Koja je razlika između jezgre RNA polimeraze i holoenzima

2024 Autor: Alex Aldridge | [email protected]. Zadnja izmjena: 2023-12-17 13:33

Ključna razlika između jezgra RNA polimeraze i holoenzima je u tome što je jezgro RNA polimeraze enzim koji nema sigma faktor, dok je holoenzim RNA polimeraze enzim koji se sastoji od sigma faktora.

Transkripcija u bakterijama je proces u kojem se segment bakterijske DNK kopira u novosintetizirani mRNA lanac uz korištenje enzima RNA polimeraze. Ovaj proces se odvija u tri glavna koraka: inicijacija, elongacija i završetak. Bakterijska RNA polimeraza se sastoji od 6 podjedinica. Jezgro RNA polimeraze se sastoji od β, β′, α2 i ω podjedinica. Ovo jezgro RNA polimeraze se transformiše u holoenzim kada je σ (sigma) faktor vezan za jezgro enzima. Jezgro RNA polimeraze i holoenzim su dva oblika enzima bakterijske RNA polimeraze.

Šta je jezgro RNA polimeraze?

RNK polimeraza jezgro je enzim uključen u transkripciju bakterija koji ne sadrži sigma faktor. Sastoji se od 5 podjedinica označenih kao β, β′, α2 i ω. Ovaj enzim ne pokreće specifičnu transkripciju sa promotora DNK bakterija i faga. To je zato što ne prepoznaje nikakve specifične bakterijske ili fagne DNK promotore. Međutim, ovaj enzim zadržava sposobnost transkripcije RNK iz nespecifičnih inicijalnih sekvenci. Štaviše, dodavanje sigma faktora ovom enzimu omogućava enzimu da započne sintezu RNK iz specifičnih bakterijskih i fagnih promotora. Molekularna težina jezgra enzima RNA polimeraze je približno 400 kDa.

Slika 01: Jezgro RNA polimeraze

Osnovni enzim sadrži katalitička svojstva RNA polimeraze. α podjedinica je homodimer veličine 36,5 kDa. Kodira ga rpoA gen. Funkcije ove podjedinice su sklapanje RNAP-a, interakcije sa DNK i faktori transkripcije za regulaciju transkripcije. Β podjedinica je veličine 150,4 kDa. Kodira ga rpoB gen. Funkcije ove podjedinice su vezivanje DNK i RNK, sinteza RNK, vezivanje NTP, vezivno mesto RMP i vezivanje σ faktora. β′ podjedinica je veličine 155 kDa, a kodira je rpoC gen. Funkcije ove podjedinice su DNK vezivanje, sinteza RNK, katalitička Mg^{2+ koordinacija, ppGpp vezujuće mjesto 1 i σ faktor vezivanje. Nadalje, ω faktor je veličine 10,2 kDa i kodiran je rpoZ genom. Funkcija ω faktora je RNAP savijanje i ppGpp vezno mjesto 1.}

Šta je RNA polimeraza holoenzim?

Holoenzim RNK polimeraze se sastoji od specifične komponente poznate kao sigma faktor osim β, β′, α2 i ω podjedinica. Zbog sigma faktora, holoenzim RNK polimeraze može prepoznati promotore. Sigma faktor takođe pomaže u pravilnom postavljanju holoenzima RNA polimeraze i odmotavanju na početnom mestu. Jednom kada sigma faktor izvrši svoju potrebnu i specifičnu funkciju, on se odvaja od holoenzima RNA polimeraze dok katalitički dio (β, β′, α2 i ω) RNA polimeraze ostaje u DNK i nastavlja transkripciju.

Slika 02: Holoenzim RNA polimeraze

Broj sigma faktora varira između bakterijskih vrsta. E. coli ima sedam sigma faktora. Štaviše, sigma faktori se razlikuju po svojoj karakterističnoj molekularnoj težini. Na primjer, σ⁷⁰ je sigma faktor s molekulskom težinom od 70 kDa. Bakterije koriste različite sigma faktore u različitim uvjetima okoline. Primjeri različitih faktora σ uključuju; σ¹⁹, σ²⁴, σ¹⁸, σ³², σ³⁸ i σ⁵⁴

Koje su sličnosti između jezgra RNA polimeraze i holoenzima?

• Jezgro RNA polimeraze i holoenzim su dva oblika enzima bakterijske RNA polimeraze.
• Oba oblika su uključena u bakterijsku transkripciju.
• Imaju podjedinice.
• To su proteinski molekuli sastavljeni od aminokiselina.

Koja je razlika između jezgra RNA polimeraze i holoenzima?

Jezgro RNA polimeraze je enzim koji nema sigma faktor, dok je holoenzim RNA polimeraze enzim koji se sastoji od sigma faktora. Dakle, ovo je ključna razlika između jezgre RNA polimeraze i holoenzima. Nadalje, jezgro RNA polimeraze uglavnom učestvuje u koraku elongacije transkripcije, dok holoenzim RNA polimeraze uglavnom katalizira u koraku inicijacije transkripcije.

Infografika ispod predstavlja razlike između jezgra RNA polimeraze i holoenzima u tabelarnom obliku radi usporedbe.

Sažetak – jezgro RNA polimeraze vs holoenzim

Bakterijska RNA polimeraza je enzim zavisan od više podjedinica DNK. Učestvuje u transkripciji bakterija. To je ključni enzim ekspresije gena i meta regulacije. Jezgro RNA polimeraze i holoenzim su dva oblika enzima bakterijske RNA polimeraze. Jezgro RNA polimeraze nema sigma faktor, dok se holoenzim RNA polimeraze sastoji od sigma faktora. Dakle, ovo rezimira razliku između jezgra RNA polimeraze i holoenzima.