Ključna razlika – VNTR vs STR
DNK studije imaju ogromnu korist u razumijevanju i određivanju filogenetskih odnosa, dijagnosticiranju genetskih bolesti i mapiranju genoma organizma. Nekoliko tehnika povezanih sa analizom DNK koristi se za identifikaciju određenog gena ili sekvence DNK u grupi nepoznate DNK. Poznati su kao genetski markeri. Genetski markeri se koriste u molekularnoj biologiji za identifikaciju genetskih varijacija između pojedinaca i vrsta. Tandem ponavljanje varijabilnog broja (VNTR) i kratko tandem ponavljanje (STR) su dvije vrste genetskih markera koji pokazuju polimorfizam među pojedincima. Oba tipa su nekodirajuća ponavljajuća DNK koja se ponavljaju u tandemu. Oni su raspoređeni na način od glave do repa u hromozomima. VNTR je dio genoma gdje se kratka nukleotidna sekvenca ponavlja nekoliko puta. STR je još jedan dio DNK unutar genoma koji je organiziran kao ponavljajuće jedinice koje se sastoje od dva do trinaest nukleotida u stotinu puta. Ključna razlika između VNTR i STR je broj nukleotida u nizu koji se ponavlja. Ponavljajuće jedinice VNTR se sastoje od 10 do 100 nukleotida, dok se ponavljajuća jedinica STR sastoji od 2 do 13 nukleotida. VNTR i STR se široko koriste u forenzičkim studijama.
Šta je VNTR?
Tandemsko ponavljanje je kratka sekvenca DNK koja se ponavlja od glave do repa na specifičnom hromozomskom lokusu. Ne postoji druga sekvenca ili nukleotid unutar tandemskog ponavljanja. Postoji nekoliko tipova tandemskih ponavljanja u genomu. VNTR je tip tandemskog ponavljanja među njima koji ima ponavljajuće jedinice koje se sastoje od 10 do 100 nukleotida. VNTR je vrsta minisatelita. Ova tandemska ponavljanja mogu se naći u mnogim hromozomima. Oni su isprepleteni unutar ljudskog genoma i smješteni su pretežno u subtelomernim regijama hromozoma.
VNTR pokazuju polimorfizam tandem ponavljanja među pojedincima. Dužina VNTR-a na određenoj lokaciji hromozoma je vrlo varijabilna među pojedincima zbog varijacije u broju ponavljajućih jedinica organiziranih u tom dijelu DNK. Stoga se VNTR može koristiti kao moćno sredstvo u identifikaciji pojedinaca, a VNTR analiza se koristi u mnogim poljima uključujući genetiku, biološka istraživanja, forenziku i DNK otisak prstiju. VNTR su bili prvi genetski markeri korišteni za kvantifikaciju presađivanja koštane srži. VNTR su također bili prvi polimorfni markeri korišteni u DNK profiliranju u forenzici.
Slika 01: Varijacija VNTR-a kod šest osoba
VNTR analiza je izvedena putem polimorfizma dužine restrikcijskih fragmenata nakon čega slijedi južnjačka hibridizacija. Stoga mu je potreban relativno veliki uzorak DNK. Interpretacija VNTR profila je također problematična. Zbog ovih ograničenja, upotreba VNTR-a u forenzičkoj genetici je ograničena i zamijenjena je STR analizom.
Šta je STR?
STR je visoko repetitivni dio DNK koji se sastoji od dvije do trinaest ponavljajućih jedinica nukleotida organiziranih na tandem način. STR je sličan VNTR. Ali razlikuje se od VNTR od broja nukleotida u nizu koji se ponavlja i broja ponavljanja. STR je vrsta mikrosatelita.
STR analiza uključena u mjerenje tačnog broja ponavljajućih jedinica. STR-ovi su veoma varijabilni među pojedincima, slično VNT-ovima. STR profili se razlikuju od osobe do osobe. Stoga se STR analiza koristi u molekularnoj biologiji za poređenje specifičnih lokusa na DNK iz dva ili više uzoraka. Stoga se STR-ovi smatraju snažnim genetskim markerima u molekularnoj biologiji. Pruža odličan alat za identifikaciju pojedinaca zbog njihovog visokog stepena polimorfizma i relativno kratke dužine.
Trenutno su STR-ovi najčešće korišteni alat za analizirani genetski polimorfizam u forenzičkoj genetici. Većina forenzičkih predmeta uključuje STR polimorfnu analizu. STR lokusi su rašireni po čitavom genomu. Postoje hiljade STR-ova lociranih u hromozomima koji se mogu koristiti u forenzičkoj analizi. STR analiza ne uključuje polimorfizam dužine ograničenja kao VNTR analiza. STR analiza ne reže DNK restrikcijskim enzimima. Specifične sonde se koriste za pričvršćivanje željenih regiona na DNK i pomoću PCR tehnike se određuju dužine STR.
Slika 02: STR varijacija između uzoraka
Koje su sličnosti između VNTR i STR?
- VNTR i STR su nekodirajuća DNK.
- Oba su tandemska ponavljanja.
- Oba pokazuju polimorfizam među pojedincima zbog razlike u dužini DNK sekcije.
- Oba se koriste kao moćni genetski markeri u DNK otisku prstiju i u forenzičkim studijama.
Koja je razlika između VNTR i STR?
VNTR vs STR |
|
| VNTR je nekodirajuća ponavljajuća DNK koja ima kratku nukleotidnu sekvencu koja se ponavlja na tandem način. | STR je visoko repetitivni dio DNK koji se sastoji od dva do trinaest ponavljajućih jedinica nukleotida organiziranih na tandem način. |
| Veličina | |
| VNTR-ovi su veći od STR-ova. | STR-ovi su manji od VNTR-ova. |
| Broj nukleotida u nizu koji se ponavlja | |
| Ponavljajuća jedinica VNTR-a sastoji se od 10 do 100 nukleotida. | Ponavljajuća jedinica STR sastoji se od 2 do 13 nukleotida. |
Sažetak – VNTR vs STR
VNTR i STR su dva moćna genetska markera koji se koriste u molekularnoj biologiji, posebno u oblasti forenzičke genetike. VNTR je vrsta minisatelita, a STR je mikrosatelit. VNTR i STR su nekodirajuća, visoko repetitivna DNK. Oni su tandem ponavljanja. Opšta struktura VNTR i STR su ista. Međutim, broj nukleotida u nizu koji se ponavlja i dužina su različiti. VNTR ima ponavljajuće sekvence koje se sastoje od 10 do 100 nukleotida. STR ima ponavljajuće sekvence koje se sastoje od 2 do 13 nukleotida. Ovo je razlika između VNTR i STR.
Preuzmite PDF verziju VNTR vs STR
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti ga za vanmrežne svrhe prema napomenama o citatima. Molimo preuzmite PDF verziju ovdje Razlika između VNTR i STR.
