Ključna razlika između kompozitnih transpozona i IS elemenata je u tome što su kompozitni transpozoni vrsta transpozona koji nose pomoćne gene kao što su geni otpornosti na antibiotike, dok su IS elementi (ili elementi Insertion Sequence) prenosivi elementi koji nose samo gene koji transpozicija koda koja katalizuje aktivnost transpozicije.
Transpozon je fragment DNK koji može promijeniti svoju poziciju unutar bakterijskog genoma. Stoga su to pokretne DNK sekvence. Oni se kreću na nove lokacije genoma, praveći promjene u sekvenci bakterijskog genoma, uzrokujući značajne promjene u genetskim informacijama. Transpozoni su također poznati kao geni za skok jer mogu blokirati transkripciju gena i preurediti genetski materijal bakterije. Štaviše, oni su odgovorni za kretanje gena rezistencije na lijekove, antibiotike između plazmida i hromozoma. Kompozitni transpozoni i IS elementi su dvije vrste mobilnih genetskih elemenata koji se nalaze u bakterijama. Oba se mogu kretati s jedne lokacije na drugu u genomu.
Šta su kompozitni transpozoni?
Kompozitni transpozon je segment DNK okružen sa dvije kopije sličnih elemenata sekvence insercije. U kompozitnom transpozonu postoji centralna regija koja kodira protein. Geni su često geni otporni na antibiotike. Takođe mogu sadržavati kataboličke gene. Štaviše, kompozitni transposon se sastoji od dva invertirana ponavljanja. Cela dužina kompozitnog transposona se kreće kao jedna kompletna jedinica.
Slika 01: Kompozitni transpozon
Tn10 je kompozitni transpozon. Sastoji se od 6,5 kb centralnog kodirajućeg regiona (gen otporan na tetraciklin) i 1,4 kb invertiranih elemenata sekvence umetanja na svakom kraju. IS elementi dovode transpozazu. Transpozaza je enzim koji katalizuje kretanje transpozona. Kompozitni transpozoni se mogu pojačati, dizajnirajući prajmere za IS elemente.
Šta su IS elementi?
Elementi sekvence umetanja ili IS elementi su tip mobilnog genetskog elementa. Oni su jednostavan oblik transpozona. Oni nose samo gene koji kodiraju enzime transpozaze. Enzimi transpozaze kataliziraju transpoziciju transpozona. Strukturno, sekvenca kodiranja IS elemenata je flankirana sa dva invertirana ponavljanja. Na primjer, IS element koji se zove IS911 okružen je s dva invertirana ponovljena ekstremiteta od 36 bp.
IS elementi su najzastupljeniji autonomni prenosivi elementi u bakterijskom genomu. Stoga su izuzetno važni za organizaciju i evoluciju prokariotskog genoma. Nadalje, IS elementi se javljaju kao dijelovi kompozitnih transpozona. Generalno, dva IS elementa se nalaze pored kodnog niza kompozitnog transposona. Ali, jedinične transpozone ne nose bočne IS elemente.
Pošto IS elementi mogu da se kreću unutar genoma, oni mogu prekinuti kodirajuću sekvencu drugih gena i inaktivirati gene blokiranjem ekspresije.
Koje su sličnosti između kompozitnih transpozona i IS elemenata?
- I kompozitni transpozoni i IS elementi mogu promijeniti poziciju u bakterijskom genomu.
- Regija kodiranja u oba transpozona obično je okružena obrnutim ponavljanjima.
- Složeni transposon je okružen sa dva odvojena IS elementa.
Koja je razlika između kompozitnih transpozona i IS elemenata?
Kompozitni transpozoni su mobilni genetski elementi koji se sastoje od dvije insercione sekvence (IS) koje često prate jedan ili više gena otpornosti na antibiotike. S druge strane, IS elementi su vrsta jednostavnog prenosivog elementa koji sadrži gene koji kodiraju enzim transpozazu da katalizira transpoziciju. Dakle, ovo je ključna razlika između kompozitnih transposona i IS elemenata.
U nastavku je lista razlika između kompozitnih transposona i IS elemenata u tabelarnom obliku za usporedbu.
Sažetak – kompozitni transpozoni vs IS elementi
Genom bakterije ima genetske elemente koji su mobilni. Kompozitni transpozoni i IS elementi su dvije vrste mobilnih genetskih elemenata. Kompozitni transpozoni nose gene otporne na antibiotike i prateće IS elemente. IS elementi nose genetski kod za proizvodnju transpozaze koja katalizira kretanje transpozona. Dakle, ovo je ključna razlika između kompozitnih transposona i IS elemenata.
