Ključna razlika između VNTR i sonde je u tome što je VNTR kratka nukleotidna sekvenca koja se javlja kao tandemski ponavljanje u genomu, dok je sonda umjetno sintetizirana kratka sekvenca DNK ili RNK koja može biti radioaktivno označena.
VNTR je skraćenica za tandem ponavljanje varijabilnog broja. To je kratka nukleotidna sekvenca organizirana u tandemu ponavljanja u genomu. VNTR se prirodno javljaju u našem genomu. Sonda je umjetno sintetizirana kratka DNK ili RNK sekvenca. I sonda i VNTR su nukleinske kiseline ili kratke nukleotidne sekvence. Imaju ogromnu upotrebu u različitim molekularno biološkim tehnikama, uglavnom u forenzičkim studijama. VNTR i sonda imaju neke sličnosti, ali i razlike. Stoga, članak pokušava naglasiti razliku između VNTR-a i sonde.
Šta je VNTR?
VNTR je kratka nukleotidna sekvenca koja postoji kao tandem ponavljanje u našem genomu. VNTR su prisutni u mnogim hromozomima. Nadalje, VNTR se razlikuju među različitim pojedincima po dužini jer je broj ponavljanja različit u VNTR-ovima različitih ljudi. U osnovi, to je zbog alela naslijeđenih od roditelja. Stoga uglavnom koristimo VNTR za roditeljske identifikacije (nasljeđivanje) ili u lične svrhe. Slično, moguće ih je koristiti u genetici, forenzici, biološkim istraživanjima i DNK otisku prstiju. Stoga je VNTR važan alat u molekularnoj biologiji.
Slika 01: VNTR
U nasljeđivanju analiziramo VNTR podatke koristeći dva osnovna principa: uparivanje naslijeđa i podudaranje identiteta. Tokom nasljednog podudaranja, pojedinac mora imati odgovarajući alel s alelom svakog roditelja. Tokom podudaranja identiteta, oba VNTR alela moraju biti prisutna na određenoj lokaciji genoma.
Šta je sonda?
U kontekstu molekularne biologije, sonda je umjetno sintetizirani DNK ili RNA fragment dužine od 100 do 1000 baza. Možemo radioaktivno označiti ove sonde. Stoga ih koristimo u detekciji ciljnih nukleotidnih sekvenci koje su komplementarne sekvenci sonde. Kada uzorku dodamo sonde, dolazi do hibridizacije sa komplementarnim sekvencama ili ciljnim sekvencama i olakšava nam identifikaciju ciljnih sekvenci. Pošto sonde nose radioaktivnost, možemo ih lako otkriti.
Slika 02: Sonda
U forenzičkoj nauci, mi obično koristimo sonde u tehnikama DNK profiliranja kao što je detekcija kratkih tandem ponavljanja regiona, polimorfizmi dužine restrikcijskih fragmenata i DNK otisak prsta.
Koje su sličnosti između VNTR-a i sonde?
- Nukleinske kiseline su građevni blokovi VNTR-a i Probe.
- Koristimo ih u procesima identifikacije gena.
- Takođe, obje njihove dužine su promjenjive.
- Oni su važni alati u forenzičkim studijama, DNK otisku prstiju, genetici, itd.
Koja je razlika između VNTR-a i sonde?
VNTR je regija genoma organizirana kao tandem ponavljanja, dok je sonda kratka DNK ili RNK sekvenca sintetizirana umjetno kako bi se otkrile ciljne sekvence u uzorku. Dakle, ovo je ključna razlika između VNTR-a i sonde. Također, važna razlika između VNTR-a i sonde je u tome što za razliku od VNTR-a, sonde možemo radioaktivno označiti.
Štaviše, VNTR-ovi uglavnom vrše roditeljske identifikacije dok sonde pomažu u otkrivanju ciljnih nukleotidnih sekvenci u DNK ili RNK uzorcima koji su komplementarni sekvenci sonde. Dakle, ovo je takođe značajna razlika između VNTR-a i sonde.
Sljedeća infografika predstavlja više informacija o razlici između VNTR-a i sonde.
Sažetak – VNTR vs Probe
Uobičajena upotreba VNTR-a i sonde je u tehnikama molekularne analize kao što su forenzičke studije i DNK otisak prsta. Oba se sastoje od varijabilnih dužina. Međutim, ključna razlika između VNTR i sonde je u tome što je VNTR regija genoma uređena tandemskim ponavljanjima dok je sonda fragment DNK ili RNK koji se može radioaktivno označiti. Štaviše, VNTR su prisutni u genomu. Međutim, sonde su umjetno sintetizirane i mogu biti označene radioaktivno kako bi se otkrile ciljne nukleotidne sekvence u DNK ili RNK uzorcima koji su komplementarni sekvenci u sondi. Dakle, ovo je sažetak razlike između VNTR-a i sonde.
