Ključna razlika između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze je u tome što je restrikcijska endonukleaza enzim nukleaze koji prepoznaje specifičnu sekvencu DNK i cijepa DNK unutar ili u blizini te sekvence, dok je egzonukleaza enzim nukleaza koji cijepa nukleotide u polinukleotid sa 5' kraja ili 3' kraja jedan po jedan.
Nukleaze su enzimi koji cijepaju fosfodiestarske veze između nukleotida nukleinskih kiselina. U živim organizmima, oni su suštinski alati za mnoge aspekte popravke DNK u ćeliji. Defekti ovih enzima mogu uzrokovati genetsku nestabilnost i imunodeficijencije. Restrikcijske nukleaze su specifične nukleaze čije funkcioniranje ovisi o specifičnoj sekvenci nukleotida. Primjer je restrikcijska endonukleaza. Postoji osnovna klasifikacija za nukleaze zasnovana na lokusu aktivnosti, kao što su endonukleaza i egzonukleaza. Endonukleaza razgrađuje regije u sredini ciljne DNK molekule. Egzonukleaza razgrađuje nukleinske kiseline sa krajeva. Dakle, restrikcijska endonukleaza i egzonukleaza su dvije vrste nukleaznih enzima.
Šta je restrikcijska endonukleaza?
Restrikciona endonukleaza je enzim nukleaze koji prepoznaje specifičnu sekvencu DNK i cijepa DNK unutar ili u blizini te sekvence. Specifična sekvenca DNK poznata je kao restrikcijsko mjesto. Također se naziva restrikcijski enzim ili restriktaza. Restrikcijska endonukleaza je vrlo specifičan enzim. To je jedna klasa šire grupe enzima endonukleaze. Restrikcione endonukleaze se obično klasifikuju u pet tipova, koji se razlikuju po svojoj strukturi i sposobnosti da preseku DNK supstrat na mestu prepoznavanja. Pet tipova su tip I, tip II, tip III, tip IV i tip V.
Slika 01: Restrikcijska endonukleaza
Restrikcione endonukleaze se obično nalaze u bakterijama i arhejama. Oni pružaju odbrambeni mehanizam za bakterije od virusa. Postoji više od 3600 poznatih restrikcijskih endonukleaza. Predstavljaju preko 250 različitih specifičnosti. Više od 3000 njih je detaljno proučeno. Štaviše, više od 800 njih je dostupno komercijalno.
Šta je egzonukleaza?
Egzonukleaza je nukleazni enzim koji cijepa nukleotide u polinukleotidu sa 5' kraja ili 3' kraja jedan po jedan. To se događa reakcijom hidrolize koja prekida fosfodiestarske veze između nukleotida na kraju. Eukarioti i prokarioti imaju tri vrste egzonukleaza. Ove egzonukleaze su uključene u normalan promet mRNA. To su 5’ do 3’ egzonukleaza (Xrn1), 3’ do 5’ egzonukleaza i poli-A specifična 3’ do 5’ egzonukleaza. 5’ do 3’ egzonukleaza je ovisni dekapirajući protein. 3’ do 5’ egzonukleaza je nezavisan protein. Poly A specifična 3’ do 5’ egzonukleaza je također poznata kao poli-A specifična ribonukleaza uključena u egzonukleolitičku degradaciju poli-A repa.
Slika 02: Egzonukleaza
I kod arheja i kod eukariota, razgradnju RNK vrši kompleks egzozoma sa više proteina koji se sastoji od 3’ do 5’ egzoribonukleaza.
Koje su sličnosti između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze?
- Restrikciona endonukleaza i egzonukleaza su dvije vrste nukleaznih enzima.
- Oba enzima režu DNK molekule.
- Ovi enzimi se nalaze u prokariotima.
- Oni su proteini.
Koja je razlika između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze?
Restrikciona endonukleaza je enzim nukleaze koji prepoznaje specifičnu sekvencu DNK i cijepa DNK unutar ili u blizini te sekvence, dok je egzonukleaza enzim nukleaza koji cijepa nukleotide u polinukleotidu sa 5' kraja ili 3' jedan po jedan. Dakle, ovo je ključna razlika između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze. Štaviše, restrikcijska endonukleaza se nalazi samo kod prokariota, dok se egzonukleaza nalazi i kod prokariota i kod eukariota.
Sljedeća infografika navodi razlike između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze u tabelarnom obliku za usporedbu.
Sažetak – restrikcijska endonukleaza vs egzonukleaza
Nukleaze su enzimi koji razbijaju fosfodiestarske veze između nukleotida nukleinskih kiselina. Restrikcijska endonukleaza i egzonukleaza su dvije vrste nukleaznih enzima. Restrikcijska endonukleaza je enzim nukleaze koji prepoznaje specifičnu sekvencu DNK i cijepa DNK unutar ili u blizini te sekvence. Egzonukleaza je nukleazni enzim koji cijepa nukleotide u polinukleotidu sa njihovog 5’ kraja ili 3’ kraja jedan po jedan. Dakle, ovo rezimira razliku između restrikcijske endonukleaze i egzonukleaze.
