Ključna razlika između LAMP i PCR testa je u tome što se LAMP provodi na konstantnoj temperaturi (60-650C) kako bi se proizvele kopije DNK kroz amplifikaciju, dok se PCR provodi koristeći seriju temperaturnih promjena za proizvodnju kopija DNK kroz amplifikaciju.
LAMP i PCR su obje tehnike in-vitro amplifikacije koje se koriste za proizvodnju hiljada kopija DNK. Količina DNK proizvedene u LAMP-u je mnogo veća od količine proizvedene u PCR tehnikama kao što je RT-PCR. LAMP je novija tehnika u odnosu na PCR tehniku. Ali tehnički je jednostavan i lak za izvođenje obučenog naučnika u laboratorijskim uslovima. To ga čini potencijalno korisnom tehnikom za otkrivanje COVID-19. Međutim, RT-PCR je trenutni standardni test za COVID-19. Ove tehnike, iako su dobro poznate istraživačima i kliničarima sa iskustvom u amplifikaciji DNK, još uvijek mogu biti relativno nepoznate široj zajednici.
Šta je LAMP Test?
Izotermna amplifikacija posredovana petljom (LAMP) za testove na COVID-19 počinje prikupljanjem uzoraka iz nosa ili grla pomoću brisa. Uzorci se mogu sakupljati i drugim metodama kao što je sluz od jakog kašlja. Kao i PCR tehnika kao što je RT-PCR, virusna RNK u uzorku se prvo pretvara u DNK, što omogućava njeno kopiranje. LAMP reakcija se izvodi na konstantnoj temperaturi (60-650C).
Amplifikacija virusne DNK koja uključuje LAMP tehnologiju i reagense može se otkriti kada se reakcijska smjesa zamuti zbog proizvodnje “magnezijum pirofosfata”. Ova oblačnost omogućava naučnicima i kliničarima laku dijagnozu COVID-19. Preciznost rezultata ispitivanja može se poboljšati upotrebom specijalnih fluorescentnih boja ili boja koje mijenjaju boju u reakcijskoj smjesi. Ove boje stupaju u interakciju s virusnom DNK, a intenzitet promjene svjetla ili boje može se izmjeriti kako bi se dobio približni broj molekula virusne RNK koji je inicijalno bio u uzorku.
Šta je PCR test?
PCR je vrlo uobičajena naučna tehnika koja se naširoko koristi u istraživanju i medicini već 20-30 godina za otkrivanje DNK. PCR testovi se koriste direktno za otkrivanje antigena otkrivanjem virusne RNK. Općenito, virusna RNK je prisutna u tijelu prije otkrivanja antitijela ili pojave simptoma bolesti. Stoga, PCR test može utvrditi da li neko ima virus ili ne. Trenutno je PCR standardni test za otkrivanje COVID-19. Postoje različite vrste PCR tehnika kao što su PCR u realnom vremenu, ugniježđeni PCR, multipleks PCR, vrući start PCR i PCR dugog dometa, itd. PCR koristi seriju temperaturnih promjena za proizvodnju kopija DNK kroz amplifikaciju.
RT-PCR je posebna verzija PCR tehnike. Koristi se kada se detektuje RNK. Sada se koristi za testiranje na COVID-19. RT-PCR je prilično osjetljiva i pouzdana tehnika. U RT-PCR, kada se uzorak prikupi, hemikalije se koriste za uklanjanje neželjenih proteina, masti i drugih molekula, ostavljajući RNK iza sebe. Enzimi kompleta za testiranje prvo pretvaraju RNK u DNK, koja zatim umnožava virusnu DNK kako bi otkrila virus. Fluorescentne boje se obično koriste za vezivanje za pojačanu DNK i proizvodnju svjetlosti. Ovo može biti pročitano od strane mašine kako bi se proizveo rezultat testa.
Koje su sličnosti između LAMP i PCR testa?
- To su tehnike pojačanja.
- Oba proizvode kopirani DNK.
- One su vrlo osjetljive i pouzdane tehnike od imunoloških tehnika kao što je detekcija antitijela.
- Obe se koriste za testiranje na COVID-19.
Koja je razlika između LAMP i PCR testa?
Ključna razlika između LAMP i PCR testova je u tome što se kod LAMP-a amplifikacija postiže upotrebom konstantne temperature (60-650C), dok se u PCR-u ciklično potrebne su temperature. Trenutno je dostupno nekoliko vrsta LAMP tehnika. Ali najvažnije za otkrivanje COVID-19 su izotermalna tehnika posredovana petljom reverzne transkripcije (RT-LAMP) i amplifikacija posredovana transkriptom (TMA). Nadalje, različite vrste PCR tehnika su također trenutno dostupne u kliničkoj praksi za dijagnozu bolesti kao što su PCR u realnom vremenu, RT-PCR, ugniježđeni PCR, multipleks PCR, hot-start PCR, PCR dugog dometa, itd.
Infografika ispod navodi razlike između LAMP i PCR testa u obliku tabele.
Sažetak – LAMP vs PCR test
Izotermna amplifikacija posredovana petljom je sličan proces PCR testovima kao što je RT-PCR, ali proizvodi više kopija virusne DNK na konstantnoj temperaturi. Test lančane reakcije polimerazom trenutno je najčešći i standardni oblik testiranja u svijetu za dijagnostiku bolesti, kao što je dijagnoza COVID-19. Smatra se prilično pouzdanim. PCR koristi niz temperaturnih promjena za proizvodnju kopija DNK kroz amplifikaciju. Dakle, ovo rezimira razliku između LAMP i PCR testa.
