Ključna razlika između introna grupe I i grupe II je u tome što u intronima grupe I, reakciju spajanja inicira kofaktor guanozina, dok u intronima grupe II, reakciju spajanja inicira unutrašnji adenozin.
Pre-mRNA je primarni transkript koji ima i introne i egzone. Pre-mRNA bi se trebala pretvoriti u mRNA prije translacije. RNA spajanje ili pre-mRNA spajanje je jedna takva post-transkripcijska modifikacija. U RNA spajanju, introni se uklanjaju iz pre-mRNA molekula, a egzoni se spajaju. Introni Grupe I i Grupe II su introni koji se sami spajaju. Oni se odvajaju od pre-mRNA molekula bez pomoći bilo kojeg drugog enzima. Stoga su to RNA enzimi ili ribozimi koji kataliziraju vlastito spajanje iz pre-mRNA. Štaviše, imaju sposobnost da funkcionišu kao mobilni elementi. Tokom spajanja, odvija se niz reakcija transesterifikacije kako bi se izrezao intron i ligirali egzoni. Ovi ribozimi su prisutni u sve tri domene, uključujući bakterije, arheje i eukariote.
Šta su introni grupe I?
Introni grupe I su vrsta ribozima koji se sami spajaju koji se nalaze u bakterijama, bakteriofagima i eukariotima (organelarni i nuklearni genomi). Nalaze se u esencijalnim genima. Oni su u stanju da kataliziraju vlastito spajanje iz pre-mRNA molekula. Introni grupe I mogu imati nekoliko stotina do tri hiljade nukleotida. Štaviše, oni pokazuju malu sličnost niza među organizmima.
Slika 01: Grupa I Introni
Sekundarne strukture su visoko očuvane u četiri kratka područja. Postoje dva koraka reakcije transesterifikacije spajanja. Introni grupe I pokreću mehanizam spajanja nukleofilnim napadom 3' hidroksila kofaktora guanozina na mjestu spajanja 5P.
Šta su introni grupe II?
Introni Grupe II su vrsta introna koji se sami spajaju koji se nalaze u organizmima koji pripadaju sva tri domena. Oni su ribozimi koji kataliziraju vlastite reakcije spajanja iz pre-mRNA. Nalaze se u rRNA, tRNA i genima koji kodiraju proteine. Ali oni se ne nalaze u nuklearnim genomima, za razliku od introna grupe I.
Slika 02: Grupa II Introni
Introni grupe II katalizuju spajanje putem dva koraka transesterifikacije slična intronima grupe I. Ovi enzimi pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 2′ OH adenozina na mestu grane na 5′ spoju. Tokom reakcija spajanja, introni grupe II formiraju strukturu sličnu larijatu. Štaviše, spajanje introna se odvija u odsustvu GTP-a.
Koje su sličnosti između introna Grupe I i Grupe II?
- Introni grupe I i grupe II su dvije vrste RNA enzima, ribozima koji kataliziraju vlastito spajanje različitim mehanizmima.
- Oni su veliki ribozimi.
- Oba se nalaze u sva tri domena.
- Oni su mobilni elementi.
- Štaviše, oni se nalaze u rRNA, tRNA i genima koji kodiraju proteine.
- Oba enzima se koriste kao alati u biotehnologiji i molekularnoj medicini za ciljano uništavanje/ukidanje gena, isporuku gena ili sisteme genske terapije.
Koja je razlika između introna Grupe I i Grupe II?
Introni grupe I su ribozimi koji se nalaze u bakterijama, bakteriofagima i eukariotskim organelarnim i nuklearnim genomima. Introni grupe II su ribozimi koji se nalaze u bakterijama, arhejama i eukariotskim organelama. Štaviše, introni grupe I pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 3′ hidroksila kofaktora gvanozina na mestu spajanja 5P, dok introni grupe II pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 2′ OH adenozinskog mesta grananja na 5′ spojni spoj. Dakle, ovo je ključna razlika između introna grupe I i grupe II.
Dalje, introni grupe II formiraju strukturu sličnu larijatu tokom spajanja dok se introni grupe I ne formiraju. Dakle, ovo je još jedna značajna razlika između introna grupe I i grupe II. Osim toga, introni grupe I nalaze se u eukariotskim nuklearnim genomima, dok se introni grupe II ne nalaze u eukariotskim nuklearnim genomima.
U nastavku infografike navode se razlike između introna grupe I i grupe II u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – Grupa I vs Introni Grupe II
Introni grupe I i II su veliki ribozimi koji katalizuju reakciju transesterifikacije za izdvajanje introna iz primarnog transkripta. Nalaze se u sva tri domena. Oboje su mobilni genetski elementi. Osim toga, koriste se kao alati u biotehnologiji i molekularnoj medicini. Međutim, introni grupe I pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 3′ OH kofaktora gvanozina na mjestu spajanja 5P. Ali, introni grupe II pokreću reakciju spajanja nukleofilnim napadom 2′ OH adenozina na mestu grane na 5′ spoju. Štaviše, introni grupe II formiraju strukturu sličnu larijatu tokom spajanja, dok introni grupe I ne formiraju strukturu sličnu larijatu. Dakle, ovo je sažetak razlike između introna grupe I i grupe II.
