Ključna razlika između izošizomera i izokaudomera je u tome što izošizomeri prepoznaju i cijepaju isto ograničenje ili mjesto prepoznavanja dok izokaudomeri prepoznaju neznatno različita mjesta ograničenja i cijepaju se na istom mjestu.
Restrikcioni enzimi ili restrikcijske endonukleaze su vrsta nukleaza koje cijepaju dvolančanu DNK. Oni su u stanju da prepoznaju specifične sekvence zvane restrikcijska mjesta, koja su palindromskog porijekla. Bakterije proizvode restrikcijske enzime protiv stranih patogena, posebno protiv virusa. To je oblik odbrambenog mehanizma koji pokazuju bakterije. Ovisno o strukturi enzima i prirodi rezova, postoje tri tipa restrikcijskih enzima kao što su restrikcijski enzimi tipa I, restrikcijski enzimi tipa II i restrikcijski enzimi tipa II. Štaviše, u zavisnosti od biohemijske aktivnosti i izvora izolacije, postoje tri tipa restrikcijskih enzima kao što su izošizomeri, neošizomeri i izokaudomeri.
Šta su izošizomeri?
Izošizomeri su vrsta restrikcijskih enzima koji dolaze iz različitih izvora, ali prepoznaju i cijepaju isto restriktivno mjesto u DNK. Dakle, dva izošizomera imaju isto mjesto prepoznavanja. Oni se cijepaju na istom mjestu, tako da su specifični za istu sekvencu prepoznavanja. Na primjer, restrikcijski enzimi SphI i BbuI su dva izošizomera koja prepoznaju i cijepaju se na CGTAC/G.
Slika 01: Restrikcioni enzim
Još jedan par izošizomera je HpaII i MspI. Oboje prepoznaju sekvencu 5′-CCGG-3′ i cijepaju DNK. Štaviše, Bsp EI i Acc III su takođe izošizomeri koji potiču iz vrste Bacillus i Acinetobacter calcoaceticus, respektivno. Izolacija izošizomera može se obaviti iz različitih bakterija. Budući da potiču iz različitih bakterija, njihovi uvjeti ograničenja mogu se razlikovati jedan od drugog.
Šta su isocaudomeri?
Izokaudomeri su vrsta restriktivnog enzima koji prepoznaje malo različite sekvence, ali se cijepaju na istom mjestu kako bi proizveli iste krajeve. Izokaudomeri također dolaze iz različitih bakterija. Sau3a i BamHI su par izokaudomera. Oni proizvode 5’-GATC-3’ ljepljivi kraj nakon cijepanja istog mjesta. Drugi par izokaudomera je NcoI iz Nocardia corallina i PagI iz Pseudomonas alcaligenes. Ova dva enzima se također vežu na različitim sekvencama prepoznavanja, ali se sijeku na istom mjestu i proizvode iste ljepljive krajeve. Stoga su rezni krajevi kompatibilni jedni s drugima i mogu se vezati jedan za drugi. XhoI, PspXI i SalI su također izokaudomeri.
Koje su sličnosti između izošizomera i izokaudomera?
- Izošizomeri i izokaudomeri su dvije vrste restrikcijskih enzima.
- Dva izošizomera imaju isto mesto varenja, slično kao dva izokaudomera koja imaju isto mesto varenja.
- Oni su prokariotski porijeklom.
- Obje imaju stranicu za prepoznavanje ograničenja kao i mjesto za varenje.
- Proizvode krajeve koji su međusobno kompatibilni.
- Pored toga, ovi enzimi su korisni alati u tehnologiji rekombinantne DNK.
Koja je razlika između izošizomera i izokaudomera?
Izošizomeri su restrikcijski enzimi koji prepoznaju istu sekvencu DNK i cijepaju se na istom restrikcijskom mjestu, dok su izokaudomeri restrikcijski enzimi koji prepoznaju neznatno različite sekvence DNK, ali proizvode iste ljepljive krajeve rezanjem na istom mjestu. Dakle, ovo je ključna razlika između izošizomera i izokaudomera.
Infografika ispod prikazuje razliku između izošizomera i izokaudomera.
Sažetak – Isoschizomers vs Isocaudomers
Izošizomeri su restrikcijski enzimi koji prepoznaju istu sekvencu DNK i cijepaju se na istom mjestu. S druge strane, izokaudomeri su restrikcijski enzimi koji prepoznaju malo različite sekvence i cijepaju se na istom mjestu stvarajući iste krajeve. Dakle, ovo je ključna razlika između izošizomera i izokaudomera. SphI, BbuI, HpaII i MspI su nekoliko primjera izošizomera, dok su Sau3a i BamHI dva primjera izokaudomera. I izošizomere i izokaudomere prirodno proizvode bakterije.
