Ključna razlika između NAAT-a i PCR-a je u tome što je NAAT-a koji umnožava genetski materijal koristeći nekoliko načina, uključujući lančanu reakciju polimeraze, pomicanje niti ili amplificiranje posredovano transkripcijom, dok je PCR metoda koja umnožava genetski materijal koristeći samo termalni biciklizam.
Patogeni se uglavnom identifikuju amplifikacijom njihovog genetskog materijala. Većina tehnika u ovoj oblasti fokusira se na otkrivanje genetskog materijala patogena pojačavanjem specifičnih sekvenci u realnom vremenu. Stoga se rezultati u dijagnostičkom kontekstu proizvode vrlo brzo. NAAT, PCR, biosenzor i LCR su nekoliko tehnika koje se koriste u laboratorijama za amplifikaciju genetskog materijala patogena.
Šta je NAAT?
Test amplifikacije nukleinske kiseline (NAAT) je metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal koristeći nekoliko načina kao što su lančana reakcija polimeraze, amplifikacija pomjeranja lanca ili amplifikacija posredovana transkripcijom. Amplifikacija genetskog materijala se također može obaviti kroz tehnike kao što su lančana reakcija ligacije i reakcija razgranate DNK (quantiplex b DNK) u NAAT proceduri. NAAT koristi specifičnost uparivanja baza Watson-Crick. U NAAT proceduri, jednolančana sonda ili prajmer molekul se hibridizuje sa ciljnom DNK ili RNK molekulom. Stoga je dizajn lanca sonde veoma važan za povećanje osjetljivosti i specifičnosti detekcije. Zatim, sljedeći korak NAAT-a umnožava genetski materijal praveći mnoge njegove kopije za detekciju.
Slika 01: NAAT
NAAT se trenutno primjenjuje za detekciju nekoliko patogena kao što su Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis i SARS-COV2. Štaviše, NAAT test je razvijen da skrati vremenski period. Period prozora je vremenski period između trenutka kada je pacijent zaražen i kada se pokažu pozitivnim testovima na antitijela. Nadalje, NAAT metoda skrininga je prvi put odobrena 1999. godine od strane FDA. NAAT ima mnoge prednosti uključujući detekciju niskog nivoa DNK ili RNK, visoku osjetljivost i visoku specifičnost.
Šta je PCR?
PCR je metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal koristeći samo termalni ciklus. PCR je skraćenica od lančane reakcije polimeraze. To je test za otkrivanje genetskog materijala iz određenog organizma kao što su bakterije, gljive i virusi. U dijagnostici bolesti, PCR otkriva prisustvo patogena ako osoba ima patogen u vrijeme testa. U dijagnostici bolesti, PCR protokol ima nekoliko koraka, uključujući prikupljanje uzoraka, ekstrakciju DNK, PCR i sekvenciranje. U testiranju patogena, prikupljeni uzorak se koristi za ekstrakciju genetskog materijala (DNK ili RNK). PCR procedura zahteva posebne hemikalije, prajmere i enzime kako bi se proizveli milioni kopija genetskog materijala unutar PCR mašine koja se zove termalni ciklus. Jednom amplificiran iz PCR proizvoda, patogen se može otkriti. Naučnici koriste poseban softver za tumačenje rezultata.
Slika 02: PCR
Dalje, postoje različite vrste PCR-a koje se trenutno koriste u istraživanju. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD i Nested PCR su nekoliko među njima. PCR je koristan posebno u otkrivanju faringitisa (Streptococcl pharyngitis), atipične pneumonije (Chlymydia pneumoniae), malih boginja (Morbillivirus), hepatitisa (HBV) i ulcerativne urogenitalne infekcije (Haemophilus ducreyi).
Koje su sličnosti između NAAT-a i PCR-a?
- NAAT i PCR su dvije važne molekularne biološke metode koje se koriste za umnožavanje genetskog materijala.
- Nukleinske kiseline (DNK ili RNA) se amplificiraju objema tehnikama.
- To su brze i brze tehnike.
- Obje tehnike se trenutno koriste za dijagnozu bolesti.
- Skuplje su od konvencionalnih metoda.
Koja je razlika između NAAT-a i PCR-a?
NAAT je metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal koristeći nekoliko metoda, dok je PCR metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal koristeći samo termalni ciklus. NAAT koristi različite tehnike amplifikacije genetskog materijala kao što su lančana reakcija polimeraze, amplifikacija pomjeranja lanca, amplifikacija posredovana transkripcijom, lančana reakcija ligacije i reakcija razgranate DNK (kvantiplex b DNK). S druge strane, PCR koristi različite tehnike amplifikacije genetskog materijala kao što je RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, Nested PCR. Dakle, ovo je ključna razlika između NAAT-a i PCR-a.
Infografika ispod predstavlja razlike između NAAT-a i PCR-a u obliku tabele radi usporedbe.
Sažetak – NAAT vs PCR
Postoje različiti molekularno biološki alati koji se koriste u laboratorijama za umnožavanje genetskih materijala. NAAT, PCR, biosenzor i LCR su nekoliko takvih tehnika. NAAT je molekularna biološka tehnika koja umnožava genetski materijal koristeći nekoliko načina kao što su lančana reakcija polimeraze, pomicanje niti ili amplifikacija posredovana transkripcijom. PCR je metoda u molekularnoj biologiji koja umnožava genetski materijal korištenjem termičkog ciklusa. Dakle, ovo je ključna razlika između NAAT-a i PCR-a.
