Ključna razlika između proteinske podjedinice i domene je u tome što je proteinska podjedinica odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja sa drugim polipeptidnim lancima kako bi formirao proteinski kompleks, dok je proteinska domena susjedna regija polipeptidnog lanca proteina koji se često samostalno savija u kompaktnu, lokalnu i polunezavisnu jedinicu.
Proteinska podjedinica i domen su veoma važni delovi multimernog proteina. Proteini su polimeri napravljeni od polipeptida. Svaki polipeptidni lanac se gradi od monomera poznatog kao aminokiselina. Kompleksni protein sadrži različite strukturne jedinice kao što su podjedinice, domeni, motiv i nabor. Ove strukturne jedinice kompleksnog proteina su izuzetno važne za njegovu strukturu i konačno za njegovu funkciju.
Šta je proteinska podjedinica?
Proteinska podjedinica je odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja sa drugim polipeptidnim lancima kako bi formirao proteinski kompleks. U strukturnoj biologiji, proteinska podjedinica je jedan proteinski molekul koji se zajedno sastavlja s drugim proteinskim molekulima kako bi formirao proteinski kompleks. Prirodni proteini imaju relativno mali broj podjedinica, kao što su hemoglobin i DNK polimeraza. Stoga se nazivaju oligomernim. Ostali proteini se sastoje od velikog broja podjedinica, pa se opisuju kao multimerni. Na primjer, mikrotubule i drugi proteini citoskeleta su multimerni. Podjedinice multimernog proteina mogu biti identične (homologne) ili potpuno različite (heterologne).
Slika 01: Proteinska podjedinica
U nekim multimernim proteinima, jedna podjedinica može biti katalitička podjedinica. S druge strane, druga je regulatorna podjedinica. Funkcija katalitičke podjedinice je kataliziranje enzimske reakcije, dok je funkcija regulatorne podjedinice olakšavanje ili inhibiranje njene aktivnosti. Enzim koji se sastoji od katalitičkih i regulatornih podjedinica kada se sastavi obično se naziva holoenzim. Na primjer, enzim klase I fosfoinozitid 3-kinaze ima p110 katalitičku podjedinicu i p85 regulatornu podjedinicu. Štaviše, protein mora imati jedan gen za svaku podjedinicu. To je zato što se podjedinica sastoji od zasebnog polipeptidnog lanca koji ima jedan kodirajući gen.
Šta je proteinska domena?
Proteinski domen je neprekidni region polipeptidnog lanca proteina koji se često nezavisno savija u kompaktne, lokalne i polunezavisne jedinice. Domen proteina je takođe poznat kao region polipeptidnog lanca proteina koji se samostabilizuje i savija se nezavisno od ostalih. Oni su posebna strukturna i funkcionalna jedinica u proteinu. Obično su domeni odgovorni za određenu funkciju ili interakciju koja doprinosi ukupnoj ulozi proteina. Na primjer, SH3 domena ima oko 50 aminokiselinskih ostataka. Javljaju se u raznolikom rasponu proteina, uključujući adapterske proteine, fofatidilinozitol3-kinaze, fosfolipaze i miozine. Ove SH3 domene su uključene u interakcije protein-protein.
Slika 02: Proteinski domeni
Domeni variraju u dužini od 50 aminokiselina do 250 aminokiselina. Najkraći domeni, kao što je cink prst, stabilizirani su metalnim ionima i disulfidnim mostovima. Domen često proizvodi funkcionalne jedinice kao što je EF-ručni domen kalmodulina koji vezuje kalcij. Nadalje, domeni se mogu zamijeniti genetskim inženjeringom između jednog proteina u drugi kako bi se napravili himerni proteini.
Koje su sličnosti između proteinske podjedinice i domene?
- Proteinska podjedinica i domen su strukturne jedinice multimernog proteina.
- Obje se sastoje od aminokiselina.
- Povezani su za termin “polipeptidni lanac”.
- Štaviše, oba su izuzetno važna za ukupnu funkciju proteina.
Koja je razlika između proteinske podjedinice i domene?
Proteinska podjedinica je odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja sa drugim polipeptidnim lancima kako bi formirao proteinski kompleks. S druge strane, proteinska domena je susjedna regija polipeptidnog lanca proteina koja se često samostalno savija u kompaktne, lokalne i polu-nezavisne jedinice. Dakle, ovo je ključna razlika između proteinske podjedinice i domena. Štaviše, proteinska podjedinica je veća od proteinske domene.
Sljedeća tabela sumira razliku između proteinske podjedinice i domene u obliku tabele.
Sažetak – Proteinska podjedinica naspram domena
Građevinski blokovi proteina su aminokiseline. Proteini nastaju kondenzacijom aminokiselina. Proteinske strukture su veličine od desetina do nekoliko hiljada aminokiselina. Struktura proteina je stabilizovana nekovalentnim interakcijama kao što su vodonične veze, jonske veze, Van der Waalsove sile, hidrofobne veze i kovalentne interakcije kao što su disulfidne veze. Kompleksni protein sadrži različite strukturne jedinice kao što su podjedinice, domene, motiv i nabor. Proteinska podjedinica je odvojeni polipeptidni lanac proteina koji se spaja sa drugim polipeptidnim lancima kako bi formirao proteinski kompleks. S druge strane, domen proteina je region polipeptidnog lanca proteina koji se samostabilizuje i savija se nezavisno od ostalih. Dakle, ovo je sažetak razlike između proteinske podjedinice i domene.
