Ključna razlika između DNK transpozona i retrotranspozona je u tome što su DNK transpozoni mobilni genetski elementi koji se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu koristeći mehanizam cut and paste, dok su retrotranspozoni mobilni genetski elementi koji se kreću s jednog mjesta drugom u genomu koristeći mehanizam kopiranja i lijepljenja.
Mobilni genetski elementi (MGE) su segmenti DNK koji kodiraju specifične enzime i proteine koji posreduju njihovo kretanje unutar genoma, ili koji se mogu prenijeti s jedne vrste na drugu. Poznati su i kao sebični genetski elementi. Prenosivi elementi predstavljaju jedan od nekoliko tipova mobilnih genetskih elemenata. Postoje dvije glavne vrste prenosivih elemenata: DNK transpozoni i retrotranspozoni. Stoga su DNK transpozoni i retrotranspozoni mobilni genetski elementi koji se mogu kretati s mjesta na mjesto u genomu.
Šta su DNK transpozoni?
DNK transpozoni su mobilni genetski elementi koji se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma rezanja i lijepljenja. Oni pripadaju klasi II prenosivih elemenata koji se kreću kroz DNK intermedijer. Ovo je suprotno transpozibilnim elementima klase I (retrotranspozoni) koji se kreću kroz RNA intermedijer. Obično se DNK transpozoni kreću po genomu koristeći metodu rezanja i lijepljenja. Ova metoda zahtijeva enzim transpozazu koji katalizira kretanje DNK sa njegove trenutne lokacije u genomu i umetanje na novu lokaciju.
Slika 01: DNK transpozoni
Ova transpozicija zahtijeva tri DNK mjesta na transpozonu (dva na svakom kraju transpozona koji se nazivaju terminalni invertirani ponavljanja i jedno na ciljnom mjestu). Enzim transpozaze će se vezati za terminalne obrnute ponavljanja transpozona i posreduje sinapsu krajeva transpozona. Zatim enzim transpozaza odvaja element od bočne DNK originalnog mjesta donora i posreduje u spajanju transpozona na novo mjesto umetanja u genomu. Dodavanje transposona na novu lokaciju uzrokuje kratke praznine na obje strane umetnutog segmenta. Sistemi domaćini popravljaju ove praznine, što rezultira dupliciranjem ciljne sekvence (TSD), što je karakteristično za transpoziciju.
Šta su retrotranspozoni?
Retrotranspozoni su mobilni genetski elementi koji se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu koristeći mehanizam kopiranja i lijepljenja. Spadaju u klasu I prenosivih elemenata. Prenosivi elementi klase I (retrotranspozoni) kreću se kroz RNA intermedijer u genomu. Oni su vrsta genetske komponente koja se kopira i zalijepi na različite genomske lokacije.
Slika 02: Retrotranspozoni
Prvo, oni se transkribiraju iz DNK u RNK. Zatim se proizvedena RNK reverzno transkribuje u DNK. Ova kopirana DNK se kasnije ubacuje nazad u genom na novoj lokaciji. Reverznu transkripciju katalizira reverzna transkriptaza. Reverznu transkriptazu često kodira sam retrotranspozon. Integraciju vrši enzim koji se zove integraza. Nadalje, obično postoje tri tipa: dugi terminalni ponavljanja (LTR), dugo interspersirani nuklearni elementi (LINE) i kratki interspersirani nuklearni elementi (SINE).
Koje su sličnosti između DNK transpozona i retrotranspozona?
- DNK transpozoni i retrotranspozoni su mobilni genetski elementi.
- Oba su klasifikovana kao prenosivi elementi.
- Oba su poznata kao geni za skokove.
- Mogu se kretati s mjesta na mjesto u genomu.
- Oni su evolucijski veoma važni.
Koja je razlika između DNK transpozona i retrotranspozona?
DNK transpozoni su mobilni genetski elementi koji se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu korištenjem mehanizma rezanja i lijepljenja, dok su retrotranspozoni mobilni genetski elementi koji se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću kopije i mehanizam za lepljenje. Dakle, ovo je ključna razlika između DNK transpozona i retrotranspozona. Nadalje, DNK transpozoni spadaju u klasu II prenosivih elemenata, dok retrotranspozoni pripadaju klasi I prenosivih elemenata.
Sljedeća infografika predstavlja razlike između DNK transpozona i retrotranspozona u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – DNK transpozoni vs retrotranspozoni
DNK transpozoni i retrotranspozoni su mobilni genetski elementi. DNK transpozoni se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu pomoću mehanizma rezanog paste. Retrotranspozoni se kreću s jednog mjesta na drugo u genomu koristeći mehanizam kopiranja i lijepljenja. Dakle, ovo rezimira razliku između DNK transpozona i retrotranspozona.
