Ključna razlika između replikativne transpozicije i transpozicije cut and paste je u tome što se u replikativnoj transpoziciji transpozon kopira na novu lokaciju, dok se u transpoziciji cut and paste transposon premješta na novu lokaciju.
transposabilni elementi ili skokovi geni su DNK sekvence koje mogu promijeniti svoju poziciju unutar genoma. Ovo se naziva transpozicija. Transpozicija ponekad može stvoriti ili preokrenuti mutacije i promijeniti genetski identitet ćelije i veličinu genoma. Transpoziciju je otkrila Barbara McClintock 1983. Transpozicija se može odvijati kroz dvije tehnike kao što su dupliciranje i izrezivanje i lijepljenje.
Šta je replikativna transpozicija?
Replikativna transpozicija je vrsta mehanizma transpozicije koji pomaže eksciziji transposona sa nativne lokacije na drugu putem replicirane ili duplicirane tehnike. Ovaj mehanizam je prvi pronašao James A Shapiro 1979. U ovom mehanizmu, transponirajući element se duplira tokom reakcije transpozicije tako da je transponirajući entitet kopija originalnog elementa. Štaviše, u ovom mehanizmu, sekvence DNK donora i receptora formiraju karakterističnu intermedijarnu “theta” konfiguraciju nazvanu Shapiro intermedijer (kointegriraju). Replikativna transpozicija je karakterističan retrotranspozon. Ovaj mehanizam se obično javlja u transpozonima klase I.
Slika 01: Replikativna transpozicija
Dobar primjer replikativne transpozicije može se uočiti u transpozonu E. coli TN3. TN3 transpozon se može premjestiti sa originalnog plazmida na drugi ciljni plazmid putem replicirane ili duplicirane tehnike. Cijeli ovaj događaj posreduju dva važna enzima nazvana transpozaza i rezolvaza. Nadalje, replikativna transpozicija se može uočiti i u DNK transpozonima i u retropozonima. Najbolje proučavan prenosivi bakterijski virus je bakteriofag Mu.
Šta je transpozicija Cut and Paste?
Transpozicija izrezati i zalijepiti je vrsta mehanizma transpozicije koji pomaže transposonskoj eksciziji sa nativne lokacije na drugu kroz tehniku rezanja i lijepljenja. Ovaj mehanizam je također poznat kao konzervativni model transpozicije. U ovoj nereplikacijskoj transpoziciji, ekscizija i integracija transpozona s jedne genomske lokacije na drugu odvija se bez ostavljanja kopije za sobom.
Slika 02: Izrežite i zalijepite transpoziciju
U ovom mehanizmu, enzim transpozaze se prvo veže za terminalne ponavljače koji su obično prisutni na oba kraja transpozona, a zatim formira strukturu koja se zove sinaptički kompleks (transpososome). Sinaptički kompleks cijepa transpozon s njegove originalne genomske lokacije i integrira ga u novu ciljnu lokaciju. Nakon toga, transpozaze odlaze sa oba kraja transpozona. Kada enzim transpozaze napusti transpozon, praznine se popunjavaju enzimom polimeraze domaćina. Ovo omogućava potpuno spajanje transpozona na novu genomsku lokaciju. Ovaj mehanizam se obično javlja kod transpozona klase II. Nadalje, TN5 bakterijski transpozoni su dobro poznati primjer koji pokazuje konzervativni ili isjeci i zalijepi mehanizam transpozicije.
Koje su sličnosti između replikativne transpozicije i transpozicije Cut and Paste?
- Replikativna transpozicija i transpozicija cut i paste su dvije vrste mehanizama transpozicije.
- U oba mehanizma, prenosivi elementi se kreću sa jedne genomske lokacije na drugu novu genomsku lokaciju.
- Oba mehanizma mogu stvoriti ili preokrenuti mutacije i promijeniti genetski identitet ćelije.
- Bakterijski transpozoni pokazuju oba mehanizma.
- Oni su izuzetno važni događaji za evoluciju.
Koja je razlika između replikativne transpozicije i transpozicije Cut and Paste?
Replikativna transpozicija je vrsta mehanizma transpozicije gdje se transpozon kopira na novu lokaciju, dok je transpozicija cut and paste tip mehanizma transpozicije gdje se transpozon premješta na novu lokaciju. Dakle, ovo je ključna razlika između replikativne transpozicije i transpozicije cut and paste. Nadalje, replikativna transpozicija se obično javlja u transpozonima klase I, dok se transpozicija cut i paste normalno događa u transpozonima klase II.
Infografika ispod predstavlja razlike između replikativne transpozicije i transpozicije izrezati i zalijepiti u obliku tabele radi usporedbe uporedo.
Sažetak – replikativna transpozicija naspram transpozicije izrezati i zalijepiti
Replikativna transpozicija i transpozicija cut i paste su dvije vrste mehanizama transpozicije. Replikativna transpozicija je vrsta mehanizma transpozicije gdje se transpozon kopira na novu lokaciju, dok je transpozicija cut and paste tip mehanizma transpozicije gdje se transpozon premješta na novu lokaciju. Dakle, ovo rezimira razliku između replikativne transpozicije i transpozicije cut and paste.
