Ključna razlika između 1D i 2D gel elektroforeze su svojstva koja se koriste za odvajanje proteina na gel elektroforezi. 1D gel elektroforeza razdvaja proteine samo na osnovu molekularne težine, dok 2D gel elektroforeza razdvaja proteine na osnovu njihove izoelektrične tačke i molekularne težine.
Razdvajanje proteina gel elektroforezom je važna tehnika za karakterizaciju proteina. Proteini imaju različita svojstva; stoga je odvajanje složenije u poređenju sa odvajanjem DNK elektroforezom u agaroznom gelu.
Šta je 1D gel elektroforeza?
1D gel elektroforeza, poznata i kao jednodimenzionalna gel elektroforeza, je metoda odvajanja proteina zasnovana na molekularnoj težini. Odvajanje proteina se uglavnom odvija pomoću elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Na osnovu koncepta gel elektroforeze, molekule se odvajaju na osnovu njihove molekularne težine i naboja.
Stoga, da bi se proteinima dao ujednačen naboj, tretman natrijum dodecil sulfatom (SDS) se radi prije gel elektroforeze. SDS denaturira proteine i osigurava ujednačen negativni naboj na proteinu; kada dođe do primjene električnog polja, proteini migriraju na pozitivni terminal na osnovu njihove molekularne težine. Dakle, pri odvajanju se uzima u obzir samo jedno svojstvo. Zbog toga se ova metoda naziva 1D gel elektroforeza.
Slika 01: 1D gel elektroforeza
Tokom 1D gel elektroforeze, proteini se odvajaju na osnovu njihove molekularne težine. U tom smislu, molekuli manje težine migriraju brže u gelu u odnosu na proteine visoke molekularne težine. Dakle, proteini velike težine ostaju blizu izvora.
Šta je 2D gel elektroforeza?
2D gel elektroforeza ili dvodimenzionalna gel elektroforeza razdvaja proteine na osnovu dva svojstva. Dva svojstva su izoelektrična tačka proteina i molekulska težina. Ova metoda razdvajanja proteina povećava rezoluciju odvajanja proteina. Izoelektrična tačka proteina zavisi od pH vrednosti na kojoj je protein neutralan.
Slika 02: 2D gel elektroforeza
Dakle, u 2D gel elektroforezi, proteinu je dozvoljeno da radi na fiksnom pH gradijentu u prvoj dimenziji. U drugoj dimenziji, proteini se odvajaju pomoću vertikalne ili horizontalne elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Dakle, proteini se odvajaju prema njihovoj molekularnoj težini u drugoj dimenziji.
Osim toga, ova metoda gel elektroforeze povećava rezoluciju odvajanja proteina. Stoga su izdvojeni proteini čistiji. Međutim, cijena tehnike je mnogo veća od jednodimenzionalne gel elektroforeze.
Koje su sličnosti između 1D i 2D gel elektroforeze?
- Obje tehnike razdvajaju proteine.
- Dakle, oni su važni u karakterizaciji proteina.
Koja je razlika između 1D i 2D gel elektroforeze?
Ključna razlika između 1D i 2D gel elektroforeze je u tome što 1D gel elektroforeza razdvaja proteine samo na osnovu molekularne težine, dok 2D gel elektroforeza razdvaja proteine na osnovu izoelektrične tačke i molekularne težine. Zbog ove osnovne razlike između 1D i 2D gel elektroforeze, rezolucija razdvajanja proteina i cijena dvije tehnike također variraju.2D gel elektroforeza pokazuje visoku rezoluciju od 1D gel elektroforeza. Međutim, 2D gel elektroforeza je skuplja od 1D gel elektroforeza.
U nastavku infografika sumira razliku između 1D i 2D gel elektroforeze.
Sažetak – 1D vs 2D gel elektroforeza
Razdvajanje proteina zavisi od mnogih faktora. 1D gel elektroforeza razdvaja proteine samo na osnovu molekularne težine. Međutim, dvodimenzionalna ili 2D gel elektroforeza povećava rezoluciju odvajanja proteina. Nadalje, 2D gel elektroforeza razdvaja proteine na osnovu izoelektrične tačke i molekularne težine. Stoga su ovi podaci važni za daljnju obradu proteina iu polju proteomike. Dakle, ovo je sažetak razlike između 1D i 2D gel elektroforeze.
