Ključna razlika između dATP i ddATP je u tome što dATP ne prekida sintezu DNK dok ddATP može prekinuti sintezu DNK. To je zato što ddATP ima H atom vezan za 3' poziciju šećera pentoze, dok dATP ima OH grupu vezanu za 3' poziciju.
dNTP-ovi su građevni blokovi DNK. Postoje četiri tipa dNTP prema purinskim ili pirimidinskim bazama - dATP jedan od njih. Dušična baza dATP-a je adenozin. ddNTP su nukleotidi koji se koriste u Sangerovom sekvenciranju. Postoje četiri tipa ddNTP. ddATP je ddNTPs.
Šta je dATP?
Deoksiadenozin trifosfat je nukleotid, koji je građevni blok DNK. Enzim DNK polimeraza koristi dATP kao supstrat za sintezu DNK. dATP ima tri komponente: molekul šećera deoksiriboze, adenozin i tri fosfatne grupe. Dakle, radi se o purin nukleozid trifosfatu. Hemijska formula dATP-a je C10H16N5O12 P3, i njegova molekularna masa je 491.182.
Slika 01: dATP
dATP se razlikuje od ATP-a (adenozin trifosfata) u pogledu komponenti šećera. ATP ima ribozu šećer. dATP baza se uparuje sa uracil nukleotidom tokom transkripcije. Osim što učestvuje u sintezi DNK, dATP može djelovati i kao molekul za prijenos energije za održavanje vitalnosti ćelije. Visok nivo dATP u tijelu je toksičan jer može djelovati kao nekompetitivni inhibitor enzima ribonukleotid reduktaze. To može dovesti do oštećenja imunološke funkcije.
Šta je ddATP?
Dideoksiadenozin trifoafat ili ddATP je jedan od četiri tipa nukleotida koji se koriste u Sanger metodi sekvenciranja. Strukturno, ddATP takođe ima tri komponente slične dATP-u. Oni su adenin baza, deoksiriboza šećer i tri fosfata.
Slika 02: ddATP
Za razliku od dATP, ddATP nema OH grupu na 3' poziciji pentoznog šećera da bi formirao fosfodiestarsku vezu sa susednim nukleotidom i nastavio elongaciju lanca. Ima H atom na poziciji 3'. Stoga, kada se ddATP ugradi, sinteza DNK dolazi do kraja. To je osnovni princip Sangerovog sekvenciranja. Stoga, ddATP djeluje kao inhibitor elongacije lanca u Sangerovom sekvenciranju. Postoje četiri epruvete koje se koriste u Sanger sekvenciranju i ddATP se dodaje u jednu epruvetu.
Koje su sličnosti između dATP i ddATP?
- dATP i ddATP su nukleotidi.
- Oba se sastoje od adenina, deoksiriboze i tri fosfata.
- Ona su organska jedinjenja.
- I dATP i ddATP se dodaju u epruvete u Sangerovom sekvenciranju.
Koja je razlika između dATP i ddATP?
dATP ima OH grupu na 3' poziciji šećera pentoze, dok ddATP nema OH grupu na 3' poziciji pentoznog šećera. Nadalje, dATP je monomer koji se koristi u sintezi DNK, dok se ddATP koristi za prekid elongacije lanca tokom Sangerovog sekvenciranja. Dakle, ovo je ključna razlika između dATP i ddATP. Štaviše, dATP može formirati fosfodiestarske veze dok ddATP ne može formirati fosfodiestarske veze.
Infografika ispod pokazuje više razlika između dATP i ddATP u tabelarnom obliku za usporedbu.
Sažetak – dATP vs ddATP
Ukratko, dATP je prekursor sinteze DNK, dok je ddATP nukleotid koji se koristi za završetak sinteze DNK u Sangerovom sekvenciranju. Štaviše, dATP ima OH grupu na poziciji 3' pentoznog šećera i omogućava formiranje fosfodiestarske veze sa sljedećim nukleotidom. U međuvremenu, ddATP nema OH grupu na 3' poziciji; dakle, nije u stanju da formira fosfodiestarsku vezu sa sledećim nukleotidom. Kao rezultat toga, DNK sekvenca prestaje da se produžava. Dakle, ovo rezimira razliku između dATP i ddATP.