Ključna razlika između snRNA i snoRNA je u tome što snRNA uključuje alternativno spajanje pre-mRNA dok snoRNA uključuje modifikaciju rRNA i tRNA, uređivanje mRNA i utiskivanje genoma.
Male RNK su polimerne RNA molekule koje se sastoje od manje od 200 nukleotida. Obično nisu kodirani. Oni postoje među glasničkim RNK za prenos signala. Male RNK potiču od savršene dvolančane RNK, koja se proizvodi djelovanjem RNK-zavisne RNK polimeraze. Male RNK igraju važnu ulogu u ćelijskoj diferencijaciji, rastu i proliferaciji, apoptozi, metabolizmu, migraciji i obrani. Stoga su male RNK važni i kritični regulatori razvoja i fiziologije. Mala nuklearna RNK i mala nukleolarna RNK su dvije klase malih RNA molekula.
Šta je snRNA?
Mala nuklearna RNK ili snRNA je klasa malih RNA molekula pronađenih u jezgru eukariotskih ćelija. Prosječna dužina snRNA je otprilike 150 nukleotida. RNA polimeraza II ili RNA polimeraza III transkribiraju snRNA. Glavna funkcija snRNA je obrada pre-glasničke RNK u jezgru. Oni također pomažu u regulaciji faktora transkripcije ili RNA polimeraze II i održavanju telomera.
Slika 01: Mehanizam djelovanja male RNK
Postoje dvije klase snRNA zasnovane na zajedničkim karakteristikama sekvence i povezanim proteinskim faktorima kao što je LSm protein koji se vezuje za RNK. Dvije klase su snRNA Sm klase i snRNA Lsm klase.snRNA Sm klase sastoji se od visokog sadržaja uridina U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 i U12. RNA polimeraza II transkribuje snRNA SM klase. Nakon transkripcije pre-snRNA, obično dobijaju 7-metilgvanozin 5' kapu u jezgru. Zatim se izvoze u citoplazmu kroz nuklearne pore za dalju obradu. snRNA klase Lsm ima visok sadržaj U6 i U6atac uridina. RNA polimeraza III transkribuje snRNA klase Lsm i ne napušta jezgro. Najčešće komponente ljudske snRNA su U1 spliceosomalna RNA, U2 spliceosomalna RNA, U4 spliceosomalna RNA, U5 spliceosomalna RNA i U6 spliceosomalna RNA.
Šta je snoRNA?
Mala nukleolarna RNK ili snoRNA je klasa malih RNA molekula koje vode hemijske modifikacije u drugim RNK kao što su ribosomalna RNK, transferna RNK i mala nuklearna RNK. Svaki snoRNA molekul je povezan sa oko četiri jezgra proteina u kompleksu RNA/protein tokom procesa modifikacije. snoRNA sadrži antisens element koji se sastoji od oko 10-20 nukleotida. Ove baze su komplementarne sekvenci koja okružuje nukleotide koji ciljaju modifikaciju u pre-RNA molekulu.
Slika 02: Mala nukleolarna RNA
Postoje dvije klase snoRNA. To su C/D box snoRNA i H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA je povezana sa metilacijom, a H/ACA box snoRNA je povezana sa pseudouridilacijom. Svaki snoRNA molekul djeluje kao vodič za jednu ili dvije modifikacije u ciljnoj RNK. C/D kutija snoRNA sadrži dva kratka očuvana motiva sekvence C i D, blizu 5’ i 3’ krajeva snoRNA, respektivno. Kratki regioni koji se sastoje od 5 nukleotida postavljaju se uzvodno od C kutije i nizvodno od D kutije i formiraju strukturu matične kutije. Ovo dovodi motive C i D kutije u blizinu. Struktura matične kutije je važna za ispravnu sintezu snoRNA i nukleolarnu lokalizaciju. H/ACA kutija snoRNA ima sekundarnu strukturu koja se sastoji od dvije ukosnice i dvije jednolančane regije. Ovo je opšte poznato kao struktura ukosnica-šarka-ukosnica-rep. H/ACA kutija snoRNA se također sastoji od dva konzervirana motiva H i ACA. Oba se nalaze u jednolančanim regijama. H kutija je u šarki, a ACA je u repnoj regiji. Tri nukleotida čine 3’ kraj niza.
Koje su sličnosti između snRNA i snoRNA?
- snRNA i snoRNA su male RNA.
- Oba su prisutna u eukariotskim ćelijama.
- Obje su nekodirajuće RNA molekule.
- Štaviše, oni učestvuju u modificiranju RNK tokom procesa transkripcije.
Koja je razlika između snRNA i snoRNA?
snRNA učestvuje u alternativnom spajanju pre-mRNA dok snoRNA uglavnom modifikuje RNA molekule. Dakle, ovo je ključna razlika između snRNA i snoRNA. Nadalje, snRNA su dugačke oko 150 nukleotida i često se nalaze povezane s grupom proteina i kompleksa koji se nazivaju mali nuklearni ribonukleoproteini. snoRNA su dugačke oko 60-170 nukleotida i uglavnom se nalaze u nukleolusu.
Štaviše, snRNA se transkribuju ili RNA polimerazom II ili RNA polimerazom III, dok se snoRNA transkribuje samo RNA polimerazom II.
Infografika ispod predstavlja razlike između snRNA i snoRNA u tabelarnom obliku radi usporedbe.
Sažetak – snRNA vs snoRNA
snRNA i snoRNA su klase malih RNA molekula. snRNA sudjeluje u alternativnom spajanju pre-mRNA dok snoRNA uglavnom modificira RNA molekule. Dakle, ovo je ključna razlika između snRNA i snoRNA. Mala RNK su polimerne RNA molekule koje se sastoje od manje od 200 nukleotida dužine i obično nisu kodirane. snRNA se nalaze u jezgru eukariota. snoRNA se nalaze kod arheja i eukariota. Transkripcija snRNA se odvija preko RNA polimeraze II i II, dok je samo RNA polimeraza II uključena u transkripciju snoRNA. Dakle, ovo rezimira razliku između snRNA i snoRNA.
