Ključna razlika između izošizomera i neošizomera je u tome što su izošizomeri restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja i cijepaju DNK na istim pozicijama, dok su neošizomeri restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama.
Restrikcioni enzimi ili restrikcijske endonukleaze su enzimi koji cijepaju DNK na fragmente na ili blizu specifičnih mjesta prepoznavanja. Rezali su DNK na restrikcijskim mjestima. Restrikcioni enzimi se obično klasifikuju u pet grupa na osnovu strukture, da li preseku svoj DNK supstrat na mestu prepoznavanja i da li su mesta prepoznavanja i cepanja odvojena jedno od drugog. Već je identificirano više od 3600 restrikcijskih endonukleaza. Približno 800 restrikcijskih enzima je dostupno komercijalno. Izošizomeri i neošizomeri su dvije vrste restrikcijskih enzima zasnovanih na mjestu prepoznavanja i specifičnosti cijepanja.
Šta su izošizomeri?
Izošizomeri su restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja i cijepaju DNK na istim pozicijama. Ovi restrikcijski enzimi imaju istu specifičnost. Prvi otkriveni restrikcijski enzim koji prepoznaje datu sekvencu poznat je kao prototip, dok se svi naknadno identificirani restrikcijski enzimi koji prepoznaju tu istu sekvencu nazivaju izošizomeri. Međutim, izošizomeri se mogu razlikovati u preferencijama mjesta, uvjetima reakcije, osjetljivosti na metilaciju i aktivnosti zvijezde. Izošizomeri su izolirani iz različitih sojeva bakterija. Stoga mogu zahtijevati različite uslove reakcije. U nekim slučajevima, samo jedan od para izošizomera može prepoznati i metilirane i nemetilirane oblike restrikcijskih mjesta. S druge strane, drugi restrikcijski enzim može prepoznati samo nemetilirani oblik restriktivnog mjesta. Ova posebna karakteristika izošizomera pomaže u identifikaciji stanja metilacije restriktivnog mjesta dok se ono izolira od bakterijskog stanja.
Na primjer, AgeI i BshT1 prepoznaju i cijepaju 5’-A↓CCGGT po istom obrascu. HpaII i MSPI su drugi parovi izošizomera. Oboje prepoznaju sekvencu 5’-C↓CGG-3’ kada je nemetilirana. Ali kada je drugi C sekvence metiliran, samo MSPI može prepoznati ovu sekvencu dok je HpaII ne može prepoznati.
Šta su neošizomeri?
Neošizomeri su restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama. U nekim posebnim molekularno biološkim aplikacijama, ovo je vrlo korisna karakteristika. Neošizomeri su podskup izošizomera. Dobro poznati primjeri za neošizomere su SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) i XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); oba prepoznaju sekvencu 5’-CCCGGG-3’, ali ih cijepaju na različitoj poziciji. Dakle, ova dva restrikcijska enzima stvaraju različite vrste krajeva. U ovom slučaju, SmaI proizvodi tupe krajeve, a XmaI proizvodi 5’ izbočene krajeve.
Slika 01: Neoschizomers
Još jedan primjer je par restrikcijskih enzima MaeII i Tail. Prototip MaeII (A↓CGT) proizvodi fragmente DNK sa 2-baznim produžetkom od 5’, a neošizomerni rep (ACGT↓) proizvodi fragmente DNK sa produžetkom od 4 baze 3’.
Koje su sličnosti između izošizomera i neošizomera?
- Izošizomeri i neošizomeri su dvije vrste restrikcijskih enzima.
- Oni se pretežno nalaze u prokariotima.
- Oni su dio sistema restrikcije-modifikacije (RM) koji se nalazi u bakterijama i arhejama.
- Oba su proteinski molekuli.
- Oba cijepaju DNK na fragmente.
Koja je razlika između izošizomera i neošizomera?
Izošizomeri su restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja i cijepaju DNK na istim pozicijama, dok su neošizomeri restrikcijski enzimi koji imaju istu sekvencu prepoznavanja, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama. Dakle, ovo je ključna razlika između izošizomera i neošizomera. Nadalje, izošizomeri imaju iste specifičnosti dok neošizomeri imaju različite specifičnosti.
Sljedeća infografika navodi razlike između izošizomera i neošizomera u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – Isoschizomers vs Neoschizomers
Restrikcioni enzimi su enzimi za rezanje DNK. Nazivaju se i molekularne makaze. Postoje različite vrste restrikcijskih enzima. Na osnovu mjesta prepoznavanja i specifičnosti cijepanja, restrikcijski enzimi su dva tipa kao što su izošizomeri i neošizomeri. Izošizomeri imaju istu sekvencu prepoznavanja i cijepaju DNK na istim pozicijama, dok neošizomeri imaju istu sekvencu prepoznavanja, ali cijepaju DNK na različitim pozicijama. Dakle, ovo je ključna razlika između izošizomera i neošizomera.
