Ključna razlika – tip I protiv restrikcionog enzima tipa II
Restrikcioni enzim, koji se češće naziva restrikcijska endonukleaza, ima sposobnost da cijepa DNK molekule u male fragmente. Ovaj proces cijepanja događa se u blizini ili na posebnom mjestu prepoznavanja molekule DNK zvanom restrikcijsko mjesto. Mjesto za prepoznavanje se obično sastoji od 4-8 parova baza. Ovisno o mjestu cijepanja, restrikcijski enzimi mogu biti četiri različita tipa; Tip I, Tip II, Tip III i Tip IV. Pored mjesta cijepanja, faktori kao što su sastav, zahtjevi za kofaktorima i stanje ciljne sekvence uzimaju se u obzir kada se diferenciraju restrikcijski enzimi u četiri grupe. Tokom cijepanja molekule DNK, mjesto cijepanja može biti ili na samom restrikcijskom mjestu ili na udaljenosti od restriktivnog mjesta. Tokom procesa cijepanja DNK, restrikcijski enzimi stvaraju dva reza kroz svaki od šećerno-fosfatnih okosnica u dvostrukoj spirali DNK. Restrikcijski enzimi se uglavnom nalaze u Achaea i bakterijama. Oni koriste ove enzime kao odbrambeni mehanizam protiv invazivnih virusa. Restrikcijski enzimi cijepaju stranu (patogenu) DNK, ali ne i njenu vlastitu DNK. Njegova vlastita DNK je zaštićena enzimom poznatim kao metiltransferaza koji vrši modifikacije u DNK domaćina i sprječava cijepanje. Restrikcioni enzim tipa I posjeduje mjesto cijepanja koje je udaljeno od mjesta prepoznavanja. Restrikcioni enzimi tipa II cijepaju se unutar samog mjesta prepoznavanja ili na bližoj udaljenosti od njega. Ovo je ključna razlika između restrikcionog enzima tipa I i tipa II.
Šta je restrikcijski enzim tipa I?
Restrikcioni enzimi tipa I su pentamerni proteini sastavljeni od tri višestruke podjedinice: restrikcijske podjedinice, podjedinice metilacije i podjedinice za prepoznavanje sekvence DNK. Ove podjedinice nisu identične. Prvobitno su identificirani u dva različita oblika Escherichia coli. Mjesto cijepanja ovih restrikcijskih enzima prisutno je na različitim nasumično odabranim točkama, obično 1000 parova baza udaljeno od mjesta prepoznavanja. Ovi restrikcijski enzimi zahtijevaju ATP, Mg2+ i S-adenozil-L-metionin za njegovu aktivaciju. Restrikcijski enzimi tipa I posjeduju i metilazu i restrikcijsku aktivnost. Bakterije koriste restrikcijske enzime kao ćelijski odbrambeni mehanizam od invazije virusa. Restrikcijski enzimi cijepaju virusnu DNK i uništavaju je. Ali kako bi se spriječilo cijepanje vlastite DNK domaćina, restrikcijski enzim tipa I pruža zaštitu od metilacije. Ovo modificira DNK domaćina i sprječava cijepanje. Iako su ovi restrikcijski enzimi biohemijski važni, oni se ne koriste široko jer ne pružaju diskretne restriktivne fragmente ili obrasce vezivanja gela.
Šta su restrikcijski enzimi tipa II?
Restrikcioni enzimi tipa II sadrže dvije identične podjedinice unutar svoje strukture. Homodimeri su formirani restrikcijskim enzimima tipa II sa mjestima prepoznavanja. Mjesta prepoznavanja su tipično palindromska i nepodijeljena. Ima dužinu od 4-8 parova baza. Za razliku od tipa I, mjesto cijepanja restrikcionog enzima tipa II je prisutno na mjestu prepoznavanja ili je prisutno na bliskoj udaljenosti od mjesta prepoznavanja.
Slika 02: Restrikcioni enzimi tipa II
Ovi restrikcijski enzimi su biohemijski značajni i široko su dostupni komercijalno. Za njegovu aktivaciju potreban mu je samo Mg2+. Nema aktivnost metilacije i pruža samo funkciju restriktivne aktivnosti. Ovi restrikcijski enzimi se vezuju za molekule DNK kao homodimeri i imaju sposobnost da prepoznaju simetrične DNK sekvence kao i asimetrične sekvence.
Koje su sličnosti između restrikcijskih enzima tipa I i tipa II?
- Restrikcioni enzimi tipa I i tipa II su tipovi enzima su restrikcijske endonukleaze koje uključuju cijepanje molekula DNK na manje fragmente.
- Oba su korisna u molekularno biološkim tehnikama.
Koja je razlika između restrikcionog enzima tipa I i tipa II?
Tip I vs Restrikcioni enzim tipa II |
|
| Restrikcioni enzim tipa I je restrikcijski enzim DNK koji cijepa DNK na nasumične lokacije daleko od mjesta prepoznavanja. | Restrikcioni enzim tipa II je restrikcijski enzim DNK koji cijepa DNK na definiranim pozicijama blizu ili unutar mjesta prepoznavanja. |
| Composition | |
| Restrikcioni enzim tipa I je složen enzim koji se sastoji od tri (03) neidentične podjedinice. | Restrikcioni enzim tipa II je jednostavan enzim koji se sastoji od dvije identične podjedinice. |
| Molekularna težina | |
| Restrikcioni enzim tipa I teži 400 000 d altona. | Restrikcioni enzim tipa II ima raspon težine od 20 000 – 100 000 d altona. |
| Sekvenca dekoltea | |
| Sekvenca cijepanja nije specifična za restrikcijski enzim tipa I. | Restrikcioni enzim tipa II ima specifičnu sekvencu cijepanja. |
| Lokacija dekoltea | |
| Mjesto cijepanja je 1000 nukleotida udaljeno od mjesta prepoznavanja kod restrikcijskih enzima tipa I. | Mjesto cijepanja je prisutno na mjestu prepoznavanja ili na maloj udaljenosti od mjesta prepoznavanja u restrikcijskom enzimu tipa II. |
| Kofaktori za aktivaciju | |
| Restrikcioni enzim tipa I zahteva ATP, Mg2+ i S-adenozil-L-metionin za njegovu aktivaciju. | Potreban je samo Mg2+ za aktiviranje restrikcionog enzima tipa II. |
| Aktivnost metilacije | |
| Enzim tipa I pruža zaštitu DNK metilacijom. | Nema aktivnosti metilacije u restrikcijskim enzimima tipa II. |
| Aktivnost enzima | |
| Restrikcioni enzim tipa I obezbeđuje aktivnosti endonukleaze (restrikcije) i metilacije. | Restrikcioni enzim tipa II pruža samo restriktivnu aktivnost. |
| Primjeri | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Sažetak – Tip I vs Restrikcioni enzim tipa II
Restrikcioni enzimi se nazivaju biološkim makazama koje cijepaju molekule DNK na manje tvari. Restrikcijski enzimi su diferencirani u 04 različite kategorije prema lokaciji mjesta cijepanja u odnosu na mjesto prepoznavanja, prisutnim kofaktorima, sastavu i stanju ciljne sekvence. Za njegovu aktivaciju, restrikcijski enzimi tipa I zahtijevaju ATP, Mg2+, i S-adenozil-L-metionin. Mjesto cijepanja restrikcionog enzima tipa I prisutno je tipično 1000 parova baza dalje od mjesta prepoznavanja i pruža zaštitu DNK metilazom. Restrikcioni enzimi tipa II zahtijevaju samo Mg2+za svoju aktivaciju. Mjesto cijepanja je prisutno na mjestu prepoznavanja ili blizu njega. Nema aktivnost metilacije i široko je dostupan komercijalno. Ovo je razlika između restrikcionog enzima tipa I i restrikcionog enzima tipa II.
Preuzmite PDF verziju tipa I protiv restrikcionog enzima tipa II
Možete preuzeti PDF verziju ovog članka i koristiti ga za vanmrežne svrhe prema napomeni o citatu. Molimo preuzmite PDF verziju ovdje Razlika između restrikcionog enzima tipa I i tipa II.
