Polipeptid vs protein
Aminokiselina je jednostavna molekula formirana od C, H, O, N i može biti S. Ima sljedeću opštu strukturu.
Postoji oko 20 uobičajenih aminokiselina. Sve aminokiseline imaju -COOH, -NH2 grupe i -H vezan za ugljik. Ugljik je kiralni ugljik, a alfa aminokiseline su najvažnije u biološkom svijetu. R grupa se razlikuje od aminokiseline do aminokiseline. Najjednostavnija aminokiselina sa R grupom H je glicin. Prema R grupi, aminokiseline se mogu kategorizirati u alifatske, aromatične, nepolarne, polarne, pozitivno nabijene, negativno nabijene ili polarne nenabijene itd. Aminokiseline prisutne kao zwitter joni u fiziološkom pH 7,4. Aminokiseline su gradivni blokovi proteina. Kada se dvije aminokiseline spoje kako bi formirale dipeptid, kombinacija se odvija u -NH2 grupi jedne amino kiseline sa -COOH grupom druge amino kiseline. Molekul vode se uklanja, a formirana veza poznata je kao peptidna veza.
Polipeptid
Lanac se formira kada se veliki broj aminokiselina spoji zajedno poznat je kao polipeptid. Proteini se sastoje od jednog ili više ovih polipeptidnih lanaca. Primarna struktura proteina poznata je kao polipeptid. Od dva kraja polipeptidnog lanca, N-terminus je mjesto gdje je amino grupa slobodna, a c-terminus je mjesto gdje je karboksilna grupa slobodna. Polipeptidi se sintetiziraju na ribosomima. Aminokiselinska sekvenca u polipeptidnom lancu određena je kodonima u mRNA.
Protein
Proteini su jedan od najvažnijih tipova makromolekula u živim organizmima. Proteini se mogu kategorizirati na primarne, sekundarne, tercijarne i kvarterne proteine ovisno o njihovoj strukturi. Redoslijed aminokiselina (polipeptida) u proteinu naziva se primarna struktura. Kada se polipeptidne strukture sklope u nasumične rasporede, poznate su kao sekundarni proteini. U tercijarnim strukturama proteini imaju trodimenzionalnu strukturu. Kada se nekoliko trodimenzionalnih proteinskih dijelova veže zajedno, oni formiraju kvarterne proteine. Trodimenzionalna struktura proteina ovisi o vodikovim vezama, disulfidnim vezama, ionskim vezama, hidrofobnim interakcijama i svim drugim međumolekularnim interakcijama unutar aminokiselina. Proteini igraju nekoliko uloga u živim sistemima. Oni učestvuju u formiranju struktura. Na primjer, mišići imaju proteinska vlakna poput kolagena i elastina. Takođe se nalaze u tvrdim i krutim strukturnim delovima kao što su nokti, kosa, kopita, perje, itd. Ostali proteini se nalaze u vezivnom tkivu poput hrskavice. Osim strukturne funkcije, proteini imaju i zaštitnu funkciju. Antitijela su proteini i štite naše tijelo od stranih infekcija. Svi enzimi su proteini. Enzimi su glavni molekuli koji kontroliraju sve metaboličke aktivnosti. Nadalje, proteini učestvuju u ćelijskoj signalizaciji. Proteini se proizvode na ribosomima. Signal za proizvodnju proteina se prenosi na ribozom iz gena u DNK. Potrebne aminokiseline mogu biti iz ishrane ili se mogu sintetizirati unutar ćelije. Denaturacija proteina dovodi do odvijanja i dezorganizacije sekundarnih i tercijarnih struktura proteina. To može biti zbog topline, organskih rastvarača, jakih kiselina i baza, deterdženata, mehaničkih sila, itd.
Koja je razlika između polipeptida i proteina?
• Polipeptidi su sekvenca aminokiselina, dok su proteini napravljeni od jednog ili više polipeptidnih lanaca.
• Proteini imaju veću molekularnu težinu od polipeptida.
• Proteini imaju vodonične veze, disulfidne veze i druge elektrostatičke interakcije, koje upravljaju njihovom trodimenzionalnom strukturom za razliku od polipeptida.
