Ključna razlika između QTL-a i GWAS-a se oslanja na tip sekvenci korištenih u analizi. QTL koristi lokuse gena za povezivanje za analizu fenotipskih osobina povezanih s poligenskim nasljeđem, dok GWAS koristi čitave sekvence genoma za analizu polimorfizama pojedinačnih nukleotida određenog stanja.
QTL mape i GWAS igraju važnu ulogu u genetskim analizama za različite osobine. Nadalje, oni su važni u analizi različitih stanja bolesti nepoznate etiologije. Osim toga, sekvenciranje igra ključnu ulogu u obje tehnike. Ove tehnike se dalje mogu kombinovati sa drugim tehnikama visoke propusnosti za povećanu tačnost i preciznost.
Šta je QTL?
QTL je skraćenica za kvantitativni lokus osobina. To je dio DNK povezan s fenotipskom osobinom. Općenito, QTL dovodi do poligenih efekata. Distribucija QTL-ova varira, a broj QTL-ova ukazuje na stepen varijacije određene fenotipske osobine. Štaviše, oni obično kodiraju osnovne kontinuirane osobine, a ne diskretne osobine.
Nakon identifikacije QTL regiona, važno je sekvencirati određenu QTL oblast. Štaviše, da bi istraživanja i istraživanje bili laki, sekvenciranje i pohranjivanje podataka o sekvenci uobičajenih QTL regija odvija se uz uključenje bioinformatike. Ovu tehniku nazivamo QTL mapiranjem. Nakon toga, baza podataka se gradi sa sekvencama QTL regiona.
Slika 01: QTL skeniranje
Dalje, primjene QTL sekvenci se uglavnom oslanjaju na BLAST alat, gdje se može odrediti sličnost sekvenci. Važan je u zaključivanju odnosa između organizama. Nadalje, važno je u određivanju složenosti određenog poligenskog fenotipa. Takođe određuje evoluciju određene osobine.
Trenutno se QTL analiza kombinuje sa drugim tehnikama visoke propusnosti kao što su DNK mikronizovi. Ovo je važno u analizi ekspresije fenotipa. Trenutno su naučnici veoma zainteresovani za razvoj QTL baze podataka jer su QTL regioni odgovorni za mnoge važne osobine različitih vrsta.
Šta je GWAS?
GWAS je skraćenica za Genome Wide Association Study. Također se odnosi na studije asocijacije cijelog genoma. Ove studije se uglavnom fokusiraju na opservacijske studije. Analizira genetske varijante različitih individua koje su obično povezane sa određenom osobinom. Štaviše, cijeli genom je važan za GWAS analizu.
Slika 02: GWAS
GWAS je važan alat u analizi polimorfizama pojedinačnih nukleotida povezanih sa različitim bolestima. Ovo je također komparativna studija različitih polimorfizama pojedinačnih nukleotida u širokoj populaciji. Osim toga, uzorak istraživanja GWAS je veoma visok; stoga, također uzima format kohortne studije poprečnog presjeka.
Štaviše, prva GWAS studija sprovedena je u vezi sa infarktom miokarda i analiziranjem gena povezanih sa infarktom miokarda. Trenutno, GWAS igra važnu ulogu u određivanju genetske pozadine složenih bolesti nepoznate etiologije.
Koje su sličnosti između QTL-a i GWAS-a?
- Oni se oslanjaju na podatke o DNK sekvencama za analizu.
- Oba su povezana sa genetskom pozadinom različitih likova.
- Štaviše, oni zahtijevaju bioinformatičke alate da bi zaključili i interpretirali rezultate.
- Rade se na velikoj populaciji.
Koja je razlika između QTL-a i GWAS-a?
QTL analizira fenotipske osobine povezane s poligenskim nasljeđivanjem koristeći povezane genske lokuse dok GWAS analizira polimorfizme pojedinačnih nukleotida određenog stanja koristeći sekvence cijelog genoma. Dakle, ovo je ključna razlika između QTL-a i GWAS-a. QTL mapiranje je relativno manje složena tehnika od GWAS jer zahtijeva sekvenciranje cijelog genoma.
Infografika ispod sumira razliku između QTL-a i GWAS-a u obliku tabele.
Sažetak – QTL vs GWAS
QTL mapiranje i GWAS igraju glavnu ulogu u određivanju genetske pozadine različitih fenotipskih osobina. Oni također pomažu u analizi genetske pozadine različitih bolesti. QTL mapiranje mapira gene veze odgovorne za kontinuirane osobine, a također uključuje mapiranje gena poligenskog nasljeđivanja. GWAS se, s druge strane, odvija uz analizu cijelog genoma na polimorfizme pojedinačnih nukleotida. Osim toga, ovo se dešava u većoj populaciji. Dakle, ovo je sažetak razlike između QTL-a i GWAS-a.
