Ključna razlika između motiva i domene je u tome što motiv nije nezavisno stabilan dok je domen nezavisno stabilan.
Proteini su važne biološke makromolekule prisutne u našem tijelu. S druge strane, genetski kod gena će odlučiti o sekvenci aminokiselina proteina. Štaviše, proteini imaju primarnu, sekundarnu i tercijarnu strukturu. Primarna struktura je aminokiselinska sekvenca polipeptidnog lanca. Kada se polipeptidni lanci presavijaju jedan s drugim, formira se sekundarna struktura proteina. Alfa spirale, beta listovi i supersekundarne strukture pripadaju sekundarnim strukturama. Određene grupe supersekundarnih elemenata poznate su kao proteinski motivi. Tercijarna struktura proteina odnosi se na njegovu trodimenzionalnu strukturu koja odlučuje o funkciji proteina. Domen je presavijeni dio proteinske molekule, koji je globularan i ima diskretnu funkciju. To je osnovna funkcionalna i trodimenzionalna struktura proteina.
Šta je motiv?
Motiv je određena grupa super sekundarnih elemenata proteina kao što su alfa spirale i beta strukture. Oni su neka vrsta uzoraka prisutnih u različitim proteinima. Motivi opisuju šare savijanja sekundarnih strukturnih elemenata i njihove interakcije. Ovi obrasci savijanja stabiliziraju se sličnim vezama koje su prisutne u tercijalnim strukturama. Međutim, one nisu tako složene kao tercijarne strukture.
Slika 01: Motiv
One su jednostavne kombinacije sekundarnih struktura proteina. Motiv sam po sebi nije postojan. Nadalje, motivi objašnjavaju strukturu proteina, ali ne predviđaju funkciju proteina. Primjeri proteinskih motiva su beta-alfa-beta motiv, grčki ključni motiv, beta bure, motiv beta meandra, itd.
Šta je domena?
Domena je osnovna, funkcionalna i trodimenzionalna jedinica proteina. Obavlja posebnu funkciju. Jedan protein može imati nekoliko različitih domena. Svaka domena je nezavisna jedinica. To je globularna struktura. Odgovoran je za određenu funkciju ili interakciju. Domeni se mogu koristiti za hipotezu o funkciji nekarakterističnog proteina. Prilikom analize proteina, bitno je uzeti u obzir pošto su domeni funkcionalne jedinice proteina.
Slika 02: Tri različite domene piruvat kinaze
Domeni su vrlo stabilne i kompaktne strukture. Lako se mogu razlikovati od drugih regija. Piruvat kinaza ima tri različita domena kao što je prikazano na slici 02. Dužina domena može varirati, a prosječna dužina je 100 aminokiselina. Svaki domen sadrži hidrofobno jezgro izgrađeno od sekundarnih strukturnih jedinica. Nekoliko domena zajedno čine tercijarnu strukturu proteina.
Koje su sličnosti između motiva i domene?
- Motiv i domen su jedinice prisutne u samim proteinskim molekulima.
- Korisni su pri klasifikaciji porodica proteina.
Koja je razlika između motiva i domene?
Motiv je određena grupa super sekundarnih elemenata proteina kao što su alfa spirale i beta strukture dok je domen funkcionalna jedinica proteina. Nadalje, motiv je sekundarna struktura, dok je domen odgovoran za tercijarnu strukturu proteina. Štaviše, domen je samostalna jedinica, za razliku od motiva. Također, domena prikazuje funkciju proteina dok motiv nije. Ovo su glavne razlike između motiva i domene. Infografika ispod prikazuje razliku između motiva i domene u tabelarnom obliku.
Sažetak – Motiv vs domen
Motiv je raspored sekundarnih struktura proteinskog molekula. Obično nije stabilan sam po sebi, za razliku od domena. Domen je nezavisna stabilna struktura proteina. Stoga, to može biti dio ili cijeli proteinski molekul. To je trodimenzionalna osnovna funkcionalna jedinica proteina. Štaviše, ima funkciju i nezavisna je jedinica. Motiv može biti dio domene. Ali domen ne može biti dio motiva. Ovo je razlika između motiva i domene.
