Transposon vs Retrotransposon
Transpozoni i retrotranspozoni su genetske komponente DNK i među njima postoje velike razlike. Postotak prisutnosti ovih genetskih materijala varira među vrstama, a njihove funkcije određuju sudbinu organizma s mutacijama i drugim fenotipski važnim promjenama. Transpozoni i retrotranspozoni su geni ili kolekcije određenih gena smještenih u lancima DNK, a promjene njihove lokacije bile su glavni uzroci ovih posljedica. Međutim, ovaj članak ima za cilj da ukratko prodiskutuje funkcije ovih gena i predstavlja poređenje između transpozona i retrotranspozona.
Šta je Transposon?
Transpozoni su zanimljivi fragmenti ili segmenti DNK sa mogućnošću promjene lokacije lanca DNK u obliku cut and paste mehanizma. Zbog ove mobilne prirode transpozona, oni su poznati kao geni za skakanje. Transpozoni su dva glavna tipa poznata kao transpozoni klase I i transpozoni klase II. Obično se tip klase II naziva transpozoni, a tip klase I se naziva retrotranspozoni. Procesi rezanja i lijepljenja mobilnih segmenata DNK regulirani su enzimom transpozazom. Enzim se veže za oba kraja transpozona i preseca fosfodiesterske veze DNK lanca, izoluje transpozon, premjesti ga na ciljno mjesto i veže se na novoj lokaciji. Međutim, ovaj proces je zanimljiv za razumijevanje, jer se neki transpozoni mogu kretati samo na određene lokacije samo zbog nekompatibilnosti baznih sekvenci sa ciljnim mjestom. Geni sa jednim krajem jednog lanca imaju istu baznu sekvencu sa drugim krajem drugog pojedinačnog lanca su transpozoni sa lepljivim ivicama, jer se oni mogu vezati za mesta ciljne DNK lanca sa istom baznom sekvencom kao i na lepljivim krajevima.. Međutim, ova mobilnost gena može uzrokovati promjene genotipa, kao i fenotipa organizma. Naučnici koji su izmislili transpozone i genetski modifikovana hrana i organizmi prema željenim prilagodbama su tada stavljeni na raspolaganje. Visoko produktivni poljoprivredni usjevi, antibiotici s ljekovitim svojstvima, stočarske životinje bili su neki od proizvoda koji su dobro razvijeni nakon pronalaska transpozona od strane Barbare McClintock 1940-ih.
Šta je Retrotransposon?
Retrotranspozoni su transpozoni klase I, i oni se kreću kroz genom putem mehanizma kopiranja i lijepljenja. Mehanizam mobilnosti retrotransposona uključuje nekoliko glavnih koraka kao što su kopiranje genskog segmenta lanca DNK u RNK, prijenos kopije RNK na ciljno mjesto, transkripcija RNA sekvence natrag u DNK pomoću reverzne transkriptaze i umetanje gena na novu lokaciju DNK lanca genoma. Dva kraja ovih retrotranspozona obično imaju dugačka terminalna ponavljanja sa oko 1000 parova baza, i oni se koriste kao identifikacione karakteristike ovih gena. Ovi geni se lako umnožavaju unutar genoma, a postotak retrotranspozona u ljudskom genomu je oko 50%. To bi moglo biti prilično opasno jer uzročnici virusa AIDS-a, HIV-a i virusa leukemije T-ćelija imaju retrotranspozone u svojim RNA genomima. U stvari, ovi virusi mogu vezati retrotranspozone na bilo koje mjesto lanaca ljudske DNK uz korištenje reverzne transkriptaze i integraze. Enzim integraze funkcionira na isti način kao transpozaza u transpozonima klase II.
Koja je razlika između Transposona i Retrotransposona?
• Transpozoni su geni za skakanje klase II, dok retrotranspozoni spadaju u kategoriju klase I.
• Transpozoni funkcionišu sa enzimom transpozaze, dok retrotranspozoni funkcionišu uz upotrebu dva glavna enzima poznata kao reverzna transkriptaza i integraza.
• Krajevi terminala su mnogo duži u retrotranspozonima nego u transpozonima.
• Transpozoni su izrezani od početka i zalijepljeni na metu; obrnuto, retrotranspozoni se kopiraju iz izvora u RNK i transkribiraju na meti.
• Premještanje retrotranspozona uključuje RNA, ali ne i transpozone.
