siRNA vs miRNA
RNA su veoma važne molekule, koje pomažu u izgradnji života organizama. Nedavno su naučnici otkrili male RNK zvane RNA interferencija ili RNAi, koje djeluju nakon transkripcije kako bi kontrolirale ekspresiju gena. Dvije glavne vrste malih RNK su mikro RNA ili miRNA i mala interferirajuća RNA ili siRNA. Ovi molekuli u osnovi regulišu ekspresiju gena potiskivanjem ciljnog gena. I miRNA i siRNA imaju vrlo slične puteve biogeneze, iako među njima postoje neke razlike. Porijeklo miRNA i siRNA je od dsRNA molekula. Zrele miRNA su strukturno slične molekulama siRNA.
miRNA
Mikro RNA ili miRNA su mali molekuli RNK koji posreduju u konačnoj provjeri u regulaciji translacijskih gena. Deregulacija miRNA može dovesti do razvoja raka i drugih bolesti. Stoga je ispravna regulacija informacija kodiranih u nekodirajućoj regiji miRNA vrlo kritična u mnogim fundamentalnim ćelijskim procesima.
siRNA
siRNA se takođe naziva kratka interferirajuća ili utišavajuća RNK i sastoje se od dvolančane RNK sa 20 do 25 parova baza. Glavna uloga siRNA je da ometa ekspresiju specifičnih gena sa komplementarnim nukleotidnim sekvencama. siRNA se sastoji od kratke dvolančane RNK sa fosforiliranim 5' krajevima i hidroksiliranim 3' krajevima sa dva nukleotida iznad.
Koja je razlika između siRNA i miRNA?
• miRNA izvedena iz specifičnih genomskih lokusa, dok siRNA izvedena iz mRNA, transpozona, virusa ili heterokromatske DNK.
• Sinteza miRNA se obrađuje iz dužih prekursorskih transkripata ukosnice (primarna nuklearna miRNA sekvenca endonukleazom RNase III), dok se sinteza miRNA obrađuje iz dugih bimolekularnih RNA dupleksa.
• Svaki prekursorski molekul miRNA ukosnice proizvodi jedan dupleks miRNA, dok svaki prekursor siRNA molekul proizvodi višestruke duplekse siRNA.
• siRNA sekvence su rijetko konzervirane, dok su miRNA sekvence dobro očuvane.
• Sve baze unutar siRNA doprinose njenoj ciljnoj specifičnosti, dok samo 5’ polovina miRNA doprinosi njenoj ciljnoj specifičnosti.
• miRNA se često vezuje za 3’ neprevedenu regiju ciljnih transkripata, dok siRNA formiraju komplementarni dupleks bilo gdje duž ciljne mRNA.
• miRNA specificira 'hetero-utišavanje' dok se siRNA koristi za 'auto utišavanje'.
• miRNA djeluje kao signal za sprječavanje translacije, dok siRNA fizički sprječava translaciju.
