fiziološkog statusa ćelija. Također otkriva korelaciju između metabolita i patološkog statusa organizma. Za podršku metabonomskim studijama, genomika i proteomika se mogu koristiti jer su međusobno povezane kao što je prikazano na gornjoj slici.
Koja je razlika između metabolomike i metabonomije?
Metabolomika vs Metabonomika |
|
| Metabolomika je proučavanje kompletnog skupa metabolita organizma | Metabonomija je kvantitativna studija multiparametarskih metaboličkih odgovora živih sistema na vremenskoj osnovi na patofiziološke stimuluse ili genetske modifikacije. |
| Glavna briga | |
| Metabolomika se više bavi metaboličkim profiliranjem i identifikacijom pojedinačnih metabolita prisutnih u ćelijama. | Metabonomija se više bavi poređenjem metabolita ili metaboličkih profila populacije u odnosu na genetske modifikacije, bolesti, stres iz okoline, patološke stimuluse, lijekove, itd. |
| Informacije | |
| Metabolomika je uglavnom fokusirana na endogeni metabolizam. | Metabonomika nije ograničena na endogeni metabolizam. Proširuje se na pronalaženje informacija o poremećajima metabolizma uzrokovanim unutarnjim i vanjskim faktorima kao što su načini ishrane, toksini, procesi bolesti, itd. |
| Analitički alati | |
| Koristi masenu spektrometriju kao glavnu analitičku platformu | Metabonomika koristi NMR spektroskopiju kao glavnu analitičku platformu. |
Sažetak – Metabolomika vs Metabonomika
Metabolom predstavlja kompletan skup malih molekula zvanih metaboliti prisutnih u ćeliji ili organizmu. Metabolomika je proučavanje cijelog metaboloma za stvaranje metaboličkog profila. Metabolomika omogućava naučnicima da izmjere stvarni fiziološki status ćelije ili organizma. Metabonomika je dio metabolomike koji se proteže na izdvajanje informacija o multiparametarskim metaboličkim odgovorima živih sistema na patofiziološke stimuluse i genetske modifikacije. Metabonomija se ne bavi samo individualnim metaboličkim profilisanjem kao što je metabolomika; upoređuje metaboličke profile u odnosu na druge faktore kao što su stresovi iz okoline, bolesti, toksini, itd. I metabolomika i metabonomija uključuju proučavanje metabolita organizama za mjerenje stvarnog fiziološkog statusa ćelija. Stoga se ponekad ova dva smatraju sinonimima, ne uzimajući u obzir razliku između metabolomike i metabonomije.
