Ključna razlika između T4 DNK ligaze i E. coli DNK ligaze je u tome što je T4 DNK ligaza enzim koji je izolovan iz bakteriofaga T4 dok je E. coli DNK ligaza enzim izolovan iz bakterije E. coli.
DNK ligaza je specifičan tip enzima koji olakšava spajanje lanaca DNK kroz formiranje fosfodiestarske veze. On igra važnu ulogu popravljajući jednolančane i dvolančane lomove u DNK živih organizama. Štaviše, DNK ligaza se koristi i za popravku DNK i za replikaciju DNK. Osim gore navedenih upotreba, DNK ligaza također ima široku upotrebu u eksperimentima molekularne biologije kao što je tehnologija rekombinantne DNK. T4 DNK ligaza i E. coli DNK ligaza su dvije vrste enzima DNK ligaze.
Šta je T4 DNK ligaza?
T4 ligaza je enzim za spajanje DNK koji je izolovan iz bakteriofaga T4. T4 bakteriofag je virus koji inficira Escherichia coli. Enzim T4 ligaza je najčešće korištena DNK ligaza u molekularno biološkim laboratorijskim istraživanjima. Normalno, T4 ligaza katalizira spajanje dva kohezivna ili tupa lanca dvolančane DNK između 5’ fosfatne i 3’ hidroksilne grupe susjednih nukleotida. Također može katalizirati spajanje RNK na DNK ili RNA lanac u dupleks molekulu. Međutim, ovaj enzim neće spojiti jednolančane nukleinske kiseline. Štaviše, može da ligira DNK sa tupim krajevima sa mnogo većom efikasnošću od DNK ligaze E. coli.
Slika 01: T4 DNK ligaza
Ovaj enzim zahtijeva ATP kao kofaktor. Neki istraživački eksperimenti genetskog inženjeringa već su proizveli aktivnije enzime DNK ligaze od divljeg tipa T4 DNK ligaze. U jednom od pristupa, stvorili su fuzioni enzimski molekul tako što su češljali T4 DNK ligazu na p50 ili NF-kB molekul. Ovaj novi enzim T4 ligaze bio je 160% aktivniji u vezivanju tupih krajeva u svrhu kloniranja od divlje T4 DNK ligaze. Nadalje, optimalna temperatura za T4 DNK ligazu da preciznije katalizira reakciju ligacije je 16 °C.
Šta je E Coli DNK ligaza?
E. coli DNK ligaza je enzim koji je izoliran iz bakterije E. coli. Gen odgovoran za stvaranje DNK ligaze E. coli je lig gen. DNK E. coli, ligaza, kao i većina DNK ligaza prokariota, koriste energiju koju dobija NAD (nikotinamid adenin dinukleotid) za stvaranje fosfodiestarske veze.
Slika 02: E. Coli DNK ligaza
E. coli DNK ligaza je enzim za ligiranje koji može spojiti fragmente DNK katalizirajući formiranje fosfodiestarskih veza između dvolančanih DNK fragmenata koji sadrže 5' fosfatne krajeve i 3' hidroksilne krajeve. Štaviše, ne ligira DNK sa tupim krajevima osim u posebnim uslovima kao što je molekularna gužva sa polietilen glikolom. Takođe ne može efikasno da spoji RNK sa DNK. Nadalje, aktivnost DNK ligaze E. coli može se poboljšati prisustvom DNK polimeraze 1 u pravoj koncentraciji. Međutim, kada je koncentracija enzima DNK polimeraze 1 viša, to ima štetne efekte na aktivnost DNK ligaze E. coli.
Koje su sličnosti između T4 DNK ligaze i E Coli DNK ligaze?
- T4 DNK ligaza i E-coli DNK ligaza su dvije vrste enzima DNK ligaze.
- Oba su proteini sastavljeni od aminokiselina.
- Ovi enzimi kataliziraju formiranje fosfodiesterske veze između suprotstavljenih 5' fosfata i 3' hidroksilnih završetaka u dupleks DNK.
- Imaju široku upotrebu u eksperimentima molekularne biologije kao što je tehnologija rekombinantne DNK.
Koja je razlika između T4 DNK ligaze i E Coli DNK ligaze?
T4 DNK ligaza je enzim koji je izolovan iz bakteriofaga T4, dok je DNK ligaza E. coli enzim izolovan iz bakterije E. coli. Dakle, ovo je ključna razlika između T4 DNK ligaze i E. coli DNK ligaze. Nadalje, izvor energije za T4 DNK ligazu je ATP. S druge strane, izvor energije za DNK ligazu E. coli je NAD.
Infografika ispod predstavlja razlike između T4 DNK ligaze i E coli DNK ligaze u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – T4 DNK ligaza vs E Coli DNK ligaza
T4 DNK ligaza i E. coli DNK ligaza su dva enzima koja katalizuju formiranje fosfodiesterske veze između suprotstavljenih 5’ fosfata i 3’ hidroksilnih završetaka u dupleks DNK. T4 ligaza je enzim izolovan iz bakteriofaga T4, dok je DNK ligaza E. coli enzim izolovan iz bakterije E. coli. Dakle, ovo je ključna razlika između T4 DNK ligaze i E coli DNK ligaze.
