Ključna razlika između ciljane i neciljane proteomike je u tome što ciljana proteomika ima za cilj mjerenje obilja specifičnog proteina dok neciljana proteomika ne cilja na određeni protein.
Proteomika je opsežna studija proteina, njihovih struktura i funkcija. Proučava kompletan proteinski komplement u ćeliji, tkivu ili organizmu pod određenim uslovima. Postoje dvije vrste proteomike kao ciljana proteomika i neciljana proteomika.
Šta je ciljana proteomika?
Kao što joj ime kaže, ciljana proteomika cilja na određeni protein ili peptid u složenoj mješavini proteina za analizu. Zatim analizira prisustvo i količinu tog prethodno odabranog specifičnog proteina. Ova metoda je moguća za samo jedan uzorak ili za više uzoraka. Ova metoda je prikladna čak i za određenu grupu proteina. Rezultat toga su precizniji, kvantitativniji i osjetljiviji podaci. Štaviše, masena spektrometrija u kombinaciji sa ciljanom proteomikom daje preciznija pouzdana mjerenja. Ova metoda koristi trostruki kvadrupolni maseni spektrometar (QQQ) za svoju analizu.
Slika 01: Proteomika
Ciljana proteomika je prikladna metoda ako želite provjeriti da li je cilj srušenog stvarno oboren ili kada želite kvantificirati određeni protein/peptid u krvnom serumu, cerebralnoj tekućini ili u ćelijskom lizatu itd. Možete također koristite ga ako želite provjeriti da li je određeni protein različito eksprimiran u uzorcima ili tokom eksperimenta s vremenom.
Šta je neciljana proteomika?
Neciljana proteomika, kao što ime spominje, ne cilja na određeni protein ili peptid za svoju analizu. Discovery proteomics je drugo ime za neciljanu proteomiku. U stvari, to je više „globalna” analiza. Općenito, izvođenje neciljane proteomike je odgovor na pitanje "koji protein ili proteini su u ovom uzorku ili više uzoraka?". Ova metoda nije osjetljiva kao ciljana proteomika. Ali može identificirati i izmjeriti mnoge proteine uključujući nove proteine. Neciljana proteomika može proizvesti i kvantitativna i kvalitativna mjerenja.
Koje su sličnosti između ciljane i neciljane proteomike?
- I ciljana i neciljana proteomika mjeri proteine u uzorcima.
- Oni su važni u analizi proteoma.
- Ove metode koriste masenu spektrometriju.
Koja je razlika između ciljane i neciljane proteomike?
Prvo, ciljana proteomika je određivanje prisustva i količine određenog proteina ili peptida u složenoj mješavini proteina. Nasuprot tome, neciljana proteomika je kvantitativno i kvalitativno proučavanje proteina prisutnih u uzorku ili uzorcima bez ciljanja na određeni protein. Ciljana proteomika se izvodi s unaprijed odabranim ili ciljanim proteinima, dok se neciljana proteomika izvodi kako bi se otkrile vrste proteina u ovom uzorku. Štaviše, ciljana proteomika je osjetljivija od neciljane proteomike.
Sažetak – Ciljana vs neciljana proteomika
Da sumiramo, ciljana i neciljana proteomika su dvije vrste proteinskih studija. Kao što njihova imena govore, ciljana proteomika cilja na određeni protein, dok neciljana proteomika ne cilja na određeni protein. Ovo je razlika između ciljane i neciljane proteomike.
