Ključna razlika između CRISPR-a i CRISPR-a Cas9 je u tome što je CRISPR (grupisani, redovno raspoređeni kratki palindromski ponavljanja) prirodni prokariotski imunološki odbrambeni mehanizam dok je CRISPR cas9 RNA vođena Cas9 nukleaza koja je dio CRISPR adaptive imuni sistem.
CRISPR je imuni sistem protiv virusa koji se nalazi u bakterijama i arhejama. To je porodica sekvenci DNK koje se nalaze u bakterijskom genomu. Sastoji se od razmaknutih sekvenci koje su izvedene iz fragmenata DNK bakteriofaga koji su ih prethodno inficirali. U kasnijim virusnim infekcijama, bakterije koriste ove sekvence da unište virusnu DNK. CRISPR sekvence imaju kratke palindromne ponavljanja i razmaknice. Štaviše, CRISPR ponavljajuće razmakne sekvence često imaju povezane gene koji kodiraju Cas proteine. Cas9 je RNA vođena endonukleaza. Zajedno sa CRISPR sekvencama, protein Cas9 djeluje kao adaptivni imuni sistem u bakterijama protiv bakteriofaga.
Šta je CRISPR?
CRISPR je skraćenica za klasterisana pravilno razmaknuta kratka palindromska ponavljanja. To je skup DNK sekvenci pronađenih u bakterijskom genomu. Djeluje kao prirodni odbrambeni mehanizam kod bakterija, a prvi put je identificiran kod E. coli. Kod bakterija djeluje kao adaptivna imunološka zaštita, posebno protiv bakteriofaga. Stoga je to mehanizam specifičan za sekvencu.
Slika 01: CRISPR
CRISPR sistem sadrži nekoliko kratko-segmentiranih sekvenci ponavljanja DNK. Ova ponavljanja su palindromska, imaju istu baznu sekvencu kada se čita od 5’ do 3’, dok druga daje istu sekvencu kada se čita od 3’ do 5’. Štaviše, ponavljanja su identična. Nalaze se između kratkih "spacer" DNK sekvenci koje nisu identične. Ali ove sekvence DNK razmaknice su slične ili se podudaraju sa stranim bakteriofagnim DNK. Geni povezani sa CRISPR-om poznati su kao geni povezani sa CRISPR-om ili Cas geni. Cas geni kodiraju za Cas proteine koji su helikaze ili nukleaze. Helikaze odmotavaju DNK dok nukleaze režu DNK. Sve u svemu, kada se uzme u obzir CRISPR, to je imuni sistem bakterija koji radi protiv bakteriofaga (bakterije koje inficiraju viruse).
Šta je CRISPR Cas9?
Cas9 ili CRISPR povezan protein 9 je bakterijska RNA vođena endonukleaza. Stoga je to enzim koji prepoznaje i seče ciljnu DNK (posebno DNK bakteriofaga) komplementarnu vodećoj RNK. Obavlja cijepanje specifično za niti. Cas9 protein je kodiran CRISPR povezanim genom. CRISPR cas9 je RNA-vođeni CRISPR-Cas9 nukleazni sistem koji se može koristiti kao RNA-programabilna DNK platforma za ciljanje i uređivanje za uređivanje genoma, transkripcionu perturbaciju, epigenetsku modulaciju i snimanje genoma. Ovaj CRISPR cas9 sistem je veoma popularan u trenutnim sistemima za uređivanje genoma.
Slika 02: CRISPR Cas9
Trenutno se CRISPR/Cas9 sistem koristi za izmjenu ili modificiranje genoma sisara putem potiskivanja transkripcije ili aktivacije. Ćelije sisara mogu odgovoriti na CRISPR/Cas9 posredovane prekide DNK usvajanjem mehanizma popravke. To se može izvesti korištenjem metode nehomolognog spajanja krajeva (NHEJ) ili popravke usmjerene na homologiju (HDR). Oba ova mehanizma popravke odvijaju se uvođenjem dvolančanih prekida. Ovo rezultira uređivanjem gena sisara. NHEJ može dovesti do ablacije genskih mutacija i može se koristiti za stvaranje efekata gubitka funkcije. HDR se može koristiti za uvođenje specifičnih tačkastih mutacija ili uvođenje DNK segmenata različite dužine. Trenutno se CRISPR/Cas sistem koristi u oblastima terapeutskih, biomedicinskih, poljoprivrednih i istraživačkih aplikacija.
Koje su sličnosti između CRISPR-a i CRISPR-a Cas9?
- Cas9 je dio CRISPR Cas sistema.
- Crisper cas9 sistem je imuni sistem koji se prirodno nalazi u bakterijama.
Koja je razlika između CRISPR-a i CRISPR-a Cas9?
CRISPR je skup DNK sekvenci pronađenih u bakterijskom genomu koji radi kao prirodni odbrambeni sistem protiv bakteriofaga. Sastoji se od pravilno raspoređenih kratkih palindromskih ponavljanja, razmaknica i povezanih gena. Nasuprot tome, cas9 je protein 9 povezan sa CRISPR-om, koji je enzim endonukleaze vođen RNA. Prepoznaje i cijepa DNK dvostruke niti virusa. U stvari, to je dio odbrambenog sistema CRISPR. Dakle, ovo je ključna razlika između CRISPR-a i CRISPR cas9.
Sažetak – CRISPR vs CRISPR Cas9
CRISPR Cas sistem je sistem odbrane mikroba. CRISPR je skup DNK sekvenci koji se sastoji od palindromskih kratkih ponavljanja, razmaknica i povezanih gena. Cas9 je jedan Cas protein koji je RNA vođena endonukleaza. CRISPR i Cas9 protein čine imuni sistem koji radi protiv bakterijskih infekcija bakteriofaga. Protein Cas9 je u stanju da cijepa stranu virusnu DNK i poremeti ih. CrRNA vodi cas9 da prepozna virusnu DNK. Stoga je sistem CRISPR cas9 prirodni imuni sistem koji se nalazi u bakterijama protiv virusa. Dakle, ovo je sažetak razlike između CRISPR-a i CRISPR cas9.
