Ključna razlika – minisatelit vs mikrosatelit
Repetitivna DNK su nukleotidne sekvence koje se ponavljaju iznova i iznova u genomu organizama. Ponavljajuća DNK čini značajan dio genomske DNK, a postoje tri glavna tipa nazvana tandem ponavljanja, terminalna ponavljanja i interspersirana ponavljanja. Tandem ponavljanja su visoko ponovljene sekvence koje leže jedna uz drugu bez prekida. Postoje tri glavna tipa tandemskih ponavljanja u genomu kičmenjaka. To su satelitska DNK, mikrosatelitska DNK i minisatelitska DNK. Minisatelit je dio visoko ponovljene DNK koji se sastoji od niza ponavljajućih sekvenci sastavljenih od 10 do 100 parova baza. Mikrosatelit je dio ponavljajuće DNK koji se sastoji od kratkih ponavljajućih sekvenci sastavljenih od 1 do 9 parova baza. Stoga je ključna razlika između minisatelita i mikrosatelita veličina ili dužina sekvence koja se ponavlja.
Šta je minisatelit?
Minisatelitska DNK je dio DNK koji se sastoji od niza kratkih ponavljajućih sekvenci DNK dužine od 10 do 60 parova baza. Minisateliti se takođe nazivaju tandemskim ponavljanjima promenljivog broja (VNTR). Minisateliti se često brkaju sa mikrosatelitima. Međutim, naučnici sada razlikuju minisateliti i mikrosateliti na osnovu veličine sekvence koja se ponavlja.
Minisateliti se mogu vidjeti na više od 1000 lokacija u ljudskom genomu. Ove kratke sekvence su bogate G i C. Broj ponavljanja u datom minisatelitu uvelike varira među pojedincima.
Prvi ljudski minisatelit identifikovali su A. R. Wyman i R. White 1980. Kasnije je Alec Jeffreys otkrio ekstremni polimorfizam broja kopija minisatelita među organizmima. Ta otkrića su napravila minisatelite kao idealne markere za DNK otiske prstiju, analizu povezanosti i populacijske studije. Minisateliti takođe doprinose regulaciji ekspresije gena, transkripciji, alternativnom spajanju, itd.
Šta je mikrosatelit?
Mikrosatelit je dio DNK koji ima jednostavne sekvence ponavljanja od 1 do 10 parova baza. Mikrosateliti se takođe nazivaju ponavljanja kratkih sekvenci (SSR) ili jednostavna tandemska ponavljanja (STR). Postoje dva tipa mikrosatelita koji se nazivaju jednostavni mikrosateliti i kompozitni mikrosateliti. Jednostavni mikrosateliti se sastoje od samo jedne vrste ponavljajućih sekvenci. Kompozitni mikrosateliti se sastoje od više od jedne vrste ponavljanja. Mikrosateliti najčešće posjeduju poli A/T regije. Mikrosateliti su kodominantni i brojni u eukariotskim genomima.
Slično minisatelitima, mikrosateliti takođe pokazuju polimorfizam među pojedincima. Broj ponavljanja za dati mikrosatelit varira među pojedincima. Stoga se mikrosateliti mogu koristiti i kao genetski markeri u DNK otisku prstiju. Mikrosatelitski polimorfizam se može lako identificirati PCR-om i gel elektroforezom. Bočna regija mikrosatelita je visoko očuvana kod srodnih vrsta.
Koje su sličnosti između minisatelita i mikrosatelita?
- Minisateliti i mikrosateliti su nekodirajuće DNK sekvence.
- Oba su tandemska ponavljanja.
- Oba se sastoje od sekvenci koje se jako ponavljaju.
- Oba se mogu koristiti kao moćni genetski markeri za DNK otiske prstiju.
Koja je razlika između minisatelita i mikrosatelita?
minisatelit vs mikrosatelit |
|
| Minisateliti su tandem ponavljanja sa dužinom ponavljanja monomera od 10 do 100 baznih parova. | Mikrosateliti su kratki tandem ponavljanja koja se sastoje od 1 do 9 baznih parova monomernih ponavljajućih sekvenci. |
| Veličina ponavljajućeg niza | |
| Minisatelit ima ponavljajuće sekvence od 10 do 100 parova baza. | Mikrosatelit ima kratke sekvence od 1 do 9 baznih parova. |
| Common Bases | |
| Minisateliti su bogati G i C bazama. | Mikrosateliti su bogati A i T bazama. |
| Ostala imena | |
| Minisateliti su takođe poznati kao tandem ponavljanja promenljivog broja (VNTR). | Mikrosateliti su takođe poznati kao ponavljanja kratkih sekvenci (SSR) ili jednostavna tandemska ponavljanja (STR). |
Sažetak – minisatelit vs mikrosatelit
Minisatelit i mikrosatelit su dvije vrste tandem ponavljanja. Razlikuju se na osnovu broja baza u nizu koji se ponavlja ili veličine niza. Minisatelit ima ponavljajuću sekvencu dužine od 10 do 100 parova baza, dok mikrosatelit ima ponavljajuću sekvencu dužine od 1 do 9 parova baza. Ovo je glavna razlika između minisatelita i mikrosatelita. Broj kopija ponavljajuće sekvence u minisatelitima i mikrosatelitima uvelike varira među pojedincima. I minisateliti i mikrosateliti su moćni DNK markeri za analizu genetskih varijacija unutar i između populacija vrsta.
Preuzmite PDF verziju Minisatellite vs Microsatellite
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti ga za vanmrežne svrhe prema napomenama o citatima. Molimo preuzmite PDF verziju ovdje Razlika između minisatelita i mikrosatelita.
