Ključna razlika između fikocijanina i alofikocijanina je u tome što fikocijanin apsorbuje i emituje na kraćim talasnim dužinama od alofikocijanina.
Phycobiliproteini su porodica proteina rastvorljivih u vodi koji su prisutni u cijanobakterijama i određenim vrstama algi. Fikocijanin i alofikocijanin su dva glavna člana ove porodice.
Šta je Phycocyanin?
Phycocyanin je pigmentno-proteinski kompleks iz porodice fikobiliproteina koji sakuplja svjetlost. Ostali važni članovi ove porodice uključuju alofikocijanin i fikoeritrin. Ovaj pigment je pomoćni pigment za hlorofil. Općenito, svi fikobiliproteini su kompleksi topivi u vodi koji ne mogu postojati unutar membrana poput karotenoida. Umjesto da postoje u membranama, ovi pigmenti imaju tendenciju da se agregiraju, formirajući klastere koji se mogu zalijepiti za membrane poznate kao fikobilizomi.
Slika 01: Ekstrahovani fikocijaninski pigmenti (iz cijanobakterija)
Možemo primetiti da fikocijanin ima karakterističnu svetloplavu boju koja može da apsorbuje narandžastu i crvenu svetlost (oko 620 nm) i može da emituje fluorescenciju (oko 650 nm). Ovaj pigment boje možemo pronaći u cijanobakterijama, a naziv “Phycocyanin” dolazi od grčkog značenja za “Phyco” što se odnosi na “alge” i sufiksa “cijanin” iz grčkog značenja za “Kyanos” što se odnosi na “tamnoplavo”.
Tipično, molekuli fikocijanina dijele zajedničku strukturu sa svim fikobiliproteinima. Kada se razmatra struktura ovog pigmenta, ona počinje sastavljanjem fikobiliproteinskih monomera. Ovi monomeri su heterodimeri koji se sastoje od alfa i beta podjedinica sa svojim odgovarajućim hromoforima. Hromofori i podjedinice su spojene zajedno pomoću tioetarske hemijske veze.
Podjedinice strukture Phycocyanin tipično sadrže osam alfa-heliksa. Monomerne strukture imaju tendenciju da se spontano agregiraju, formirajući prstenaste trimere sa rotacijskom simetrijom i centralnim kanalom. Štaviše, trimeri imaju tendenciju da se agregiraju u parove, formirajući heksamere koji su potpomognuti dodatnim linker proteinima. Stoga, svaki fikobilizomski štap sadrži dva ili više fikocijaninskih heksamera.
Šta je alofikocijanin?
Alofikocijanin je proteinski molekul koji dolazi iz familije fikobiliproteina i pomoćni je pigment hlorofilu. Ostali članovi ove porodice fikobiliproteina koji sakuplja svjetlost uključuju fikocijanin, fikoeritrin i fikoeritrocijanin. Alofikocijaninski pigmenti mogu apsorbirati i emitovati crvenu svjetlost, a ovaj pigment lako možemo pronaći u cijanobakterijama i crvenim algama.
Slika 02: Izgled alofikocijanina na dijagramu
Možemo izolovati alofikocijanin iz različitih vrsta crvenih ili plavo-zelenih algi. Ove alge proizvode malo drugačije oblike molekula. Generalno, molekul alofikocijanina sadrži dvije različite podjedinice koje se nazivaju alfa i beta podjedinica. Svaka podjedinica ima jedan fikocijanobilinski hromofor.
Postoje različite primjene alofikocijanina; mnogi instrumenti su razvijeni posebno za alofikocijanin. Na primjer, ova komponenta se obično koristi u imunotestovima, uključujući FACS, protočnu citometriju, itd.
Koje su sličnosti između fikocijanina i alofikocijanina?
- Fikocijanin i alofikocijanin su proteini rastvorljivi u vodi
- Oba su uključena u porodicu fikobiliproteina.
Koja je razlika između fikocijanina i alofikocijanina?
Phycobiliproteini su porodica proteina rastvorljivih u vodi koji su prisutni u cijanobakterijama i određenim vrstama algi. Fikocijanin i alofikocijanin su dva glavna člana ove porodice. Ključna razlika između fikocijanina i alofikocijanina je u tome što fikocijanin apsorbuje i emituje na kraćim talasnim dužinama od alofikocijanina.
U nastavku infografike navodi se više razlika između fikocijanina i alofikocijanina u obliku tabele za usporedbu.
Sažetak – Phycocyanin vs Allophycocyanin
Phycobiliproteini su porodica proteina rastvorljivih u vodi koji su prisutni u cijanobakterijama i određenim vrstama algi. Fikocijanin i alofikocijanin su dva glavna člana ove porodice. Ključna razlika između fikocijanina i alofikocijanina je u tome što fikocijanin apsorbuje i emituje na kraćim talasnim dužinama od alofikocijanina.
