Ključna razlika između konzervirane i konsenzus sekvence je u tome što se konzervirana sekvenca odnosi na slične sekvence nukleinskih kiselina ili aminokiselina koje se javljaju u različitim ili istim vrstama tokom generacija, dok je konsenzusna sekvenca uobičajena nukleotidna sekvenca ili pronađena sekvenca aminokiselina u visoko konzerviranoj regiji DNK ili RNK ili proteina.
Organizmi dijele slične, ali i različite karakteristike. Prilikom proučavanja odnosa između organizama i njihove klasifikacije, genom ili genetski sastav organizama je veoma važan. Postoje neke sekvence nukleotida ili aminokiselina koje su uobičajene među različitim organizmima. Očuvana sekvenca je sekvenca nukleinske kiseline ili aminokiselina koja je konzistentna među vrstama. Stoga su filogenetski važni pri stvaranju filogenetskih stabala. U konzerviranim sekvencama postoje specifične nukleotidne sekvence koje se češće nalaze. One su poznate kao konsenzus sekvence.
Šta je konzervirana sekvenca?
Očuvana sekvenca je sekvenca nukleinske kiseline ili sekvenca aminokiselina koja je slična među vrstama. Stoga je konzistentan u svim vrstama tijekom evolucije. Generalno, ove sekvence se održavaju prirodnom selekcijom. One ostaju nepromijenjene daleko iza filogenetskog stabla. Stoga su očuvane sekvence važne u izgradnji filogenetskih stabala. Vjeruje se da visoko konzervirane sekvence često imaju važnu funkcionalnu vrijednost. Korisni su i u identifikaciji genetskih bolesti. Međutim, konzervirane sekvence mogu biti kodirajuće ili nekodirajuće sekvence nukleinske kiseline. Osim toga, konzervirane sekvence pokazuju sporije stope mutacije. Stoga pokazuju vrlo minimalne promjene u svom sastavu; ponekad, ne pokazuju promjene kroz generacije.
Slika 01: Konzervirana sekvenca
RNA komponente ribozoma prisutne su u svim domenima života, homeobox sekvence kod eukariota i tmRNA u bakterijama su nekoliko primjera visoko konzerviranih sekvenci. Identifikacija konzerviranih sekvenci je laka kada se koriste bioinformatički pristupi, posebno alat za poravnanje sekvenci. Štaviše, višestruko poravnanje sekvenci olakšava vizualizaciju očuvanih sekvenci.
Šta je konsenzus sekvenca?
Konsenzusna sekvenca je sekvenca koja se obično nalazi u datom očuvanom regionu DNK ili RNK. To je vrlo specifična sekvenca nukleotida. Kao primjer, postoji konsenzusna sekvenca na -10 kao TATAAT (Pribnow box) u promotorima E. coli, koji su visoko konzervirane sekvence. Slično, postoji još jedna konsenzus sekvenca: TTGACA u E. coli promotorima takođe na -35. Konsenzus sekvence su također poznate kao "kutije".
Slika 02: Konsenzus sekvenca
Pored DNK i RNK, proteini takođe imaju konsenzus sekvence aminokiselina. Mjesta vezivanja za proteine često su predstavljena konsenzusnim sekvencama. Restrikcioni enzimi takođe imaju konsenzus sekvence. Štaviše, mesta spajanja su takođe konsenzus sekvence. Slično konzerviranim sekvencama, konsenzus sekvence se mogu izračunati i vizualizirati pomoću bioinformatičkih alata.
Koje su sličnosti između očuvanog i konsenzusnog niza?
- Očuvane i konsenzusne sekvence su sekvence nukleinskih kiselina ili aminokiselina koje su uobičajene među vrstama.
- I konzervirane i konsenzusne sekvence mogu se vizualizirati pomoću bioinformatičkih alata.
- Oni se široko koriste u molekularnoj biologiji.
Koja je razlika između konzerviranog i konsenzusnog niza?
Očuvana sekvenca je sekvenca nukleinske kiseline ili aminokiselina koja je konzistentna među vrstama, dok su konsenzus sekvence vrlo specifične i uobičajene baze ili aminokiseline u datoj konzerviranoj regiji. Dakle, ovo je ključna razlika između očuvane i konsenzus sekvence. Štaviše, druga razlika između konzervirane i konsenzus sekvence je u tome što su konzervirane sekvence filogenetski važne dok su konsenzus sekvence često mjesta vezanja proteina, mjesta spajanja, mjesta rezanja restrikcijskih enzima, itd.
Sažetak – Konzervirano naspram konsenzus sekvence
Očuvane sekvence su sekvence nukleinskih kiselina ili proteina koje su slične među živim vrstama. Promotor, mjesto vezivanja ribosoma, porijeklo replikacije i sekvenca aminokiselina histonskog proteina su nekoliko primjera očuvanih sekvenci. Nasuprot tome, konsenzus sekvence su specifične baze ili aminokiseline koje se češće nalaze u datoj konzerviranoj sekvenci. -10 kutija, -35 kutija promotora E. coli, mjesta vezanja proteina, mjesta spajanja i mjesta prepoznavanja restrikcijskih enzima nekoliko su primjera konsenzus sekvenci. Dakle, ovo je sažetak razlike između konzerviranog i konsenzusnog niza.
