Ključna razlika između Rho zavisnog i Rho nezavisnog terminacije je u tome što se u Rho zavisnom terminaciji, Rho faktor vezuje za transkript i prekida transkripciju razbijanjem vodoničnih veza između šablona i transkripta, dok Rho nezavisni terminacija završava transkripciju tako što stvarajući strukturu ukosnice, a zatim U bogatu regiju u transkriptu.
Transkripcija je jedna od dvije faze ekspresije gena. To je proces koji proizvodi mRNA sekvencu iz genetske informacije skrivene u sekvenci DNK gena. Transkripcija se odvija kroz tri koraka: inicijacija, elongacija i terminacija. Enzim RNA polimeraza se vezuje za promotorsku sekvencu gena i počinje da katalizira sintezu RNA lanca. Dok se ne pronađe terminatorska sekvenca, RNA polimeraza dodaje nukleotide i gradi RNK lanac. Kod prokariota, terminacija se događa kroz dvije glavne strategije terminacije: Rho zavisan termin i Rho nezavisan termin. Rho faktor je protein koji ima aktivnost helikaze.
Šta je raskid ovisno o Rho?
Rho zavisna terminacija je jedan od dva tipa strategije terminacije transkripcije koja se javlja kod prokariota. Rho faktor je protein koji ima aktivnost helikaze.
Slika 01: Rho-ovisni prekid
Rho protein se veže za RNA transkript i kreće se duž RNA polimeraze u smjeru 5’-3’, podstičući disocijaciju vodoničnih veza između DNK šablona i RNA transkripta. Kada Rho faktor dosegne transkripcijski balon, on razdvaja DNK/RNA hibrid i oslobađa transkript iz transkripcionog balona. Kada se to dogodi, transkripcija se prekida.
Šta je Rho Independent Termination?
Rho nezavisna terminacija je druga strategija koja prekida prokariotsku transkripciju. Obično terminatorski region ima obrnutu sekvencu ponavljanja. Odmah nakon obrnute sekvence ponavljanja, postoji regija bogata adeninom (AAAA). Kada se RNA polimeraza kreće naprijed, ona proizvodi mRNA sekvencu. Pošto su ta dva regiona komplementarna u regionu invertovane sekvence ponavljanja, ona formira strukturu petlje za ukosnicu zbog vodonične veze. Sljedeća regija će biti regija bogata U. Struktura ukosnice prekida aktivnost RNA polimeraze.
Slika 02: Rho nezavisni prekid
Štaviše, u regionima bogatim U, postoje slabe interakcije između U baza transkripta i A baza šablona. Ove slabe veze Adenin-Uracil destabilizuju DNK šablon i RNK transkript i razdvajaju jedna drugu. Na kraju, transkript se oslobađa sa stranice za transkripciju.
Koje su sličnosti između Rho zavisnog i Rho nezavisnog prekida?
- Rho ovisan i Rho nezavisan termin su dvije glavne strategije prestanka koje se nalaze kod prokariota.
- Oba obrasca oslobađaju transkript iz DNK šablona kako bi prekinuli transkripciju.
Koja je razlika između Rho zavisnog i Rho nezavisnog prekida?
Rho zavisan završetak je posredovan Rho proteinom, dok se Rho nezavisan završetak dešava formiranjem strukture ukosne petlje. Dakle, ovo je ključna razlika između Rho zavisnog i Rho nezavisnog prekida. Nadalje, Rho protein koristi ATP energiju dok Rho neovisni završetak ne uključuje Rho protein i ne koristi ATP energiju. Stoga, ovo je također značajna razlika između Rho ovisnog i Rho neovisnog prekida.
Infografika ispod pokazuje više poređenja vezanih za razliku između Rho zavisnog i Rho nezavisnog prekida.
Sažetak – Rho ovisni vs Rho neovisni prekid
Rho zavisna i Rho nezavisna terminacija su dva glavna mehanizma terminacije transkripcije koja se javljaju kod prokariota. Rho protein je odgovoran za terminaciju transkripcije kod Rho zavisne terminacije. Nasuprot tome, Rho neovisni završetak događa se formiranjem strukture ukosne petlje. Dakle, ovo je ključna razlika između Rho zavisnog i Rho nezavisnog prekida.
