Ključna razlika – ponavljajuća DNK naspram satelitske DNK
Genomska DNK se uglavnom sastoji od kodirajuće DNK i nekodirajuće DNK. Kodirajuće sekvence poznate su kao geni. Hiljade gena nalazi se na hromozomima. Ponavljajuća DNK, introni i regulatorne sekvence smatraju se nekodirajućom DNK u genomu. Ponavljajuća DNK su nukleotidne sekvence koje se iznova ponavljaju u genomu organizama. Ponavljajuća DNK čini značajan dio genomske DNK i kategorizirana je u tri glavna tipa pod nazivom tandem ponavljanja, terminalna ponavljanja i interspersirana ponavljanja. Tandem ponavljanja su veoma repetitivna u genomu. Jedna vrsta tandemskih ponavljanja je satelitska DNK. Ključna razlika između repetitivne DNK i satelitske DNK je u tome što je repetitivna DNK ponavljajuća sekvenca DNK u genomu, dok je satelitska DNK vrsta repetitivne DNK koja se jako ponavlja i nalazi se uglavnom u heterohromatskom regionu oko centromera.
Šta je repetitivna DNK?
Repetitivna DNK ima ponavljane nukleotidne sekvence iznova i iznova. Ponavljajući DNK je također poznat kao repetitivni elementi ili ponavljanja. Ponavljajuća DNK zauzima značajan dio ukupnog genoma mnogih organizama. Ljudski genom sadrži više od dvije trećine sekvence DNK koja se ponavlja. Oni ne kodiraju proteine i pripadaju kategoriji nekodirajuće DNK genoma.
Postoje tri glavna tipa repetitivne DNK nazvane terminalna ponavljanja, tandem ponavljanja i interspersirana ponavljanja. Tandem ponavljanja su visoko ponovljene sekvence koje leže jedna uz drugu. Postoje tri tipa tandemskih ponavljanja koji se nazivaju satelitska DNK, minisatelitska DNK i mikrosatelitska DNK. Interspersed repetitive DNK je repetitivna sekvenca dispergirana kroz genom kao pojedinačne jedinice sa jedinstvenim bočnim sekvencama. Postoje dvije vrste isprepletene DNK nazvane transpozoni i retrotranspozoni. Nastaju zbog sposobnosti transpozicije unutar genoma. Retrotranspozoni pripadaju klasi 1 prenosivih elemenata i prate mehanizam kopiranja i lijepljenja kako bi se integrirali u genom. Transpozoni pripadaju klasi 2 prenosivih elemenata jer prate mehanizam rezanja i lijepljenja kako bi se kretali duž genoma.
Iako repetitivna DNK nije kodirana za proteine, oni su važni za različite funkcije u genomu. Ponavljajuća DNK je neophodna za formatiranje ekspresije jedinstvenih kodirajućih sekvenci i za obezbeđivanje dodatnih funkcija potrebnih za replikaciju genoma i tačan prenos u ćelije kćeri, itd. Ponavljajuća DNK takođe obezbeđuje značajan deo skele ili regiona vezivanja matriksa, pokazujući njenu neophodnost u organizaciji genoma organizama.
Šta je satelitski DNK?
Satelitska DNK je vrsta ponavljajuće DNK koja se jako ponavlja. Oni pripadaju kategoriji repetitivne DNK koja se naziva tandem ponavljanja. Satelitska DNK se tandemski ponavlja i nalazi u centromernim i telomernim regijama hromozoma. Jedna kratka ponavljajuća jedinica satelitske DNK kreće se od 5 do 300 parova baza, ovisno o vrsti. Ponavljaju se normalno 105 do 106 puta u genomu. U genomu sisara, satelitska DNK čini 10 – 20% frakcije.
Satelitska DNK ne kodira proteine i ne prenosi funkcionalne genetske informacije. Oni doprinose hromozomskoj organizaciji jer služe glavnoj komponenti funkcionalnih centromera i kao glavni strukturni sastojak heterohromatina.
Satelitska DNK se razlikuje po gustini sa većinom DNK. Dakle, daje zasebnu traku tokom ultracentrifugiranja. Postoje različite vrste satelitske DNK poznate kao alfoidna DNK, beta, satelit 1, satelit 2, satelit 3 itd.
Slika 01: Ponavljajući DNK i satelitski DNK
Koja je razlika između repetitivne DNK i satelitske DNK?
Ponavljajući DNK vs satelitski DNK |
|
| Repetitivna DNK je nukleotidna sekvenca koja se ponavlja mnogo puta u genomu organizama. | Satelitska DNK je jedna vrsta repetitivne DNK koja se ponavlja milione puta u genomu. |
| Tipovi | |
| Postoje tri glavna tipa kao što su terminalna ponavljanja, tandemska ponavljanja i isprepletena ponavljanja. | Satelitska DNK je klasifikovana u različite tipove kao što su alfoid, beta, saterlit1, 2 i 3, itd. |
| Lokacija | |
| Ponavljajuća DNK se nalazi u čitavom genomu. | Satelitska DNK se nalazi u centromernim i telomernim regijama hromozoma. |
Sažetak – Ponavljajući DNK naspram satelitske DNK
Genomi su organizovani u različite tipove DNK. Kodirajuće sekvence među njima se pohranjuju s genetskim informacijama za sintezu proteina. Druge nekodirajuće sekvence pružaju strukturne i dodatne funkcije za replikaciju DNK, održavanje strukture hromozoma, itd. Ponavljajuća DNK je vrsta nekodirajuće DNK koja se ponavlja iznova i iznova unutar genoma. Ponavljajuća DNK ima različite tipove, a satelitska DNK, koja se nalazi u centromernim i telomernim regijama hromozoma, je jedna od njih. Ovo je razlika između ponavljajuće DNK i satelitske DNK.
Preuzmite PDF verziju ponavljajuće DNK u odnosu na satelitsku DNK
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti ga za vanmrežne svrhe prema napomenama o citatima. Molimo preuzmite PDF verziju ovdje Razlika između ponavljajuće DNK i satelitske DNK – PDF.
