Ključna razlika – Ti vs Ri Plasmid
Agrobacterium je bakterijski rod koji uzrokuje nekoliko bolesti kod dikotiledonih biljaka, uključujući bolest krune žuči i bolest dlakavog korijena. Ove dvije bolesti su kodirane genima koji se nalaze u plazmidima (nehromozomska DNK) bakterija. Bakterijska vrsta Agrobacterium tumerfaciens nosi plazmid koji indukuje tumor (Ti plazmid) koji je odgovoran za bolest krune žuči kod biljaka. Agrobacterium rhizogenes je još jedna bakterija koja sadrži plazmid koji indukuje korijen (Ri plazmid) odgovoran za bolest dlakavog korijena u biljkama. Ti i Ri plazmidi su patogeni plazmidi jedinstveni za ovaj bakterijski rod. Ključna razlika između Ti i Ri plazmida je u tome što je Ti plazmid kodiran genima odgovornim za izazivanje bolesti žuči, dok je Ri plazmid kodiran genima za bolest dlakavog korijena kod biljaka. Ovi patogeni plazmidi sadrže genske klastere odgovorne za replikaciju DNK, virulenciju, T-DNK, korištenje opina i konjugaciju. Tokom infekcije, Agrobacterium izrezuje svoju T-DNK (transfer DNK) regiju plazmida i integriše se sa genomom biljke da izazove bolest. Ovu sposobnost iskorištavaju molekularni biolozi za uvođenje važnih gena u biljke u genetskom inženjeringu. Stoga se Agrobacterium smatra važnim oruđem u biotehnologiji i molekularnoj biologiji za uvođenje himerne DNK u različite biljne vrste.
Šta je Ti Plasmid?
Plazmid koji inducira tumor (Ti plazmid) je veći plazmid koji sadrži Agrobacterium tumerfaciens da izazove bolest krune žuči u širokom spektru dvosupnih biljaka. Naziv krunska žučna bolest koristi se zbog stvaranja velikih tumorskih otoka (žuči) na kruni biljaka iznad površine tla zbog prekomjerne proizvodnje biljnih hormona auksina i citokinina od strane A.tumerfaciens. T-DNK regija sadrži gene koji izazivaju tumor. Agrobacterium tumerfaciens ulazi u biljke kroz oštećena biljna tkiva, posebno preko rana, i prenosi svoj dio plazmidne DNK (T-DNK) zajedno sa genima koji izazivaju bolesti u biljne stanice. Ova T-DNK se zatim integriše u genom biljne ćelije i transkribuje. Ekspresija gena uzrokuje stvaranje tumora i povezane promjene u staničnom metabolizmu. Bolest krošnje ne uzrokuje ozbiljne štete na starijim biljkama. Međutim, to smanjuje kvalitetu rasadnika.
Zbog ovog jedinstvenog načina infekcije, A. tumerfaciens se uveliko koristi kao alat u genetskom inženjeringu za proizvodnju transgenih biljaka. Geni koji induciraju tumor su potisnuti, a željeni geni kao što su geni otporni na insekticide i geni otporni na herbicide se ubacuju ili rekombinuju u Ti plazmid koristeći tehnologiju rekombinantne DNK i koriste se u programima oplemenjivanja biljaka. Kada se T-DNK prenese infekcijom A. tumerfaciens na biljke, biljke prirodno stiču efekte željenih gena. Stoga, bilo koja strana DNK umetnuta u T-DNK može se integrirati u genome biljnih stanica uz pomoć prirodnog procesa infekcije ove bakterije.
Slika 01: Ti plazmid A. tumerfaciens
Šta je Ri Plasmid?
Plazmid koji indukuje korijen (Ri plazmid) je plazmid koji nosi bakteriju A. rhizogenes. Ri plazmid je odgovoran za bolest zvanu bolest dlakavog korijena kod dvosupnih biljaka. Infekcija A. rhizogenes uzrokuje ekstenzivno stvaranje adventivnih korijena na ili blizu mjesta infekcije. Geni koji induciraju korijen dlake nalaze se u T-DNK regiji Ri plazmida. Ri plazmid je veći plazmid sličan Ti plazmidu. A. rhizogenes je takođe sposoban da prenese T-DNK region RI plazmida u biljne ćelije i da se integriše sa genomom biljnih ćelija da bi dobio transkripciju koristeći mašineriju biljnih ćelija za izazivanje bolesti. Dakle, Ri plazmidi takođe služe kao važni vektori u biljnom genetskom inženjeringu.
Koja je razlika između Ti i Ri plazmida?
Ti vs Ri Plasmid |
|
| Ti plazmid je kružni i veći plazmid koji ima A. tumerfaciens | Ri plazmid je kružni i veći plazmid koji ima A. rhizogenes |
| Bolest | |
| Ti plazmid kodira gene za bolest krune žuči u biljkama | Ri plazmid kodira gene za bolest dlakavog korijena u biljkama dvosupnica. |
Sažetak – Ti vs Ri plazmidi
Ti i Ri plazmidi su patogeni plazmidi u kojima se nalaze A. tumerfaciencs i A. rhizogenes, respektivno. Ti plazmid ima gene koji izazivaju tumore koji uzrokuju bolest krune žuči u biljkama. Ri plazmid ima gene koji induciraju korijen koji uzrokuje bolest dlakavog korijena u biljkama. Ovo je glavna razlika između Ti i Ri plazmida. Ovi plazmidi se mogu koristiti kao vektori u biljnom genetskom inženjeringu zbog njihove prirodne sposobnosti da prenesu dio svoje plazmidne DNK u genom domaćina. Oni sadrže klastere gena i veličine su otprilike 200 kbp. Svaki plazmid sadrži jedinstvene gene.
