Ključna razlika – YAC vs BAC vektori
Vektori se koriste u molekularnom kloniranju. Vektor se može definirati kao molekul DNK koji se ponaša kao sredstvo za prenošenje stranog genetskog materijala u drugu ćeliju. Vektor koji sadrži stranu DNK poznat je kao rekombinantna DNK i treba da ima sposobnost replikacije i ekspresije unutar organizma domaćina. Umjetni hromozom kvasca (YAC) i bakterijski umjetni hromozom (BAC) su dvije vrste vektora uključenih u kloniranje. Ključna razlika između YAC i BAC je u tome što je YAC umjetno konstruirani vektorski sistem koji koristi specifičnu regiju hromozoma kvasca za umetanje velikih segmenata genetskog materijala u ćelije kvasca, dok je BAC umjetno konstruirani vektorski sistem koji koristi specifičnu regiju E.coli hromozom za umetanje velikih segmenata DNK u ćelije E. coli.
Šta su YAC vektori?
YAC (vještački hromozom kvasca) je umjetno izgrađen hromozom koji ima sposobnost da nosi veliki segment stranog DNK i replicira se unutar ćelija kvasca. Ima centromere, telomere kao i sekvence koje se autonomno repliciraju koje su neophodne za replikaciju i stabilnost. YAC takođe treba da nosi selektivni marker ili markere i restrikciona mesta kako bi bio efikasan vektor za kloniranje. Velika sekvenca u rasponu od 1000 kb do 2000 kb može se umetnuti u YAC i prenijeti u kvasac. Efikasnost transformacije YAC-a je veoma niska.
Slika 01: YAC Vector
Šta su BAC vektori?
Bakterijski veštački hromozom (BAC) je veštački konstruisan hromozom za molekularno kloniranje. Ima specifične regije E. coli F plazmida i kružnog je i super namotanog. BAC je razvijen za kloniranje fragmenata DNK u bakterije, posebno u E. coli. Može nositi fragmente DNK veličine do 300 kb. U poređenju sa YAC, BAC umetci za kloniranje su manje veličine. BAC-ovi su razvijeni 1992. godine i još uvijek su popularni zbog svoje stabilnosti i lakoće konstrukcije. BAC su takođe korisni u razvoju vakcina.
Slika 02: BAC vektor u molekularnom kloniranju
Koja je razlika između YAC i BAC vektora?
YAC vs BAC Vectors |
|
| YAC je genetski modifikovan hromozom sa upotrebom DNK kvasca u svrhu kloniranja. | BAC je genetski modificirana molekula DNK koja koristi DNK E. coli u svrhu kloniranja. |
| Spol | |
| YACs su dizajnirani da kloniraju velike fragmente genomske DNK u kvasac. | BAC su razvijeni za kloniranje velikih genomskih fragmenata u Escherichia coli. |
| Insert Length | |
| YAC-ovi mogu sadržavati genomske umetke veličine megabaze.(1000 kb – 2000 kb). | BAC-ovi mogu nositi umetke od 200–300 kb ili manje. |
| Izgradnja | |
| YAC DNK je teško pročistiti netaknutu i zahtijeva visoku koncentraciju za generiranje YAC vektorskog sistema. | BAC se lako pročišćava netaknut i može se lako konstruisati. |
| Himerizam | |
| YAC-i su često himerični. | BAC-i su rijetko himerni. |
| Stabilnost | |
| YAC je nestabilan. | BAC je stabilan. |
| Izmjene | |
| Rekombinacija kvasca je vrlo izvodljiva i uvijek ostaje aktivna. Stoga može generirati brisanja i druga preuređivanja u YAC-u. | E. coli rekombinacija je spriječena i uključuje se po potrebi. Dakle, smanjuje neželjena preuređivanja u BAC-ovima. |
| Održavanje | |
| Manipulacija rekombinantnim YAC obično zahtijeva da se YAC prenese u E. coli radi naknadne manipulacije. Dakle, to je naporan proces. | BAC modifikacija se dešava direktno u E. coli. Dakle, nema potrebe za transferom DNK. Dakle, proces nije naporan. |
Sažetak – YAC vs BAC Vectors
YAC je postao osnovni istraživački alat u procesima kloniranja zbog svoje sposobnosti da klonira velike fragmente DNK u organizam domaćina. Međutim, YAC-ovi imaju nekoliko nedostataka kao vektora kao što su poteškoće u konstrukciji, himerizam, nestabilnost, itd. Stoga su naučnici razvili BAC vektore da bi prevazišli ove probleme. BAC je konstruisan korišćenjem specifičnih regiona hromozoma E. coli. To je stabilan vektor i lako se može konstruisati. Međutim, dužina DNK koju BAC može podnijeti je do 20 puta manja od dužine YAC-a. Ovo je razlika između YAC i BAC vektorskih sistema. Danas je u laboratorijama BAC poželjniji od YAC-a.
