Ključna razlika između cis i trans spajanja je u tome što je cis spajanje intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji se nalaze unutar istog RNA transkripta, dok je trans-splajsing intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji nisu unutar istog RNA transkripta.
RNA spajanje je oblik obrade RNK prije sinteze proteina. U ovom procesu, novonastali pre-glasnički RNK transkript se transformiše u zrelu glasničku RNK. Zrela glasnička RNK pomaže u proizvodnji proteinske molekule. Tokom spajanja RNK, introni (nekodirajuće regije) se uklanjaju, a egzoni (kodirajuće regije) se spajaju kako bi se napravila zrela mRNA. Cis i trans spajanje su dvije vrste mehanizama spajanja RNA.
Šta je Cis spajanje?
Cis spajanje je intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji se nalaze unutar istog RNA transkripta. Normalno cis spajanje obrađuje jedan RNA molekul. Cis spajanje je tipičan proces spajanja pre mRNA koji izvode spliceosomi. U intronu, mjesto donora (5’ kraj introna), mjesto grane (blizu 3’ kraja introna) i mjesto akceptora (3’ kraj introna) su veoma bitne za spajanje. Donorsko mjesto spajanja uključuje nepromjenjivu sekvencu GU na 5’ kraju introna. Akceptorsko mjesto spajanja na 3’ kraju introna ima nepromjenjivu AG sekvencu. Uzvodno od AG sekvence, postoji regija koja se zove pirimidinska regija (polipirimidinski trakt). Dalje uzvodno od polipirimidinskog trakta, nalazi se tačka grananja koja uključuje adenozin nukleotid. Ovaj nukleotid je uključen u formiranje larijata.
Slika 01: Cis i Trans spajanje
Glavni spliceosomi su U1, U2, U4, U5 i U6. Među njima su U1 i U2 veoma važni. U cis spajanju, U1 se vezuje za 5’ mjesto spajanja, a U2 se vezuje za tačku grananja blizu mjesta spajanja 3’. U5/U4/U6 vezuje egzone na 5’ mjestu, pri čemu se U6 vezuje za U2. Kasnije izlazi U1. U5 prelazi iz egzona u intron, a U6 se vezuje na 5’ mjestu spajanja. Nadalje, U4 je također objavljen. U6/U2 katalizira transesterifikaciju, čineći 5’ kraj introna ligatom za A nukleotid na intronu. Ovo pokreće formiranje larijata. U formiranju larijata, U5 veže egzon na 3’ mjestu spajanja, a 5’ mjesto se cijepa. U završnoj fazi spajanja, U2/U5/U6 ostaju vezani za larijat, a 3’ mjesto se cijepa. Pored toga, eksoni se ligiraju pomoću ATP hidrolize u ovoj fazi.
Šta je trans spajanje?
Trans splicing je intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji nisu unutar istog RNA transkripta. U trans-splajsingu, ne postoji 5’ mjesto spajanja na pre mRNA molekuli za vezanje proteina U1. Umjesto toga, RNA lidera s ograničenim spajanjem (SL) se trans-splajkuje na sekvencu u outronu.
Slika 02: Trans Spajanje
Outron je regija pre mRNA između 5’ kape i trans-mjesta spajanja. Međutim, protein U2 se obično vezuje za 3’ mjesto spajanja. Nakon uklanjanja outrona, egzon vođe spajanja (SL) se spaja na prvi egzon na pre mRNA. Nadalje, trans-splicing je mehanizam koji se opaža kod određenih mikroorganizama kao što su protisti iz klase Kinetoplastae za ekspresiju gena.
Koje su sličnosti između Cis i Trans spajanja?
- Cis i trans spajanje su dvije vrste mehanizama spajanja RNA.
- U oba mehanizma, introni se uklanjaju.
- Takođe, u oba mehanizma, egzoni se spajaju da formiraju zrelu mRNA.
- Oba mehanizma se nalaze kod eukariota.
- Ovi mehanizmi su odsutni kod prokariota.
Koja je razlika između Cis i Trans spajanja?
Cis spajanje je intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji se nalaze unutar istog RNA transkripta, dok je trans-splajsing intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji nisu unutar iste RNA transkript. Dakle, ovo je ključna razlika između cis i trans spajanja. Nadalje, u cis spajanju, introni se uklanjaju kako bi se formirala zrela mRNA. S druge strane, u trans splicingu introni ili outroni se uklanjaju kako bi se formirala zrela mRNA.
Sljedeća infografika navodi razlike između cis i trans spajanja u tabelarnom obliku radi usporedbe.
Sažetak – Cis vs Trans Splicing
RNA spajanje je oblik obrade RNK prije procesa sinteze proteina. Cis i trans spajanje su dvije vrste mehanizama spajanja RNK koji se nalaze u eukariota. Cis spajanje je intramolekularni mehanizam koji uklanja introne i spaja egzone koji se nalaze unutar istog RNA transkripta, dok je trans-splajsing intermolekularni mehanizam koji uklanja introne ili outrone i spaja egzone koji se ne nalaze unutar istog RNA transkripta. Dakle, ovim je završena rasprava o razlici između cis i trans spajanja.
