Ključna razlika između Shine Dalgarno i Kozak sekvence je u tome što je Shine Dalgarno sekvenca ribosomsko vezno mjesto u bakterijskoj i arhealnoj glasničkoj RNK, dok je Kozak sekvenca mjesto inicijacije translacije proteina u većini eukariotskih glasničkih RNK.
Shine Dalgarno i Kozak sekvence su dvije konsenzus sekvence koje su vrlo važne za inicijaciju prevođenja. U molekularnoj biologiji, translacija je proces kojim ribozomi u citoplazmi sintetiziraju proteine nakon procesa transkripcije. U prijevodu, mRNA (messenger RNA) se dekodira u ribosomu kako bi se proizveo specifični lanac aminokiselina izvan jezgre. Tipično, ribosom inducira proces dekodiranja olakšavajući vezivanje komplementarnih tRNA antikodonskih sekvenci za kodone mRNA. Prevođenje se odvija u tri faze: početak, produljenje i završetak.
Šta je Shine Dalgarno Sequence?
Shine Dalgarno sekvenca je ribosomsko vezivno mjesto u bakterijskoj i arhealnoj glasničkoj RNK. Generalno se nalazi oko 8 baza uzvodno od startnog kodona AUG. Ova RNA sekvenca pomaže u regrutovanju ribozoma u RNK glasnika poravnavanjem ribozoma sa početnim kodonom mRNA. Dakle, pokreće sintezu proteina. Jednom nakon regrutacije, tRNA može dodati aminokiseline u nizu kako to diktiraju kodoni mRNA. Ova posebna sekvenca je uobičajena kod bakterija, ali je rjeđa kod arheja. Osim toga, prisutan je i u hloroplastima i mitohondrijskim transkriptima. Slijed Shine Dalgarno prvi su predložili australski naučnici John Shine i Lynn Dalgarno. Konsenzusna sekvenca od šest baza je AGGAGG. Na primjer, kod Escherichia coli sekvenca je AGGAGGU.
Slika 01: Shine Dalgarno sekvenca
Odabir mjesta inicijacije (AUG) ovisi o interakciji između 30S podjedinice ribozoma i mRNA šablona. Područje bogato pirimidinom na komponenti 16srRNA 30S podjedinice vezuje se za regiju bogatu purinom poznatu kao Shine Dalgarno sekvenca uzvodno od AUG inicijacijskog kodona u mRNA. Nadalje, tokom formiranja kompleksa za inicijaciju, ove komplementarne nukleotidne sekvence se uparuju i formiraju dvolančanu RNK strukturu. Ovo olakšava vezivanje mRNA za ribozom na takav način da se inicijacijski kodon postavlja na P mjesto ribozoma.
Šta je Kozak sekvenca?
Kozak sekvenca je mjesto inicijacije translacije proteina u većini eukariotskih mRNA. Ovaj niz se još naziva i Kozakov konsenzusni niz. Kozakova sekvenca je optimalna sekvenca za pokretanje translacije kod eukariota. Ova sekvenca je integralni aspekt regulacije proteina. Takođe je veoma važan za celokupno zdravlje ćelija. Pomaže u ispravljanju translacije proteina iz genetskih poruka posredovanjem u sklapanju ribosoma i započinjanju translacije.
Slika 02: Kozak sekvenca
Ova sekvenca je dobila ime po naučnici koja ju je otkrila, Marilyn Kozak. Otkrila ga je kroz detaljnu analizu genomskih sekvenci DNK. Kozakova sekvenca je 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’. Velika slova označavaju očuvane baze, dok mala označavaju zajedničke promjenljive baze. R označava purin (adenin ili gvanin) koji se uvijek nalazi na ovoj lokaciji.
Koje su sličnosti između Shine Dalgarno i Kozak sekvence?
- Shine Dalgarno i Kozak sekvenca su dvije konsenzus sekvence koje su vrlo važne u inicijaciji prijevoda.
- Obje su RNA sekvence.
- Manja podjedinica ribozoma se vezuje za obe sekvence.
- Obje sekvence posreduju u pravilnom sklapanju ribosoma i započinjanju translacije.
- Oni su sastavni aspekti regulacije proteina i ukupnog zdravlja ćelija.
Koja je razlika između Shine Dalgarno i Kozak sekvence?
Shine Dalgarno sekvenca je ribosomsko vezno mjesto koje se nalazi u bakterijskoj i arhealnoj glasničkoj RNK, dok je Kozak sekvenca mjesto inicijacije translacije proteina koje se nalazi u većini eukariotskih glasničkih RNK. Dakle, ovo je ključna razlika između Shine Dalgarno i Kozakove sekvence. Nadalje, Shine Dalgarno sekvenca je 5’AGGAGGU3’ dok je Kozakova sekvenca 5’ (gcc) gccRccAUGG-3’.
Sljedeća infografika navodi razlike između sekvence Shine Dalgarno i Kozak u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno i Kozak sekvence su dvije konsenzus RNK sekvence koje su vrlo važne za sklapanje ribosoma i inicijaciju translacije. Shine Dalgarno sekvenca je ribosomsko vezno mjesto u bakterijskoj i arhealnoj glasničkoj RNK, dok je Kozakova sekvenca mjesto inicijacije translacije proteina u većini eukariotskih glasničkih RNK. Dakle, ovo sumira razliku između Shine Dalgarno i Kozakove sekvence.
