Ključna razlika između Cosmida i Phagemida je u vrsti sekvenci koje sadrži. Kosmid sadrži cos mjesto i plazmid. Stoga je to hibridni vektor dok je Phagemid plazmid koji sadrži F1 porijeklo replikacije F1 faga.
Kosmidi i Phagemidi se koriste u svrhe kloniranja, posebno za kloniranje većih fragmenata DNK. Oni se široko koriste, posebno u kloniranju gena odgovornih za proizvodnju različitih proteina. Kosmidi i fagemidi se ili repliciraju sami kao plazmidi ili se pakuju u virusne čestice i zatim repliciraju.
Šta je kosmid?
A Kosmid, koji se naziva hibridni plazmid, sadrži cos mjesta ekstrahirana iz čestica Lambda faga i plazmida. Ova cos mjesta su dugi fragmenti DNK sa 200 baznih parova. Stoga imaju kohezivne ili ljepljive krajeve koji omogućavaju plazmidu da se uklopi u virusnu DNK. Stoga su cos lokacije vitalne za pakovanje DNK.
Postoje tri cos lokacije;
- cosN mjesto – uključeno u isjecanje DNK lanca putem terminazne aktivnosti
- cosB lokacija – uključena u zadržavanje terminala.
- cosQ lokacija – uključena u sprečavanje degradacije DNK od strane DNaza.
Slika 01: Cosmid
Takođe, kozmidi mogu replicirati jednolančanu DNK ili dvolančanu DNK koristeći odgovarajući izvor replikacije. Kosmidi obično sadrže gene otpornosti na antibiotike kao markere za selekciju transformanata. Dakle, upotreba kozmida kao vektora može olakšati kloniranje, a restrikcijski enzim digestija vektora može zatim ekstrahirati ove fragmente.
Šta je Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, takođe nazvan Phasmid, je takođe vrsta hibridnog vektora. Phagemid sadrži posebno porijeklo replikacije nazvano kao f1 porijeklo replikacije. F1 porijeklo replikacije izvodi se iz f1 faga.
Phagemid može replicirati i jednolančanu i dvolančanu DNK. Replikacija se može odvijati kao plazmid dok prolazi kroz nezavisnu replikaciju ili se može upakovati u čestice faga i konačno inficirati bakterijskog domaćina E coli. Kada inficira ćelije E coli, f1 fag zahtijeva prisustvo pilusa. Stoga su seksualni pili važni tokom in vitro pakovanja Phagemida.
Koje su sličnosti između Cosmida i Phagemida?
- I Cosmid i Phagemid su klonirajući vektori koji se koriste u tehnologiji rekombinantne DNK.
- Cosmid i Phagemid mogu replicirati jednolančanu i dvolančanu DNK.
- Oba mogu proći nezavisnu replikaciju sličnu plazmidima.
- Cosmid i Phagemid mogu biti podvrgnuti in vitro pakovanju i inficirati bakterijske ćelije.
- I Cosmid i Phagemid zahtijevaju odgovarajuće porijeklo replikacije za kloniranje.
Koja je razlika između Cosmida i Phagemida?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid je hibridni vektor koji sadrži cos mjesto i plazmid. | Phagemid je plazmid koji sadrži F1 porijeklo replikacije F1 faga. |
| Prisutnost Cos lokacija | |
| Cos stranice su prisutne u cosmid-u i neophodne su za in vitro pakovanje. | Zato što u phagemid-u nema lokacija. |
| Prisutnost F1 porijekla replikacije | |
| U kosmidu, fi porijeklo replikacije može ili ne mora biti prisutna. | F1 porijeklo replikacije je prisutno u fagemidu. |
| Prisustvo gena otpornih na antibiotike | |
| Geni otporni na antibiotike prisutni su u kozmidima da identifikuju transformante od netransformanata. | Geni otporni na antibiotike su odsutni u fagemidima. |
| Zahtjev za in vitro pakovanje | |
| Zahtijeva cos site. | Zahtijeva sex pilus. |
Sažetak – Cosmid vs Phagemid
Cosmid i Phagemid su klonirajući vektori koji se koriste u tehnologiji rekombinantne DNK. Kosmidi su hibridni vektori koji sadrže posebne ljepljive krajeve poznate kao cos mjesta. In vitro pakovanje zahtijeva ove cos lokacije. Dok su fagemidi plazmidi koji sadrže f1 porijeklo replikacije ekstrahirano iz f1 faga. I kozmid i fagemid mogu se podvrgnuti nezavisnoj replikaciji ili in vitro pakovanju u bakterijske ćelije. Ovo su važne razlike između kosmida i fagemida.
