Ključna razlika između gena kandidata i GWAS-a je u tome što pristup gena kandidata istražuje genetsku varijaciju unutar malog broja unaprijed specificiranih gena od interesa, dok GWAS istražuje cijeli genom za uobičajenu genetsku varijaciju iza određenog stanja bolesti.
Pristup gena kandidata i studije asocijacija na nivou genoma (GWAS) su dvije metode koje su važne za otkrivanje genetske osjetljivosti na bolesti. Pristup gena kandidata zasniva se na unaprijed određenom malom broju gena, dok se GWAS temelji na testiranju cijelog genoma. Stoga pristup gena kandidata zahtijeva prethodno poznavanje gena koji su relevantni za bolest, za razliku od GWAS-a.
Šta je Candidate Gene?
Pristup gena kandidata je jedna od tehnika koja istražuje povezanost između genetske varijacije unutar unaprijed specificiranih gena od interesa i fenotipova ili bolesnih stanja. U ovom pristupu potrebno je prethodno znanje o biološkom funkcionalnom utjecaju gena na osobinu ili bolest o kojoj je riječ. Na osnovu ovog saznanja, mali broj gena je odabran i analiziran za genetske varijacije.
Slika 01: Pristup gena kandidata
Odabir gena se vrši na osnovu biološke, fiziološke i funkcionalne važnosti za bolest o kojoj je riječ u ovom pristupu. Ovaj pristup je često dizajniran kao studija kontrole slučaja.
Šta je GWAS?
GWAS je skraćenica od Genome-Wide Association Study. Također se odnosi na studije asocijacija cijelog genoma. Ove studije se uglavnom fokusiraju na opservacijske studije. Oni analiziraju genetske varijante različitih jedinki koje se obično povezuju sa određenom osobinom. Cijeli genom je važan za GWAS analizu.
GWAS je važan alat u analizi polimorfizama pojedinačnih nukleotida povezanih sa različitim bolestima. To je komparativna studija različitih polimorfizama pojedinačnih nukleotida u širokoj populaciji. Ispitni uzorak GWAS-a je veoma visok; stoga, također uzima format kohortne studije poprečnog presjeka.
Slika 02: GWAS
Prva GWAS studija sprovedena je u vezi sa infarktom miokarda i analizom gena povezanih sa infarktom miokarda. Trenutno, GWAS igra važnu ulogu u određivanju genetske pozadine složenih bolesti nepoznate etiologije.
Koje su sličnosti između gena kandidata i GWAS-a?
- I pristup genom kandidata i GWAS su tehnike koje analiziraju genetsku povezanost između genotipa i fenotipa bolesti.
- Oba pristupa pomažu u razumijevanju genetske osnove podložnosti bolesti.
Koja je razlika između gena kandidata i GWAS-a?
Pristup gena kandidata zasniva se na genima kandidatima ili unapred specificiranim genima, dok je GWAS zasnovan na celokupnom genomu. Dakle, ovo je ključna razlika između gena kandidata i GWAS. Takođe, u pristupu gena kandidata, selekcija gena je neophodna dok u GWAS nije potrebna.
Štaviše, pristup gena kandidata zahtijeva prethodno znanje o genima relevantnim za bolest, dok nije neophodno za GWAS.
Infografika ispod pruža detaljnije poređenje vezano za razliku između gena kandidata i GWAS-a.
Sažetak – Candidate Gene vs GWAS
Kandidat gen i GWAS su dvije studije asocijacije gena. Pristup gena kandidata fokusira se na genetske varijacije povezane s bolešću unutar malog broja unaprijed specificiranih gena. Nasuprot tome, GWAS istražuje genetske varijacije povezane s bolešću unutar cijelog genoma. Dakle, ovo je ključna razlika između gena kandidata i GWAS. Obje metode su važne za razumijevanje genetske osnove podložnosti bolesti.
