Ključna razlika između DNK bez ćelija i cirkulišuće DNK tumora je u tome što su DNK bez ćelija različiti oblici DNK koji slobodno cirkulišu u krvi, dok je cirkulišuća DNK tumora fragmentirana DNK izvedena iz tumora koja cirkuliše krvlju.
DNK bez ćelija i cirkulirajuća tumorska DNK su dvije vrste cirkulirajućih nukleinskih kiselina. Cirkulirajuće nukleinske kiseline su otkrili Mandel i Metal 1948. Kasnije je otkriveno da je količina cirkulirajućih nukleinskih kiselina kod oboljelih pacijenata značajno visoka. Ovo otkriće je prvi put napravljeno u odnosu na oboljele od lupusa. Osim toga, cirkulirajuće nukleinske kiseline imaju veću prognostičku vrijednost i mogu se koristiti kao biomarker za otkrivanje različitih bolesti.
Šta je DNK bez ćelija?
DNK bez ćelija (Cf DNK) odnosi se na različite oblike DNK kao što su cirkulišuća tumorska DNK, mitohondrijska DNK bez ćelija i fetalna DNK bez ćelija, itd., koji slobodno cirkulišu u krvi. Povišeni nivoi besćelijske DNK primećuju se kod uznapredovalih bolesti kao što su rak, trauma, sepsa, infarkt miokarda, dijabetes, moždani udar, bolest srpastih ćelija, itd. Pored raka i fetalne medicine, DNK bez ćelija je koristan biomarker za mnoštvo tegoba. Ova DNK se može koristiti i za otkrivanje odbacivanja transplantata. Koriste se i za određivanje običnog stresa, prenatalnog razlikovanja spola i u testiranju očinstva.
Slika 01: DNK bez ćelija
DNK bez ćelija je obično dvolančani ekstracelularni molekul DNK. Sastoji se od malih fragmenata (50 do 200 bp) i većih fragmenata (21 kb). Nadalje, već je prepoznat kao pouzdan biomarker za dijagnozu raka prostate i dojke. DNK bez ćelija pretežno cirkuliše u krvotoku kao nukleosomi. Nukleosomi su nuklearni kompleksi histona i DNK. Cf DNK se može kvantificirati korištenjem različitih tehnika kao što su PCR, masovno paralelno sekvenciranje, ultraljubičasta spektrometrija, PicoGreen bojenje i ELISA. Kako je detekcija Cf DNK u krvotoku brza, laka, neinvazivna, ponavljajuća metoda, u budućnosti će to biti potencijalni biomarker za dijagnosticiranje brojnih bolesti kao što su autoimune reumatske bolesti i tumori.
Šta je cirkulirajuća tumorska DNK?
Cirkulirajuća tumorska DNK (Ct DNK) je fragmentirana DNK izvedena iz tumora koja cirkulira u krvi. Ima tumorsko porijeklo. Kako cirkulirajući tumor može odražavati cijeli genom tumora, stekao je široku privlačnost zbog svoje potencijalne korisnosti u kliničkim postavkama. Tečne biopsije, kojima se vadi krv, mogu se koristiti za testiranje cirkulirajućih tumora.
Slika 02: Cirkulirajući DNK tumora
Biološki procesi koji su vjerovatno uključeni u oslobađanje Ct DNK uključuju apoptozu i nekrozu iz umirućih ćelija ili aktivno oslobađanje iz tumorskih ćelija. U zdravim tkivima, infiltrirajući fagociti mogu očistiti Ct DNK. Nadalje, različite tehnike se mogu koristiti u analizi cirkulirajuće tumorske DNK kao što je digitalni PCR u obliku kapljica, BEAMing, CAPP-Seq (duboko sekvenciranje), sigurno sekvenciranje i dupleksno sekvenciranje.
Koje su sličnosti između DNK bez ćelija i cirkulirajuće tumorske DNK?
- DNK bez ćelija i cirkulirajuća tumorska DNK su dvije vrste cirkulirajućih nukleinskih kiselina.
- Sastoje se od nukleotida.
- Obje vrste se mogu koristiti kao potencijalni markeri za dijagnosticiranje različitih bolesti u kliničkim postavkama.
- Nalaze se u krvotoku.
- Oba su ekstracelularni oblici DNK molekula.
- Obojica se čiste infiltriranjem fagocita.
Koja je razlika između DNK bez ćelija i cirkulirajuće tumorske DNK?
DNK bez ćelija su različiti oblici DNK kao što je cirkulirajuća tumorska DNK, mitohondrijska DNK bez ćelija i fetalna DNK bez ćelija, itd., koji slobodno cirkulišu u krvi, dok je cirkulirajuća DNK tumora fragmentirana DNK izvedena iz tumora koji cirkuliše u krvi. Dakle, ovo je ključna razlika između DNK bez ćelija i DNK tumora koji cirkuliše. Nadalje, DNK bez ćelija cirkulira u fragmentima u rasponu od 50-220 bp, dok cirkulirajuća tumorska DNK cirkulira u fragmentima u rasponu od 134-144 bp.
Sljedeća infografika predstavlja razliku između DNK bez ćelija i cirkulirajuće tumorske DNK u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – DNK bez ćelija u odnosu na cirkulirajuću tumorsku DNK
Cirkulirajuće nukleinske kiseline se ubacuju u krvotok putem reguliranih ili slučajnih mehanizama. DNK bez ćelija i cirkulirajuća tumorska DNK su dvije vrste cirkulirajućih nukleinskih kiselina. DNK bez ćelija su različiti oblici DNK kao što je cirkulišuća tumorska DNK, mitohondrijska DNK bez ćelija, fetalna DNK bez ćelija koja slobodno cirkuliše u krvi dok je cirkulišuća DNK tumora fragmentovana DNK izvedena iz tumora koja cirkuliše u krvi. Dakle, ovo sažima razliku između DNK bez ćelija i DNK tumora koji cirkuliše.
