Ključna razlika između proteomike i metabolomike je u tome što je proteomika proučavanje svih proteina organizma, dok je metabolomika proučavanje svih metabolita organizma.
Genomika je proučavanje genetskog sastava organizma. Proteomika i metabolomika su dvije omske nauke povezane s genomikom. Proteom se odnosi na sve proteine u ćeliji ili organizmu. Metabolom se, s druge strane, odnosi na sve metabolite organizma. Dakle, proučavanje proteoma je proteomika, dok je proučavanje metaboloma metabolomika. I proteomika i metabolomika su važne u dijagnostici bolesti i u karakterizaciji i skriningu organizama. Štaviše, oba su povezana u mnogim aspektima ćelijske biologije, posebno u ćelijskoj signalizaciji, degradaciji i stvaranju proteina i post-translacijskoj modifikaciji.
Šta je proteomika?
Proteom je ukupni proteinski komplementar u ćeliji, tkivu ili organizmu. Stoga je proteomika proučavanje proteoma organizma. U proteomici se analiziraju različite karakteristike proteina. Stoga se proteomika uglavnom fokusira na strukturu, orijentaciju, funkcije, interakcije proteina, modifikacije, primjene i važnost proteina. Zbog toga se trenutno provode mnogi istraživački projekti u oblasti proteomike.
Prve proteomske studije su urađene da bi se utvrdio sadržaj proteina u Escherichia coli. Mapiranje ukupnog sadržaja proteina urađeno je korištenjem dvodimenzionalnih (2D) gelova. Nakon uspjeha ovog projekta, naučnici su prešli na karakterizaciju ukupnog sadržaja proteina kod životinja kao što su zamorci i miševi. Trenutno se mapiranje humanih proteina vrši pomoću 2D gel elektroforeze.
Postoje mnoge prednosti proučavanja proteomike jer su proteini upravljački molekuli najveće aktivnosti zbog svojstva katalizatora proteina. Dakle, proučavanje cjelovitih proteina može pružiti informacije o zdravstvenom stanju organizma. Štaviše, proteomika ima mnoge primjene u označavanju genoma, identifikaciji bolesti i dijagnostici, izvođenju studija ekspresije proteina tokom eksperimentiranja i modifikacija proteina i studija interakcija, itd.
Slika 01: Proteomika
Postoje različite tehnike uključene u proteomiku, uključujući ekstrakciju ukupnog proteina, njihovo odvajanje pomoću 2D gel elektroforeze, sekvencioniranje ekstrahiranih proteina korištenjem metoda kao što su Edmundova metoda sekvenciranja ili masena spektrometrija i analizu strukturnih i funkcionalnih svojstva proteina korištenjem kompjuterskog softvera i bioinformatičkih alata.
Šta je metabolomika?
Metabolomika je proučavanje svih metabolita u ćeliji, tkivu ili organizmu. Uključuje identifikaciju i kvantifikaciju ćelijskih metabolita korištenjem različitih naprednih analitičkih i statističkih alata. Metabolomika je važna studija jer otkriva informacije o metabolizmu organizma.
Slika 02: Metabolomika
Za proučavanje supstrata i proizvoda metaboličkih reakcija, metabolomika koristi masenu spektrometriju kao analitičku platformu. Masena spektrometrija daje metabolite i njihove koncentracije, odražavajući stvarno biohemijsko stanje ćelija ili tkiva. Stoga se metabolomika može smatrati najboljim prikazom molekularnog fenotipa organizma. Pored toga, metabolomika se može smatrati produžetkom proteomike jer se većina metabolita stvara zahvaljujući aktivnostima enzima koji su proteini.
Koje su sličnosti između proteomike i metabolomike?
- Proteomika i metabolomika su dvije omske nauke povezane sa genomikom.
- Metabolomika se može smatrati proširenjem proteomike.
- Proteom i metabolom su usko isprepleteni sa mnogim studijama.
Koja je razlika između proteomike i metabolomike?
Proteomika je opsežna studija proteina uključujući njihovu strukturu i funkciju, unutar ćelije ili organizma. U međuvremenu, metabolomika je proučavanje profila metabolita u ćeliji, tkivu ili organizmu pod datim skupom uslova. Dakle, ovo je ključna razlika između proteomike i metabolomike. Osim toga, proteomika se uglavnom tiče kompletnog skupa proteina, dok se metabolomika uglavnom tiče kompletnog skupa metabolita, uključujući raznovrstan niz malih molekula kao što su peptidi, ugljikohidrati, lipidi, nukleozidi i katabolički produkti egzogenih spojeva itd. Dakle, ovo je još jedna razlika između proteomike i metabolomike.
Infografika ispod sažima razliku između proteomike i metabolomike.
Sažetak – Proteomika vs Metabolomika
Živi organizmi se mogu proučavati koristeći njihov genom, proteine i metabolite. Genomika, proteomika i metabolomika su tri oblasti koje proučavaju genetski sastav, proteine i metabolite ćelije ili organizma. Proteomika je važna jer je dinamička refleksija i gena i okoline. Metabolomika je veoma važna jer direktno odražava trenutno stanje biohemijske reakcije ćelija ili metabolički status organizma. Dakle, ovo sažima razliku između proteomike i metabolomike.
