Ključna razlika između TATA i CAAT kutije je ta što je TATA kutija konzervirana nukleotidna regija koja ima konsenzus sekvencu TATAWAW dok je CAAT kutija konzervirana nukleotidna regija sa konsenzusnom sekvencom GGCCAATCT.
TATA kutija i CAAT kutija su dva regiona nukleotida koji utiču na transkripciju eukariotskih gena. To su nekodirajuće sekvence DNK koje se nalaze uzvodno do mjesta inicijacije transkripcije. U stvari, oni se nalaze u regulatornoj regiji, koja je poznata kao promotor. I TATA box i CAAT box su odgovorni za efikasnost transkripcije. Oni su konsenzusni nizovi koji se nisu mijenjali tokom evolucijskog procesa.
Šta je TATA Box?
TATA kutija ili Goldberg-Hogness kutija je konsenzusna sekvenca koja se nalazi u promotorskoj regiji eukariotskih gena. TATA kutija je osnovni element promotera. Nalazi se 25 parova baza uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Čuva se tokom evolucionog procesa. Konsenzusna sekvenca TATA kutije je TATAWAW, gdje je W ili A ili T. To je nekodirajuća DNK sekvenca. Međutim, TATA kutija je važna za transkripciju gena. To je mjesto vezivanja TATA-vezujućeg proteina (TBP) i drugih faktora transkripcije. Jednom kada se vežu u TATA kutiju, regrutovanje RNA polimeraze II i pravilna regulacija transkripcije odvija se u eukariotskim genima.
Slika 01: TATA kutija
Pošto je TATA box uključen u regulaciju transkripcije, mutacije TATA kutije mogu dovesti do fenotipskih promjena koje dovode do bolesti kao što su rak želuca, spinocerebelarna ataksija, Huntingtonova bolest, sljepoća, β-talasemija, imunosupresija, Gilbertov sindrom, i HIV-1, itd.
Šta je CAAT Box?
CAAT kutija je regija nukleotida sa konsenzusnom sekvencom GGCCAATCT. Slično TATA kutiji, CAAT kutija se takođe nalazi u promotorskoj regiji gena. Stoga se nalazi oko 75-80 baznih parova uzvodno do mjesta transkripcije.
Slika 02: CAAT kutija
Specifični faktori transkripcije vezuju se za CAAT kutiju. Ovo vezivanje stabilizuje kompleks preinicijacije radi lakšeg vezivanja enzima RNA polimeraze. Isto tako, CAAT kutija radi kao regulatorni niz. Mutacije u CAAT box regionu jako utiču na odgovor promotera i regulaciju transkripcije.
Koje su sličnosti između TATA i CAAT kutije?
- TATA i CAAT su dva regiona nukleotida koji se nalaze u regulatornoj sekvenci eukariotskih gena.
- Nalaze se uzvodno do mjesta iniciranja transkripcije.
- Obje su konsenzus DNK sekvence.
- Oni su neophodni za regulaciju transkripcije, tako da su regulatorni nizovi.
Koja je razlika između TATA i CAAT kutije?
TATA kutija je konzervirana nukleotidna regija koja se nalazi oko 25-30 baznih parova uzvodno do mjesta inicijacije transkripcije. S druge strane, CAAT kutija je očuvana regija nukleotida koja se nalazi oko 75-80 baznih parova uzvodno do mjesta inicijacije transkripcije. Dakle, ovo je ključna razlika između TATA i CAAT kutije. Osim toga, TATA box ima konsenzus sekvencu TATAWAW dok je GGCCAATCT konsenzus sekvencu CAAT kutije.
Štaviše, još jedna značajna razlika između TATA i CAAT kutije je u tome što TATA kutija pruža vezujuće mjesto za TBP i transkripcione faktore i učestvuje u regulaciji transkripcije, dok CAAT kutija signalizira mjesto vezivanja za RNA transkripcijski faktor.
U nastavku infografika sumira razlike između TATA i CAAT kutije.
Sažetak – TATA vs CAAT kutija
TATA kutija i CAAT kutija su dva dijela očuvane regije promotora eukariotskog gena. Nalaze se uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Oba utiču na transkripciju gena obezbeđujući mesta za vezivanje TATA-vezujućih proteina i faktora inicijacije transkripcije. TATA kutija se nalazi 25-35 baznih parova uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije, dok je CAAT kutija smještena 75-80 parova baza uzvodno od mjesta inicijacije transkripcije. Konsenzusna sekvenca TATA kutije je TATAWAW dok je konsenzusna sekvenca CAAT kutije GGCCAATCT. Dakle, ovo je sažetak razlike između TATA i CAAT kutije.
