Ključna razlika između SF1 i SF2 je njihova sposobnost da odmotaju nukleinske kiseline. Dok SF1 odmotava samo DNK, SF2 odmotava i DNK i RNK.
Helikaza je jedan od ključnih enzima koji učestvuju u procesu replikacije DNK, kao iu procesima popravke DNK. Primarna uloga helikaze je da učestvuje u procesu odmotavanja kako bi se olakšalo odvajanje dvolančanih molekula DNK. Aktivnost enzima je neophodna tokom faze inicijacije replikacije DNK. Helikaze se dijele na Super Family 1 i Super Family 2 prvenstveno na osnovu njihovih strukturnih razlika. Unutar svake Super porodice postoji više različitih tipova helikaza.
Šta je SF1?
Super Family 1 helikaza je tip helikaze koja se sastoji od heksameričke strukture uz unutrašnji protein jezgre, koji prikazuje aktivnost helikaze. SF1 helikaza je jedna od najvećih klasa helikaza i može se dalje kategorizirati kao SF1A helikaze i SF1B helikaze. Proteini kao što su PcrA, Rep i UvrD, pripadaju klasi SF1A helikaza. Za poređenje, proteini poput RecA i Dda pripadaju klasi SF1B helikaza. Funkcije SF1 helikaza uvelike variraju. Neke od vitalnih funkcija SF1 helikaza uključuju replikaciju DNK, rekombinaciju DNK, obradu Okazaki fragmenta, formiranje telomera i popravak oštećenja DNK ekscizijom nukleotida. Kod nekih bakterijskih vrsta, SF1 tip helikaza također učestvuje u pomaganju horizontalnog prijenosa gena putem konjugacije. Nadalje, u virusima, SF1 helikaze pomažu u replikaciji virusa.
Slika 01: Helicase Akcija
Postoji mnogo različitih motiva povezanih sa strukturom SF1 helikaza. Sadrže najmanje 7 očuvanih motiva među svim različitim tipovima SF1 helikaza (Q, I, Ia, II, III, IV, V i VI). Struktura SF1 helikaze je kristal, gdje su motivi skupljeni zajedno. Postoji karakterističan džep za vezivanje ATP-a između motiva i mesta vezivanja DNK. Nekonzervirani domeni se distribuiraju kako bi se održao strukturni integritet molekula helikaze. Ovi domeni mogu varirati između SF1A helikaza i SF1B helikaza.
Šta je SF2?
Super porodica 2 helikaza je jedna od najraznovrsnijih grupa superfamilija helikaza. Postoji mnogo tipova SF2 helikaza kao što su helikaze slične RecQ, helikaze slične RecG, Rad3/XPD i NS3 helikaze. Neki restrikcijski enzimi, kao što su restrikcijski enzimi tipa I, također spadaju u ovu kategoriju. Opća funkcija SF2 helikaza je odmotavanje dvolančane DNK. Međutim, neke vrste SF2 helikaza nemaju sposobnost da u potpunosti djeluju kao enzimi helikaze. SF2 helikaze se takođe široko koriste u obradi RNK. DEAD-box familija SF2 helikaza učestvuje u procesuiranju RNA, uključujući transkripciju, spajanje, obradu translacije i sastavljanje kompleksa RNA-protein.
Slika 02: Helicase
Struktura SF2 helikaze takođe sadrži konzervirane motive. Međutim, neki domeni se neznatno razlikuju od domena SF1 helikaze. Oni također sadrže ATP vezujući domen osim domene za vezivanje DNK.
Koje su sličnosti između SF1 i SF2?
- SF1 i SF2 pokazuju aktivnost helikaze.
- Štaviše, oboje učestvuju u replikaciji i rekombinaciji DNK.
- SF1 i SF2 sastavljeni su od konzerviranih motiva.
- Oba imaju ATP vezujuću domenu i DNK vezujuću domenu.
- Ovi oblici su proteini sa više domena.
- Štaviše, ako se dogode mutacije u bilo kojem tipu, to će rezultirati štetnim efektima.
- I SF1 i SF2 su ključni za osiguranje kontinuiteta ćelijskog ciklusa.
- SF1 i SF2 se nalaze kod prokariota kao i kod eukariota.
Koja je razlika između SF1 i SF2?
SF1 i SF2 su dvije super porodice helicase. Oni pokazuju široku raznolikost. Ključna razlika između SF1 i SF2 je u tome što je SF1 prvenstveno uključen u odmotavanje DNK, dok SF2 takođe učestvuje u obradi RNK tokom transkripcije i translacije. Kada se porede različiti motivi proteina, SF1 i SF2 se prvenstveno razlikuju na osnovu motiva III i motiva IV. Iako imaju strukturnu sličnost, SF1 helikaze formiraju toroidne heksamerne strukture dok SF2 ne formira ove strukturne aranžmane.
Još jedna razlika između SF1 i SF2 je u tome što SF1 helikaze više vole adenin nukleotide, dok SF2 helikaze preferiraju svih pet nukleotida da ciljaju za odmotavanje. Kada se uporedi smjer odmotavanja, SF1 helikaze se translociraju samo u smjeru 5’ do 3’, dok SF2 helikaze imaju sposobnost da se translociraju zajedno s nukleinskim kiselinama u oba smjera.
Infografika ispod predstavlja razlike između SF1 i SF2 u tabelarnom obliku za usporedbu.
Sažetak – SF1 vs SF2
Helikaze su veoma važna i raznolika grupa enzima koji učestvuju u replikaciji DNK. Međutim, zbog svoje velike raznolikosti, enzimi su kategorizirani u superfamilije. SF1 i SF2 su dvije najveće super porodice helikaza. Dok je SF1 prvenstveno povezan sa obradom vezanom za DNK, SF2 je povezan i sa obradom DNK i RNK. Dakle, ovo je ključna razlika između SF1 i SF2. Nadalje, SF1 i SF2 se također razlikuju po svom strukturnom rasporedu jer SF2 ne formira heksamerne strukture. Mutacije u SF1 i SF2 helikazama dovest će do razvoja raka nakon disregulacije ćelijskog ciklusa i drugih vitalnih mehanizama kao što je popravak DNK.
