Ključna razlika između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidrohlorida je ta što je gvanidin tiocijanat jači proteinski denaturant koji se češće koristi u izolaciji RNK, dok je gvanidin hidrohlorid slabiji proteinski denaturant koji se rjeđe koristi u izolaciji RNK.
Denaturacija je proces u kojem proteini gube svoju kvaternarnu strukturu, tercijarnu strukturu i sekundarnu strukturu koja je normalno prisutna u njihovom prirodnom stanju. To se može postići primjenom nekog vanjskog stresa ili spojeva kao što su jaka kiselina ili baza, koncentrirana anorganska sol, organski rastvarač (alkohol, kloroform), miješanje, zračenje ili toplina. Gvanidin tiocijanat i gvanidin hidrohlorid su dvije različite vrste proteinskih denaturansa.
Šta je gvanidin tiocijanat?
Gvanidin tiocijanat (GTC) je jači agens za denaturaciju proteina koji se češće koristi u izolaciji RNK. Takođe je poznat kao gvanidinijum izotiocijanat (GITC). Budući da je haotropno sredstvo, to je hemijsko jedinjenje koje se rutinski koristi kao generalni denaturant proteina. Haotropni agens je molekul u vodenom rastvoru koji može poremetiti mrežu vodonične veze između molekula vode. Ovo utiče na stabilnost prirodnog stanja drugih molekula u rastvoru, kao što su makromolekuli poput proteina i nukleinskih kiselina slabljenjem hidrofobnog efekta. Haotropni agensi kao što je gvanidin tiocijanat smanjuju količinu reda u strukturi proteina formiranih od molekula vode kako u rasutom stanju, tako iu hidratacijskim školjkama oko hidrofobnih aminokiselina. Ovo može uzrokovati denaturaciju proteina.
Gvanidin tiocijanat se može koristiti za deaktivaciju virusa kao što je gripa koji uzrokuju bolesti poput španske gripe 1918. Stoga se može koristiti u medicinskim ili bolničkim ustanovama. Nadalje, gvanidin tiocijanat se također koristi za lizu ćelija i virusnih čestica u ekstrakcijama RNK i DNK. Ovdje je funkcija gvanidin tiocijanata da potpomaže djelovanje lize i da spriječi aktivnost enzima RNase i enzima DNase denaturacijom. Ovi enzimi bi inače oštetili ekstrakt (RNA ili DNK).
Šta je gvanidin hidrohlorid?
Gvanidin hidrohlorid (GdnHCl) je slabiji denaturant proteina koji se rjeđe koristi u izolaciji RNK. Takođe je poznat kao gvanidinijum hlorid (GdmCl). To je hidrohloridna so gvanidina. Gvanidin hidrohlorid je haotropan i jedan od denaturansa koji se koriste u fizičko-hemijskim studijama savijanja proteina.
Slika 01: Gvanidin hidrohlorid
Gvanidin hidrohlorid takođe ima sposobnost da smanji aktivnost enzima i poveća rastvorljivost hidrofobnih molekula. Normalno, pri višim koncentracijama gvanidin hidrohlorida, proteini gube svoju uređenu strukturu. Proteini imaju tendenciju da se nasumično umotaju pri ovoj koncentraciji gvanidin hidrohlorida. U medicinskim ili bolničkim ustanovama, gvanidin hidrohlorid je indiciran za smanjenje simptoma mišićne slabosti i lakog umora povezanih s bolešću Eaton-Lambertov sindrom. Nadalje, nuspojave upotrebe gvanidin hidrohlorida mogu uključivati perist altiku, dijareju i fatalnu supresiju koštane srži.
Koje su sličnosti između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidrohlorida?
- Gvanidin tiocijanat i gvanidin hidrohlorid su dvije različite vrste proteinskih denaturansa.
- Oba denaturanta imaju gvanidin u svojim strukturama.
- Oni su haotropni agensi.
- Oba denaturanta se mogu koristiti za izolaciju RNK.
- Obe se koriste u medicinskim ili bolničkim ustanovama.
Koja je razlika između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidrohlorida?
Gvanidin tiocijanat je jači proteinski denaturant koji se češće koristi u izolaciji RNK, dok je gvanidin hidrohlorid slabiji proteinski denaturant koji se rjeđe koristi u izolaciji RNK. Dakle, ovo je ključna razlika između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidrohlorida. Nadalje, hemijska formula gvanidin tiocijanata je C2H6N4S, dok je hemijska formula gvanidin hidrohlorida je CH5N3HCl.
Infografika ispod predstavlja razlike između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidrohlorida u obliku tabele za jedno pored drugog poređenje.
Sažetak – gvanidin tiocijanat vs gvanidin hidrohlorid
Gvanidin tiocijanat i gvanidin hidrohlorid su dvije različite vrste proteinskih denaturanata. Oba denaturanta su haotropi. Gvanidin tiocijanat je jači proteinski denaturant koji se češće koristi u izolaciji RNK, dok je gvanidin hidrohlorid slabiji proteinski denaturant koji se rjeđe koristi u izolaciji RNK. Dakle, ovo rezimira razliku između gvanidin tiocijanata i gvanidin hidrohlorida.
