Ključna razlika između Watsona i Crick-ovog i Hoogsteenovog uparivanja baza je u tome što je Watson-ovo i Crickovo uparivanje baza standardni način koji opisuje formiranje parova baza između purina i pirimidina. U međuvremenu, Hoogsteenovo uparivanje baza je alternativni način formiranja baznih parova u kojem purin poprima drugačiju konformaciju u odnosu na pirimidin.
Nukleotid ima tri komponente: azotnu bazu, pentozni šećer i fosfatnu grupu. Postoji pet različitih azotnih baza i dva pentozna šećera koji su uključeni u strukturu DNK i RNK. Kada ovi nukleotidi formiraju nukleotidnu sekvencu, komplementarne baze, bilo purini ili pirimidini, između njih formiraju vodikove veze. Ovo je poznato kao uparivanje baza. Stoga se par baza formira spajanjem dvije dušične baze vodoničnim vezama. Watsonovo i Crickovo uparivanje baza je klasični ili standardni pristup, dok je Hoogsteenovo uparivanje baza alternativni način formiranja baznih parova.
Šta je uparivanje Watson i Crick baze?
Watsonovo i Crickovo uparivanje baza je standardna metoda koja objašnjava uparivanje baza azotnih baza u nukleotidima. James Watson i Francis Crick, 1953. godine, objasnili su ovu metodu uparivanja baza, koja stabilizira dvostruke standardne spirale DNK. Prema Watson-ovom i Krikovom uparivanju baza, adenin formira vodonične veze sa timinom u DNK i sa uracilom u RNK. Štaviše, gvanin formira vodonične veze sa citozinom u DNK i RNK.
Slika 01: Uparivanje Watson i Crick baze
Postoje tri vodonične veze između G i C, dok postoje dvije vodonične veze između A i T. Ovi parovi baza omogućavaju spirali DNK da održi svoju pravilnu spiralnu strukturu. Većina nukleotidnih sekvenci (60%) ima Watson i Crick bazne parove koji su stabilni na neutralnom pH.
Šta je Hoogsteen Base Pairing?
Hoogsteen uparivanje baza je alternativni način formiranja baznih parova u nukleinskim kiselinama. Ovo je prvi opisao američki biohemičar Karst Hoogsteen 1963. Hoogsteen bazni parovi su slični parovima baza Watson i Crick. Javljaju se između adenina (A) i timina (T), te guanina (G) i citozina (C). Ali purin ima drugačiju konformaciju u odnosu na pirimidin. U paru baza A i T, adenin je rotiran za 1800 oko glikozidne veze, omogućavajući alternativnu šemu vodonične veze. Slično, u G i C paru, gvanin je rotiran za 180° oko glikozidne veze. Štaviše, ugao glikozidnih veza je veći u Hoogsteenovim baznim parovima. Osim toga, formiranje Hoogsteen baznih parova nije stabilno na neutralnom pH.
Slika 02: Watson i Crick uparivanje baze vs Hoogsteen uparivanje baze
Hoogsteen parovi baza su nekanonski parovi baza koji čine nukleotidne sekvence manje stabilnim od standardnog uparivanja baza. Štaviše, mogu dovesti do prekida dvostruke spirale DNK. Iako se Hoogsteen bazni parovi javljaju prirodno, oni su vrlo rijetki.
Koje su sličnosti između Watsona i Crick-a i Hoogsteen baznog uparivanja?
- Watson i Crick i Hoogsteen uparivanje baza su dva načina da se opiše formiranje baznih parova u nukleinskim kiselinama.
- Oba se prirodno javljaju u DNK.
- Štaviše, oni postoje u ravnoteži jedan s drugim.
- Bazni parovi su slični u oba metoda.
Koja je razlika između Watsona i Crick i Hoogsteen uparivanja baze?
Watson i Crick bazno uparivanje je standardni način koji opisuje formiranje parova baza između purina i pirimidina. S druge strane, Hoogsteenovo uparivanje baza je alternativni način formiranja baznih parova u kojem purin poprima drugačiju konformaciju u odnosu na pirimidin. Dakle, ovo je ključna razlika između Watsona i Crick i Hoogsteen baznog uparivanja. Uparivanje baza Watson i Crick opisali su James Watson i Francis Crick 1953., dok je Hoogsteen bazno uparivanje opisao Karst Hoogsteen 1963. Štaviše, parovi Watson i Crick baza su stabilni dok su Hoogsteen bazni parovi obično manje stabilni.
Infografika ispod sažima razliku između Watson i Crick i Hoogsteen baznog uparivanja.
Sažetak – Watson i Crick vs Hoogsteen Base Pairing
Watsonovo i Crickovo uparivanje baza i Hoogsteenovo uparivanje baza su dvije vrste načina koji opisuju formiranje azotnih baza u nukleotidnim sekvencama. Kod Hoogsteenovog uparivanja baza, purinska baza poprima drugačiju konformaciju u odnosu na pirimidinsku bazu. Dakle, ovo je ključna razlika između Watsona i Crick i Hoogsteen baznog uparivanja. Štaviše, parovi baza Watson i Crick stabiliziraju dvostruku spiralu DNK, dok parovi Hoogsteen baza čine spiralu nestabilnom. Međutim, oba tipa baznih parova se javljaju prirodno i postoje u ravnoteži jedan s drugim.
