Ključna razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog je da u 1% agaroznom gelu ksilen cijanol migrira sporije, dok bromofenol plavo migrira brže.
Ksilen cijanol i bromofenol plavo važni su kao markeri boje koji se mogu koristiti u praćenju procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu.
Šta je Xylene Cyanol?
Ksilen cijanol je elektroforetski marker u boji ili boja za praćenje. Koristan je u praćenju procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Kada se ova supstanca pomeša sa uzorkom, koncentracija ove supstance obično postaje oko 0.005% do 0,03%. Neki sinonimi koje možemo koristiti za ksilen cijanol uključuju Acid Blue 147, ksilen cijanol, ksilen cijanol FF, ksilen cijanol FF, itd.
Hemijska formula ovog jedinjenja je C25H27N2NaO 6S2 Molarna masa ksilen cijanola je 538,61 g/mol. Ova supstanca može migrirati brzinom od oko 4-5 kilobaznih parova DNK fragmenata u 1% agaroznih gelova. Međutim, to ovisi o baferu koji koristimo. Tipično, ksilen cijanol na 6% poliakrilamidnom gelu može migrirati brzinom od oko 140 fragmenata DNK parova baza. S druge strane, može migrirati u elektroforezi 20% denaturirajućeg poliakrilamidnog gela brzinom od 25 baza oligonukleotida.
Broj donora vodonične veze za ksilen cijanol je 2m, a broj akceptora vodonične veze je 8. Broj rotirajućih veza ovog jedinjenja može se dati kao 7. Složenost ksilen cijanola može se opisati kao 1120 stepeni. Ima definisan broj stereocentra veze od 1.
Šta je bromofenol plava?
Bromfenol plava je koristan pH indikator koji je koristan kao elektroforetski marker boje i boja. Ima hemijsko ime 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromofenolsulfonftalein, BPB. Hemijska formula ovog jedinjenja je C19H10Br4O5 S. Molarna masa ovog jedinjenja je 669,96 g/mol. Bez mirisa je, a njegova gustina se može dati kao 2,2 g/mL. Njegova tačka topljenja je 273 stepena Celzijusa, a tačka ključanja je 279 stepeni Celzijusa. Možemo ga pripremiti polaganim dodavanjem viška broma u vruću otopinu fenolsulfonftaleina u glacijalnoj octenoj kiselini.
Bromfenol plava je korisna kao acido-bazni indikator u rasponu između pH 3,0 do 4,6. Može se promijeniti iz žute na pH 3,0 do pH 4,6. Štaviše, to je reverzibilna reakcija. Strukturno, bromofenol plavo je slično fenolftaleinu.
Osim toga, možemo ga koristiti kao kolor marker za praćenje procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Ova supstanca može nositi negativan naboj pri umjerenom pH, gdje može migrirati u istom smjeru kao DNK ili protein u gelu. Brzina migracije može varirati ovisno o gustini gela i sastavu pufera. Međutim, u tipičnom 1% agaroznom gelu u jednom TAE puferu ili TBE puferu, ova supstanca migrira istom brzinom kao i fragment DNK od oko 300 parova baza.
Koja je razlika između ksilen cijanola i bromofenol plave?
Ksilen cijanol i bromofenol plava su važni markeri boja. Ključna razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog je da u 1% agaroznom gelu, ksilen cijanol migrira sporije, dok bromofenol plavo migrira brže.
U nastavku je sažetak razlike između ksilen cijanola i bromofenol plave u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – Xylene Cyanol vs Bromofenol Blue
Ksilen cijanol i bromofenol plavo su važni kao markeri boje koji se koriste u praćenju procesa elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu. Ključna razlika između ksilen cijanola i bromofenol plavog je da u 1% agaroznom gelu ksilen cijanol migrira sporije dok bromofenol plavo migrira brže.
