Ključna razlika između prajmera i promotora je ta što je prajmer komercijalno sintetizovana kratka DNK sekvenca koja se koristi u PCR-u za amplifikaciju ciljne DNK sekvence dok je promotor specifična DNK sekvenca koja obezbeđuje sigurno početno mesto vezivanja za RNK polimeraza i faktori transkripcije kako bi se inicirala transkripcija.
Primer i promoter su dve vrste DNK sekvenci. Prajmer je mali fragment DNK potreban za lančanu reakciju polimeraze (PCR). Ima kratke nukleotidne sekvence komplementarne bočnom kraju lanca DNK. Postoje dva tipa prajmera i oni rade kao polazne tačke za sintezu novih lanaca DNK. Nasuprot tome, promotor je specifična sekvenca DNK koja se nalazi uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije gena. On direktno stupa u interakciju sa komponentama mehanizma transkripcije kao što su RNA polimeraza i transkripcijski faktori kako bi kontrolirao transkripciju DNK. Stoga se RNA polimeraza i drugi faktori transkripcije vezuju za sekvencu promotora i iniciraju transkripciju.
Šta je Primer?
Primeri su kratke DNK sekvence dizajnirane za amplifikaciju ciljnih DNK sekvenci. Strukturno, oni posjeduju kratke nukleotidne sekvence komplementarne bočnim krajevima dvostrukih lanaca DNK. Obično imaju oko 20 nukleotida. Tokom PCR-a, Taq polimeraza katalizira dodavanje nukleotida u već postojeći nukleotidni niz. Dakle, prajmeri služe kao polazne tačke za sintezu novih niti. Taq polimeraza djeluje samo u smjeru od 5’ do 3’. Dakle, sinteza DNK se također odvija u istom smjeru od 5’ do 3’. Pošto je DNK dvolančana, za PCR su potrebne dvije vrste prajmera. Oni su poznati kao prednji prajmer i reverzni prajmer, na osnovu smera izduženja prajmera tokom sinteze DNK.
Slika 01: Primeri
Naprijed prajmer žari antisens DNK lancem i inicira sintezu + lanca gena u smjeru 5’ do 3’. Ima kratku sekvencu nukleotida koja je komplementarna 3' bočnom kraju antisens lanca. Reverzni prajmer se žari sa osjetilnim lancem i inicira sintezu komplementarnog lanca kodirajućeg lanca, koji je – lanac gena u smjeru 5’ do 3’. Dakle, reverzni prajmer je dizajniran kao komplementaran 3' kraju kodirajućeg niza. I obrnuti i naprijed prajmeri važni su za proizvodnju miliona do milijardi kopija određenih regija DNK koje su ciljane ili zainteresirane.
Šta je promotor?
Promotor je DNK sekvenca koja se nalazi uzvodno ili na 5′ kraju mesta inicijacije transkripcije gena. Obezbeđuje mesto vezivanja za RNA polimerazu i određene regulatorne elemente kako bi se inicirala transkripcija gena. To je regulatorna sekvenca potrebna za uključivanje ili isključivanje gena. U promotoru postoji specifična sekvenca nukleotida. Može imati 100-1000 baznih parova. Promotor pokazuje smjer transkripcije. Štaviše, ukazuje na čulni lanac koji treba transkribovati.
Slika 02: Promotor gena
Postoje tri tipa promotorskih elemenata kao što su promotor jezgra, proksimalni promotor i distalni promotor. Promotor jezgra je minimalni dio promotora potreban za iniciranje transkripcije. Nalazi se najproksimalnije od startnog kodona. TATA kutija je konzervirana regija koja se nalazi u mnogim promotorima jezgre eukariota. Nalazi se 25 do 35 parova baza uzvodno od mjesta početka transkripcije. Proksimalni promotor se nalazi više uzvodno od promotora jezgra. Generalno, nalazi se 250 parova baza uzvodno od startnog kodona i sadrži primarne regulatorne elemente. Distalni promotor se nalazi uzvodno od proksimalnog promotora i sadrži dodatne regulatorne elemente. Bakterijski promotori imaju dva elementa kratke sekvence u svojim promotorima. TATAAT je konsenzusna sekvenca koja se nalazi na -10 bakterijskog promotora, dok je TTGACA konsenzusna sekvenca na -35. Oni su poznati kao -10 element i -35 element.
Koje su sličnosti između Primera i Promotera?
- Primer i promoter su dvije vrste DNK sekvenci.
- Sastoje se od nukleotidnih sekvenci.
- I prajmer i promoter su važni za ekspresiju gena.
Koja je razlika između Primera i Promotera?
Primer je kratka nukleotidna sekvenca dizajnirana za amplifikaciju ciljne DNK. Nasuprot tome, promotor je specifična regulatorna DNK sekvenca koja se nalazi uzvodno do mjesta inicijacije transkripcije gena. Dakle, ovo je ključna razlika između prajmera i promotera. Prajmeri su dugački oko 20 parova baza, dok promoter može imati 100 -1000 parova baza. Funkcionalno, prajmeri služe kao početne sekvence za sintezu novog lanca, dok promotori kontrolišu transkripciju gena obezbeđujući mesta vezivanja za RNA polimerazu i druge faktore transkripcije.
Štaviše, promotor je definisan kao pravac transkripcije i ukazuje na čulni lanac gena. Strukturno, prajmer je kratka, jednolančana DNK sekvenca, dok je promotor duga dvolančana DNK sekvenca.
U nastavku info-grafika prikazuje više poređenja vezanih za razliku između primera i promotera.
Sažetak – Primer vs Promoter
Primeri su kratke nukleotidne sekvence komplementarne bočnim krajevima ciljne DNK dvostruke lanca. U PCR se koriste dvije vrste prajmera. Oni služe kao početne sekvence za sintezu novih niti. Prajmeri su komercijalno dizajnirani i imaju temperaturno stabilne sekvence. S druge strane, promotor je regulatorna sekvenca gena koja se nalazi uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Promotori kontrolišu transkripciju gena. Oni obezbeđuju mesta vezivanja za RNA polimerazu i transkripcione faktore za iniciranje transkripcije. Dakle, ovo je sažetak razlike između prajmera i promotera.
