Ključna razlika između EcoRI i HindIII restrikcijskih enzima je u tome što je EcoRI restrikcijski enzim tipa II koji je izolovan iz E. coli, dok je HindIII restrikcijski enzim tipa II koji je izolovan iz Haemophilus influenza..
Restrikcioni enzim ili restrikcijska endonukleaza je enzim koji cijepa DNK na fragmente na specifičnim mjestima prepoznavanja (restrikcijskim mjestima) unutar molekule DNK. Ovi restrikcijski enzimi nalaze se u bakterijama i arhejama. Oni pružaju odbrambeni mehanizam protiv invazije virusa. Restrikcioni enzimi su generalno klasifikovani u pet različitih tipova: tip I, tip II, tip III, IV i tip V. EcoRI i HindIII su dva restrikcijska enzima koja pripadaju grupi restrikcijskih enzima tipa II.
Šta su EcoRI restrikcijski enzimi?
EcoRI je restrikcijski enzim tipa II koji je izoliran iz vrste E.coli. To je restrikcijski enzim koji cijepa dvostruke spirale DNK na fragmente na određenim mjestima. EcoRI je također dio sistema ograničenja i modifikacija. EcoRI je bio prvi enzim koji je prvobitno izolovan iz RY13 soja vrste E. coli. Koristi se kao restrikcijski enzim u molekularnoj biologiji. EcoRI stvara ljepljiva kraja od 4 nukleotida sa 5’ krajnjim prevjesima AATT. EcoRI reže DNK na specifičnoj sekvenci prepoznavanja G↓AATTC. Ima palindromsku komplementarnu sekvencu CTTAA↓G. Štaviše, ovaj restrikcijski enzim pripada podklasi tipa II P (palindromska specifičnost). U svojoj primarnoj strukturi, EcoRI sadrži PD. D/EXK motiv unutar svog aktivnog mjesta, kao i mnogi drugi restrikcijski enzimi.
Slika 01: EcoRI
EcoRI restrikcijski enzim je homodimer od 31 kDa. Sadrži jedan globularni domen α/β arhitekture. Svaka podjedinica sadrži petlju koja strši iz globularnog domena i obavija DNK kada je vezana. Ovaj enzim se može kokristalizirati s sekvencom koju obično seče. Nadalje, restrikcijski enzim EcoRI se koristi u širokom spektru molekularno genetskih tehnika, uključujući kloniranje, DNK skrining i delecione dijelove DNK in-vitro uslova.
Šta su HindIII restrikcijski enzimi?
HindIII je restrikcijski enzim tipa II koji je izolovan iz vrste Haemophilus influenza. On cijepa DNK palindromsku sekvencu AACCTT u prisustvu kofaktora Mg2+ putem hidrolize. Cepanje ove određene sekvence između AA’S (5’A↓ACCTT3’ i 3’TTCGA↓A5’) dovodi do 5’ prepusta na molekulu DNK koji se naziva lepljivim krajevima. Ovaj enzim se nalazi u prokariotskim organizmima poput bakterija. Bakterije koriste ovaj enzim kao odbrambeni mehanizam protiv virusa kao što su bakteriofagi.
Slika 02: HindIII
Strukturno, HindIII je homodimer. Sadrži zajedničko strukturno jezgro koje se sastoji od četiri β lista i jedne α spirale, kao i druge vrste II restrikcionih enzima. Molekularna masa ovog enzima je 34,9 kDa. Nadalje, HindIII je vrlo koristan u modernim molekularno-biološkim naučnim eksperimentima kao što su sekvenciranje i mapiranje DNK.
Koje su sličnosti između EcoRI i HindIII restrikcijskih enzima?
- EcoRI i HindIII su dva restrikcijska enzima koji pripadaju grupi restrikcijskih enzima tipa II.
- EcoRI i HindIII su pronađeni ranih 1970-ih.
- EcoRI i HindIII sadrže motiv sekvence aminokiselina PD.. D/EXK.
- Oba restrikcijska enzima vrše vrlo specifično cijepanje DNK.
- Ovim restrikcijskim enzimima je potreban Mg2+ kao kofaktor za njihovu specifičnu aktivnost.
- Proizvode ljepljive krajeve nakon rezanja DNK.
- One su veoma korisne komponente u modernim molekularno-biološkim istraživanjima.
Koja je razlika između EcoRI i HindIII restrikcijskih enzima?
EcoRI je restrikcijski enzim tipa II koji je izolovan iz vrste E.coli, dok je HindIII restrikcijski enzim tipa II izolovan iz vrste Haemophilus influenza. Dakle, ovo je ključna razlika između EcoRI i HindIII. Nadalje, EcoRI seče DNK na specifičnoj sekvenci prepoznavanja G↓AATTC, dok HindIII seče DNK na specifičnoj sekvenci prepoznavanja A↓ACCTT.
Infografika ispod predstavlja razlike između EcoRI i HindIII u tabelarnom obliku za usporedbu.
Sažetak – EcoRI vs HindIII restrikcijski enzimi
EcoRI i HindIII su dva restrikcijska enzima koji pripadaju podklasi tipa II p. Oni vrše vrlo specifično cijepanje DNK. EcoRI je restrikcijski enzim tipa II koji je izolovan iz vrste E.coli, dok je HindIII restrikcijski enzim tipa II izolovan iz vrste Haemophilus influenza. Dakle, ovo rezimira razliku između EcoRI i HindIII.
