Ključna razlika između CDS-a i cDNA je u tome što je CDS ili kodirajuća sekvenca dio transkripta koji je zapravo preveden u protein, dok je cDNA sekvenca DNK sekvenca izvedena iz mRNA reverznom transkripcijom.
Gen je nukleotidna sekvenca koja kodira protein. Sastoji se od različitih regiona kao što su region promotora, mesto inicijacije transkripcije, egzoni, startni kodon, introni i stop kodon. Stoga, gen ima i kodirajuće i nekodirajuće sekvence. Kodirajuće sekvence ili CDS se odnose na egzone i dva kodona, koji su startni kodon i stop kodon. To je sekvenca koja se zapravo prevodi u protein. Nasuprot tome, cDNK je DNK sekvenca izvedena iz mRNA reverznom transkripcijom.
Šta je CDS?
CDS ili kodirajuća sekvenca je dio gena koji je zapravo preveden u protein. Sastoji se od egzona i dva kodona kao AUG kodona i stop kodona. Za razliku od cDNK, CDS ne sadrži dva neprevedena regiona: 5’ UTR i 3” UTR. Štaviše, introni nisu uključeni u CDS.
Slika 01: Sekvenca kodiranja
U poređenju sa celim genomom i pojedincem, kodirajuće sekvence su mali deo. Kodirajuća sekvenca se sastoji od potrebne nukleotidne sekvence za stvaranje aminokiselinske sekvence proteina.
Šta je cDNK?
cDNK ili komplementarna DNK je DNK sekvenca generisana iz mRNA sekvence. Sintetizira se procesom koji se naziva reverzna transkripcija. Enzim reverzna transkriptaza katalizira sintezu cDNK, a sekvenca mRNA djeluje kao šablon za sintezu cDNK. U osnovi, mRNA eukariotskih ćelija može se ekstrahovati i pročistiti kako bi se napravila cDNK. Nakon konstruisanja cDNK od mRNA, oni se zatim mogu klonirati u bakterijsku ćeliju kako bi se napravile biblioteke cDNK. Biblioteke cDNK su važne za analizu kodirajućih regiona, genskih funkcija i ekspresije gena, itd.
Slika 02: cDNA
Za razliku od kodirajuće sekvence, cDNK sadrži dva UTR, a to su 3’ UTR i 5’ UTR. Slično kodirajućoj sekvenci, cDNK ne sadrži introne.
Koje su sličnosti između CDS-a i cDNA?
- CDS i cDNK su nukleinske kiseline.
- Napravljeni su od deoksiribonukleotida.
- I CDS i CDNA ne sadrže introne, koji su nekodirajuće regije.
- Oba sadrže genetski kod ili informacije za proizvodnju proteina.
Koja je razlika između CDS-a i cDNA?
CDS ili kodirajuća sekvenca je dio gena koji je zapravo preveden u protein. S druge strane, cDNK sekvenca je DNK sekvenca izvedena iz mRNA reverznom transkripcijom. Dakle, ovo je ključna razlika između CDS-a i cDNK. Osim toga, CDS se sastoji od egzona i dva kodona, koji su startni i stop kodon. Nasuprot tome, cDNK se sastoji od kompletne sekvence mRNA i dva UTR.
Štaviše, sinteza cDNK se vrši umjetno iz mRNA reverznom transkripcijom dok se CDS nalaze u genomskoj DNK.
Infografika ispod prikazuje više poređenja kako bi se uočila razlika između CDS-a i cDNA.
Sažetak – CDS vs cDNA
Kodirajuća sekvenca i cDNK su dvije vrste nukleotidnih sekvenci. Kodirajuća sekvenca leži unutar gena dok se cDNK sintetizira umjetno. Kodirajuća sekvenca ima egzone i dva kodona, dok cDNK ima sekvencu mRNA i dva UTR. I CDS i cDNK imaju samo nukleotidne sekvence koje se zapravo prevode u protein. Ne sadrže introne. Za razliku od CDS-a, proces sinteze cDNK zahtijeva enzim reverzne transkriptaze. Također, cDNK se može pretvoriti u cDNK biblioteke. Dakle, ovo rezimira razliku između CDS-a i cDNA.
