Ključna razlika između sigma faktora i rho faktora je u tome što je sigma faktor protein potreban za iniciranje transkripcije u bakterijama dok je rho faktor protein potreban za završetak transkripcije u bakterijama.
Sigma faktor i rho faktor su dva važna faktora za transkripciju bakterija. Bakterijska transkripcija je proces u kojem se dio bakterijske DNK kopira u novonastalu lanac mRNA (messenger RNA). Ovaj proces katalizira enzim poznat kao RNA polimeraza. Bakterije se u velikoj mjeri oslanjaju na transkripciju i translaciju kako bi pravilno odgovorile na svoje okruženje. Bakterijska RNA polimeraza se sastoji od jezgre i holoenzimske strukture. Jezgro sadrži podjedinice β, β′, α i 2ω dok holoenzim sadrži sigma faktor. Štaviše, pomoćni faktor za RNA polimerazu poznat kao rho faktor je takođe veoma važan za transkripciju bakterija.
Šta je Sigma faktor?
Sigma faktor ili faktor specifičnosti je protein potreban za iniciranje transkripcije u bakterijama. To je faktor inicijacije bakterijske transkripcije. Ovaj faktor omogućava vezivanje enzima RNA polimeraze za specifičan region DNK koji se zove region promotora tokom transkripcije. Sigma faktor je normalno homologan arhealnom transkripcionom faktoru B i eukariotskom transkripcionom faktoru TF11B. Štaviše, specifični sigma faktor datog gena varira u zavisnosti od gena i signala okoline. Promotori se biraju pomoću RNA polimeraze u zavisnosti od sigma faktora koji je s njim povezan.
Slika 01: Sigma faktor
Sigma faktor se također može naći u hloroplastu biljaka kao dio plastid-kodirane polimeraze (PEP). Sigma faktor i RNA polimeraza zajedno su poznati kao holoenzim RNA polimeraze. Molekularna težina sigma faktora je oko 70 kDa. Nakon iniciranja transkripcije, sigma faktor se odvaja od kompleksa. Zatim RNA polimeraza nastavlja elongaciju sve dok se transkripcija ne završi.
Šta je Rho faktor?
Rho faktor je prokariotski protein uključen u završetak transkripcije. Rho faktor se obično vezuje za mjesto pauze terminatora transkripcije. Ovo mjesto je izloženo područje jednolančane RNK u blizini otvorenog okvira za čitanje kod sekvenci siromašnih guaninom bogatih citozinom. To je esencijalni protein za transkripciju u prokariota. Kod Escherichia coli, rho faktor je približno 274,6 kDa heksamera identičnih podjedinica. Svaka podjedinica ima domen za vezivanje RNK i domen hidrolize ATP-a. Štaviše, funkcija rho faktora je aktivnost helikaze.
Slika 02: Rho faktor
Rho faktor se vezuje za RNA molekul i zatim koristi svoju ATPazu aktivnost da obezbedi energiju za translociranje RNA molekula. Rho faktor vrši translokaciju sve dok ne dođe do RNA-DNK spiralnog regiona, gde odmotava hibridnu (RNA-DNK) dupleksnu strukturu. Ovaj proces pauzira RNA polimerazu na mjestu terminacije završavajući proces transkripcije.
Koje su sličnosti između Sigma faktora i Rho faktora?
- Sigma faktor i rho faktor su dva važna faktora za transkripciju bakterija.
- Oba su prisutna samo kod prokariota.
- Oni su proteini sastavljeni od aminokiselina.
- Oba su proteini koji vezuju nukleinske kiseline.
- Prokarioti se u velikoj mjeri oslanjaju na ove faktore kako bi generirali mRNA koja može napraviti posebne proteine i pomoći im da reaguju specifično na svoje okruženje.
Koja je razlika između Sigma faktora i Rho faktora?
Sigma faktor je protein potreban za iniciranje transkripcije u bakterijama, dok je rho faktor protein potreban za završetak transkripcije u bakterijama. Dakle, ovo je ključna razlika između sigma faktora i rho faktora. Nadalje, sigma faktor je protein koji vezuje DNK, dok je rho faktor protein koji vezuje RNK.
Infografika ispod predstavlja razlike između sigma faktora i rho faktora u tabelarnom obliku za usporedbu.
Sažetak – Sigma faktor vs Rho faktor
Transkripcija je proces u kojem se informacije u DNK kopiraju u novi molekul koji se zove mRNA (messenger RNA). Ova m-RNA je na kraju uključena u proizvodnju specifičnog proteina. Sigma faktor i rho faktor su dva važna faktora za transkripciju bakterija. Oni su proteini. Sigma faktor učestvuje u pokretanju transkripcije kod bakterija. Rho faktor je odgovoran za prekid transkripcije kod bakterija. Dakle, ovo je sažetak razlike između sigma faktora i rho faktora.
